Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVI7

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVI7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A1B0GVI7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A1B0GVI7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A1B0GVI7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A1B0GVI7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A1B0GVI7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A1B0GVI7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A1B0GVI7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A1B0GVI7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A1B0GVI7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A1B0GVI7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A1B0GVI7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A1B0GVI7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A1B0GVI7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A1B0GVI7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A1B0GVI7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A1B0GVI7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A1B0GVI7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A1B0GVI7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A1B0GVI7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A1B0GVI7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A1B0GVI7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A1B0GVI7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A1B0GVI7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A1B0GVI7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A1B0GVI7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A1B0GVI7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A1B0GVI7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A1B0GVI7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A1B0GVI7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A1B0GVI7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A1B0GVI7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A1B0GVI7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A1B0GVI7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A1B0GVI7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A1B0GVI7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A1B0GVI7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
A0A1B0GVI7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A1B0GVI7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A1B0GVI7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A1B0GVI7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A1B0GVI7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A1B0GVI7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A1B0GVI7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A1B0GVI7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A1B0GVI7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A1B0GVI7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A1B0GVI7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A1B0GVI7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A1B0GVI7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A1B0GVI7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A1B0GVI7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A1B0GVI7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A1B0GVI7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A1B0GVI7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A1B0GVI7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1B0GVI7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1B0GVI7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1B0GVI7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A1B0GVI7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A1B0GVI7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1B0GVI7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1B0GVI7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A1B0GVI7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A1B0GVI7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A1B0GVI7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1B0GVI7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1B0GVI7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1B0GVI7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1B0GVI7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1B0GVI7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A1B0GVI7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1B0GVI7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1B0GVI7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1B0GVI7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1B0GVI7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1B0GVI7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1B0GVI7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1B0GVI7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1B0GVI7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A1B0GVI7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A1B0GVI7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A1B0GVI7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1B0GVI7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1B0GVI7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A1B0GVI7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1B0GVI7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1B0GVI7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1B0GVI7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A1B0GVI7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1B0GVI7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A1B0GVI7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A1B0GVI7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A1B0GVI7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A1B0GVI7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A1B0GVI7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GVI7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A1B0GVI7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GVI7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A1B0GVI7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms