Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACOD1A6NK06 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ACOD1A6NK06 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACOD1A6NK06 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACOD1A6NK06 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACOD1A6NK06 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACOD1A6NK06 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACOD1A6NK06 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACOD1A6NK06 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACOD1A6NK06 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACOD1A6NK06 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACOD1A6NK06 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACOD1A6NK06 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACOD1A6NK06 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACOD1A6NK06 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACOD1A6NK06 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ACOD1A6NK06 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACOD1A6NK06 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACOD1A6NK06 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACOD1A6NK06 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACOD1A6NK06 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACOD1A6NK06 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ACOD1A6NK06 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACOD1A6NK06 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACOD1A6NK06 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACOD1A6NK06 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACOD1A6NK06 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACOD1A6NK06 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACOD1A6NK06 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACOD1A6NK06 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACOD1A6NK06 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACOD1A6NK06 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ACOD1A6NK06 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACOD1A6NK06 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACOD1A6NK06 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACOD1A6NK06 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACOD1A6NK06 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACOD1A6NK06 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACOD1A6NK06 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACOD1A6NK06 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACOD1A6NK06 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACOD1A6NK06 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACOD1A6NK06 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACOD1A6NK06 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACOD1A6NK06 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACOD1A6NK06 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACOD1A6NK06 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACOD1A6NK06 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACOD1A6NK06 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACOD1A6NK06 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACOD1A6NK06 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACOD1A6NK06 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACOD1A6NK06 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACOD1A6NK06 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACOD1A6NK06 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACOD1A6NK06 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACOD1A6NK06 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACOD1A6NK06 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACOD1A6NK06 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACOD1A6NK06 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACOD1A6NK06 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACOD1A6NK06 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACOD1A6NK06 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACOD1A6NK06 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACOD1A6NK06 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACOD1A6NK06 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACOD1A6NK06 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACOD1A6NK06 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACOD1A6NK06 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACOD1A6NK06 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACOD1A6NK06 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACOD1A6NK06 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACOD1A6NK06 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACOD1A6NK06 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACOD1A6NK06 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACOD1A6NK06 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACOD1A6NK06 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACOD1A6NK06 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACOD1A6NK06 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACOD1A6NK06 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACOD1A6NK06 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACOD1A6NK06 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACOD1A6NK06 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACOD1A6NK06 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACOD1A6NK06 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACOD1A6NK06 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACOD1A6NK06 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ACOD1A6NK06 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACOD1A6NK06 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACOD1A6NK06 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACOD1A6NK06 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACOD1A6NK06 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACOD1A6NK06 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACOD1A6NK06 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACOD1A6NK06 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACOD1A6NK06 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACOD1A6NK06 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACOD1A6NK06 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACOD1A6NK06 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACOD1A6NK06 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms