Protein–RNA interactions for Protein: E5RHQ5

NPIPB11, Nuclear pore complex-interacting protein family member B11, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11E5RHQ5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB11E5RHQ5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB11E5RHQ5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPIPB11E5RHQ5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB11E5RHQ5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPIPB11E5RHQ5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB11E5RHQ5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPIPB11E5RHQ5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB11E5RHQ5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NPIPB11E5RHQ5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPB11E5RHQ5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPB11E5RHQ5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPB11E5RHQ5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPB11E5RHQ5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPB11E5RHQ5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPB11E5RHQ5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPB11E5RHQ5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPB11E5RHQ5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB11E5RHQ5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPB11E5RHQ5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPB11E5RHQ5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPB11E5RHQ5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPB11E5RHQ5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB11E5RHQ5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB11E5RHQ5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPB11E5RHQ5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPB11E5RHQ5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPB11E5RHQ5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPB11E5RHQ5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB11E5RHQ5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB11E5RHQ5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPB11E5RHQ5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPB11E5RHQ5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB11E5RHQ5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB11E5RHQ5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPB11E5RHQ5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPB11E5RHQ5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB11E5RHQ5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPB11E5RHQ5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB11E5RHQ5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB11E5RHQ5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB11E5RHQ5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPB11E5RHQ5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPIPB11E5RHQ5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB11E5RHQ5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB11E5RHQ5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB11E5RHQ5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPIPB11E5RHQ5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPB11E5RHQ5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPB11E5RHQ5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPIPB11E5RHQ5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB11E5RHQ5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB11E5RHQ5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPIPB11E5RHQ5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB11E5RHQ5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB11E5RHQ5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPIPB11E5RHQ5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPIPB11E5RHQ5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB11E5RHQ5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB11E5RHQ5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB11E5RHQ5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB11E5RHQ5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB11E5RHQ5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB11E5RHQ5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB11E5RHQ5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NPIPB11E5RHQ5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPIPB11E5RHQ5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NPIPB11E5RHQ5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPIPB11E5RHQ5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NPIPB11E5RHQ5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB11E5RHQ5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB11E5RHQ5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB11E5RHQ5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB11E5RHQ5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB11E5RHQ5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NPIPB11E5RHQ5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NPIPB11E5RHQ5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB11E5RHQ5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NPIPB11E5RHQ5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NPIPB11E5RHQ5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB11E5RHQ5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NPIPB11E5RHQ5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPB11E5RHQ5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NPIPB11E5RHQ5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
NPIPB11E5RHQ5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB11E5RHQ5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB11E5RHQ5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB11E5RHQ5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NPIPB11E5RHQ5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB11E5RHQ5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NPIPB11E5RHQ5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPB11E5RHQ5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPB11E5RHQ5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPB11E5RHQ5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NPIPB11E5RHQ5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NPIPB11E5RHQ5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB11E5RHQ5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB11E5RHQ5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB11E5RHQ5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NPIPB11E5RHQ5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms