Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRMT1Q9NXH9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRMT1Q9NXH9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRMT1Q9NXH9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRMT1Q9NXH9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRMT1Q9NXH9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRMT1Q9NXH9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRMT1Q9NXH9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRMT1Q9NXH9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRMT1Q9NXH9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRMT1Q9NXH9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRMT1Q9NXH9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRMT1Q9NXH9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TRMT1Q9NXH9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TRMT1Q9NXH9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TRMT1Q9NXH9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRMT1Q9NXH9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRMT1Q9NXH9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRMT1Q9NXH9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRMT1Q9NXH9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRMT1Q9NXH9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRMT1Q9NXH9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRMT1Q9NXH9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TRMT1Q9NXH9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRMT1Q9NXH9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRMT1Q9NXH9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRMT1Q9NXH9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRMT1Q9NXH9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRMT1Q9NXH9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRMT1Q9NXH9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRMT1Q9NXH9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRMT1Q9NXH9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRMT1Q9NXH9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRMT1Q9NXH9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRMT1Q9NXH9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRMT1Q9NXH9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRMT1Q9NXH9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRMT1Q9NXH9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRMT1Q9NXH9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRMT1Q9NXH9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRMT1Q9NXH9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRMT1Q9NXH9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRMT1Q9NXH9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRMT1Q9NXH9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRMT1Q9NXH9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRMT1Q9NXH9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
TRMT1Q9NXH9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRMT1Q9NXH9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRMT1Q9NXH9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TRMT1Q9NXH9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRMT1Q9NXH9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRMT1Q9NXH9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRMT1Q9NXH9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRMT1Q9NXH9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRMT1Q9NXH9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRMT1Q9NXH9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRMT1Q9NXH9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRMT1Q9NXH9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TRMT1Q9NXH9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRMT1Q9NXH9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRMT1Q9NXH9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRMT1Q9NXH9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRMT1Q9NXH9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRMT1Q9NXH9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRMT1Q9NXH9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRMT1Q9NXH9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRMT1Q9NXH9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRMT1Q9NXH9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRMT1Q9NXH9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRMT1Q9NXH9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRMT1Q9NXH9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRMT1Q9NXH9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRMT1Q9NXH9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRMT1Q9NXH9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRMT1Q9NXH9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRMT1Q9NXH9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRMT1Q9NXH9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRMT1Q9NXH9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRMT1Q9NXH9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRMT1Q9NXH9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRMT1Q9NXH9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRMT1Q9NXH9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRMT1Q9NXH9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TRMT1Q9NXH9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TRMT1Q9NXH9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRMT1Q9NXH9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRMT1Q9NXH9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRMT1Q9NXH9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRMT1Q9NXH9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRMT1Q9NXH9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRMT1Q9NXH9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRMT1Q9NXH9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRMT1Q9NXH9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRMT1Q9NXH9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRMT1Q9NXH9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRMT1Q9NXH9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRMT1Q9NXH9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRMT1Q9NXH9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRMT1Q9NXH9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRMT1Q9NXH9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms