Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRP5LA4QPB2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRP5LA4QPB2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRP5LA4QPB2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRP5LA4QPB2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRP5LA4QPB2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRP5LA4QPB2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRP5LA4QPB2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRP5LA4QPB2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRP5LA4QPB2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRP5LA4QPB2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRP5LA4QPB2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRP5LA4QPB2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRP5LA4QPB2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP5LA4QPB2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRP5LA4QPB2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRP5LA4QPB2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP5LA4QPB2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP5LA4QPB2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP5LA4QPB2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP5LA4QPB2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRP5LA4QPB2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5LA4QPB2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRP5LA4QPB2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP5LA4QPB2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRP5LA4QPB2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRP5LA4QPB2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRP5LA4QPB2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP5LA4QPB2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP5LA4QPB2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5LA4QPB2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5LA4QPB2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5LA4QPB2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5LA4QPB2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5LA4QPB2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRP5LA4QPB2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP5LA4QPB2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP5LA4QPB2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP5LA4QPB2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5LA4QPB2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5LA4QPB2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5LA4QPB2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP5LA4QPB2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP5LA4QPB2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP5LA4QPB2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP5LA4QPB2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRP5LA4QPB2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRP5LA4QPB2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRP5LA4QPB2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRP5LA4QPB2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRP5LA4QPB2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP5LA4QPB2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP5LA4QPB2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRP5LA4QPB2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP5LA4QPB2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP5LA4QPB2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP5LA4QPB2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP5LA4QPB2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRP5LA4QPB2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP5LA4QPB2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP5LA4QPB2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP5LA4QPB2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP5LA4QPB2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRP5LA4QPB2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRP5LA4QPB2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP5LA4QPB2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP5LA4QPB2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRP5LA4QPB2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP5LA4QPB2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRP5LA4QPB2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRP5LA4QPB2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRP5LA4QPB2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRP5LA4QPB2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRP5LA4QPB2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRP5LA4QPB2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRP5LA4QPB2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRP5LA4QPB2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRP5LA4QPB2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRP5LA4QPB2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRP5LA4QPB2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRP5LA4QPB2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRP5LA4QPB2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRP5LA4QPB2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRP5LA4QPB2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRP5LA4QPB2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms