Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HHLA3Q9XRX5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HHLA3Q9XRX5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHLA3Q9XRX5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHLA3Q9XRX5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHLA3Q9XRX5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHLA3Q9XRX5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA3Q9XRX5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHLA3Q9XRX5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHLA3Q9XRX5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHLA3Q9XRX5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HHLA3Q9XRX5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HHLA3Q9XRX5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HHLA3Q9XRX5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HHLA3Q9XRX5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HHLA3Q9XRX5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HHLA3Q9XRX5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHLA3Q9XRX5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHLA3Q9XRX5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHLA3Q9XRX5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HHLA3Q9XRX5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHLA3Q9XRX5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHLA3Q9XRX5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HHLA3Q9XRX5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHLA3Q9XRX5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHLA3Q9XRX5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HHLA3Q9XRX5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HHLA3Q9XRX5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HHLA3Q9XRX5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HHLA3Q9XRX5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HHLA3Q9XRX5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HHLA3Q9XRX5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HHLA3Q9XRX5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HHLA3Q9XRX5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HHLA3Q9XRX5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HHLA3Q9XRX5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HHLA3Q9XRX5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HHLA3Q9XRX5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HHLA3Q9XRX5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HHLA3Q9XRX5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HHLA3Q9XRX5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HHLA3Q9XRX5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HHLA3Q9XRX5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HHLA3Q9XRX5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HHLA3Q9XRX5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HHLA3Q9XRX5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HHLA3Q9XRX5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HHLA3Q9XRX5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HHLA3Q9XRX5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HHLA3Q9XRX5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HHLA3Q9XRX5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HHLA3Q9XRX5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HHLA3Q9XRX5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HHLA3Q9XRX5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HHLA3Q9XRX5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HHLA3Q9XRX5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HHLA3Q9XRX5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HHLA3Q9XRX5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HHLA3Q9XRX5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HHLA3Q9XRX5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HHLA3Q9XRX5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HHLA3Q9XRX5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HHLA3Q9XRX5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HHLA3Q9XRX5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HHLA3Q9XRX5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HHLA3Q9XRX5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HHLA3Q9XRX5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HHLA3Q9XRX5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HHLA3Q9XRX5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HHLA3Q9XRX5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HHLA3Q9XRX5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HHLA3Q9XRX5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HHLA3Q9XRX5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HHLA3Q9XRX5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HHLA3Q9XRX5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HHLA3Q9XRX5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms