Protein–RNA interactions for Protein: Q96K19

RNF170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170Q96K19 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF170Q96K19 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF170Q96K19 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF170Q96K19 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF170Q96K19 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF170Q96K19 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF170Q96K19 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF170Q96K19 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF170Q96K19 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF170Q96K19 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF170Q96K19 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF170Q96K19 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF170Q96K19 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF170Q96K19 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF170Q96K19 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF170Q96K19 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF170Q96K19 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF170Q96K19 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF170Q96K19 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF170Q96K19 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF170Q96K19 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF170Q96K19 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF170Q96K19 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF170Q96K19 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF170Q96K19 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF170Q96K19 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF170Q96K19 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF170Q96K19 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF170Q96K19 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF170Q96K19 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF170Q96K19 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF170Q96K19 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF170Q96K19 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF170Q96K19 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF170Q96K19 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF170Q96K19 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF170Q96K19 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF170Q96K19 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF170Q96K19 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF170Q96K19 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF170Q96K19 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF170Q96K19 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF170Q96K19 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF170Q96K19 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF170Q96K19 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF170Q96K19 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF170Q96K19 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF170Q96K19 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF170Q96K19 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF170Q96K19 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF170Q96K19 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF170Q96K19 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF170Q96K19 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF170Q96K19 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF170Q96K19 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF170Q96K19 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF170Q96K19 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF170Q96K19 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF170Q96K19 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF170Q96K19 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF170Q96K19 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF170Q96K19 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF170Q96K19 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF170Q96K19 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF170Q96K19 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF170Q96K19 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF170Q96K19 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF170Q96K19 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF170Q96K19 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF170Q96K19 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF170Q96K19 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF170Q96K19 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF170Q96K19 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF170Q96K19 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF170Q96K19 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF170Q96K19 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF170Q96K19 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF170Q96K19 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF170Q96K19 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF170Q96K19 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF170Q96K19 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF170Q96K19 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF170Q96K19 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF170Q96K19 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF170Q96K19 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF170Q96K19 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF170Q96K19 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF170Q96K19 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RNF170Q96K19 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF170Q96K19 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RNF170Q96K19 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF170Q96K19 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RNF170Q96K19 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RNF170Q96K19 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF170Q96K19 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RNF170Q96K19 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RNF170Q96K19 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF170Q96K19 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF170Q96K19 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RNF170Q96K19 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms