Protein–RNA interactions for Protein: H3BSH0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 61 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BSH0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
H3BSH0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H3BSH0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
H3BSH0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H3BSH0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BSH0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3BSH0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3BSH0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H3BSH0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H3BSH0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H3BSH0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H3BSH0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H3BSH0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H3BSH0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H3BSH0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
H3BSH0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
H3BSH0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BSH0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3BSH0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3BSH0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BSH0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BSH0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3BSH0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BSH0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3BSH0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BSH0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3BSH0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3BSH0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BSH0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BSH0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3BSH0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BSH0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3BSH0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BSH0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BSH0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BSH0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BSH0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3BSH0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BSH0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BSH0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3BSH0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BSH0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3BSH0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BSH0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BSH0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BSH0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3BSH0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H3BSH0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3BSH0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BSH0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BSH0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BSH0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BSH0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
H3BSH0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BSH0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3BSH0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3BSH0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
H3BSH0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3BSH0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BSH0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BSH0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BSH0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3BSH0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BSH0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3BSH0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H3BSH0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
H3BSH0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
H3BSH0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3BSH0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3BSH0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
H3BSH0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3BSH0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
H3BSH0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3BSH0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3BSH0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3BSH0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
H3BSH0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BSH0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BSH0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BSH0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H3BSH0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H3BSH0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BSH0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H3BSH0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H3BSH0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
H3BSH0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BSH0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H3BSH0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BSH0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BSH0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H3BSH0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BSH0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H3BSH0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BSH0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BSH0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H3BSH0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BSH0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
H3BSH0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BSH0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H3BSH0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms