Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS05

TRBV5-7, T-cell receptor beta variable 5-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-7A0A0A0MS05 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBV5-7A0A0A0MS05 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBV5-7A0A0A0MS05 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBV5-7A0A0A0MS05 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBV5-7A0A0A0MS05 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBV5-7A0A0A0MS05 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRBV5-7A0A0A0MS05 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRBV5-7A0A0A0MS05 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBV5-7A0A0A0MS05 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBV5-7A0A0A0MS05 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBV5-7A0A0A0MS05 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBV5-7A0A0A0MS05 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRBV5-7A0A0A0MS05 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRBV5-7A0A0A0MS05 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRBV5-7A0A0A0MS05 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRBV5-7A0A0A0MS05 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRBV5-7A0A0A0MS05 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRBV5-7A0A0A0MS05 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRBV5-7A0A0A0MS05 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRBV5-7A0A0A0MS05 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRBV5-7A0A0A0MS05 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRBV5-7A0A0A0MS05 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRBV5-7A0A0A0MS05 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRBV5-7A0A0A0MS05 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRBV5-7A0A0A0MS05 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRBV5-7A0A0A0MS05 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRBV5-7A0A0A0MS05 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRBV5-7A0A0A0MS05 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRBV5-7A0A0A0MS05 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRBV5-7A0A0A0MS05 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRBV5-7A0A0A0MS05 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRBV5-7A0A0A0MS05 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRBV5-7A0A0A0MS05 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRBV5-7A0A0A0MS05 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRBV5-7A0A0A0MS05 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRBV5-7A0A0A0MS05 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRBV5-7A0A0A0MS05 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRBV5-7A0A0A0MS05 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRBV5-7A0A0A0MS05 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRBV5-7A0A0A0MS05 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRBV5-7A0A0A0MS05 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRBV5-7A0A0A0MS05 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRBV5-7A0A0A0MS05 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRBV5-7A0A0A0MS05 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRBV5-7A0A0A0MS05 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRBV5-7A0A0A0MS05 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRBV5-7A0A0A0MS05 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRBV5-7A0A0A0MS05 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRBV5-7A0A0A0MS05 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRBV5-7A0A0A0MS05 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRBV5-7A0A0A0MS05 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRBV5-7A0A0A0MS05 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRBV5-7A0A0A0MS05 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRBV5-7A0A0A0MS05 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRBV5-7A0A0A0MS05 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRBV5-7A0A0A0MS05 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRBV5-7A0A0A0MS05 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRBV5-7A0A0A0MS05 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRBV5-7A0A0A0MS05 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRBV5-7A0A0A0MS05 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBV5-7A0A0A0MS05 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBV5-7A0A0A0MS05 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRBV5-7A0A0A0MS05 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRBV5-7A0A0A0MS05 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRBV5-7A0A0A0MS05 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRBV5-7A0A0A0MS05 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRBV5-7A0A0A0MS05 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRBV5-7A0A0A0MS05 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRBV5-7A0A0A0MS05 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRBV5-7A0A0A0MS05 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRBV5-7A0A0A0MS05 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRBV5-7A0A0A0MS05 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRBV5-7A0A0A0MS05 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRBV5-7A0A0A0MS05 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRBV5-7A0A0A0MS05 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRBV5-7A0A0A0MS05 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRBV5-7A0A0A0MS05 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRBV5-7A0A0A0MS05 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRBV5-7A0A0A0MS05 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRBV5-7A0A0A0MS05 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRBV5-7A0A0A0MS05 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRBV5-7A0A0A0MS05 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRBV5-7A0A0A0MS05 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRBV5-7A0A0A0MS05 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRBV5-7A0A0A0MS05 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRBV5-7A0A0A0MS05 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBV5-7A0A0A0MS05 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRBV5-7A0A0A0MS05 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRBV5-7A0A0A0MS05 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV5-7A0A0A0MS05 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV5-7A0A0A0MS05 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV5-7A0A0A0MS05 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV5-7A0A0A0MS05 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRBV5-7A0A0A0MS05 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRBV5-7A0A0A0MS05 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV5-7A0A0A0MS05 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV5-7A0A0A0MS05 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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