Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNC4Q03721 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KCNC4Q03721 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNC4Q03721 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNC4Q03721 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNC4Q03721 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNC4Q03721 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNC4Q03721 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNC4Q03721 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNC4Q03721 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNC4Q03721 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNC4Q03721 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNC4Q03721 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNC4Q03721 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNC4Q03721 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNC4Q03721 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNC4Q03721 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNC4Q03721 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNC4Q03721 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNC4Q03721 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNC4Q03721 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNC4Q03721 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNC4Q03721 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNC4Q03721 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNC4Q03721 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNC4Q03721 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNC4Q03721 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNC4Q03721 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNC4Q03721 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNC4Q03721 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNC4Q03721 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNC4Q03721 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNC4Q03721 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNC4Q03721 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNC4Q03721 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNC4Q03721 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNC4Q03721 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNC4Q03721 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNC4Q03721 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNC4Q03721 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNC4Q03721 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNC4Q03721 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNC4Q03721 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNC4Q03721 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNC4Q03721 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNC4Q03721 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNC4Q03721 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNC4Q03721 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNC4Q03721 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNC4Q03721 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNC4Q03721 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNC4Q03721 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNC4Q03721 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNC4Q03721 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNC4Q03721 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNC4Q03721 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNC4Q03721 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNC4Q03721 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNC4Q03721 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNC4Q03721 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNC4Q03721 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNC4Q03721 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNC4Q03721 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNC4Q03721 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNC4Q03721 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNC4Q03721 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNC4Q03721 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNC4Q03721 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNC4Q03721 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNC4Q03721 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNC4Q03721 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNC4Q03721 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNC4Q03721 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNC4Q03721 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNC4Q03721 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNC4Q03721 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNC4Q03721 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNC4Q03721 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNC4Q03721 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNC4Q03721 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNC4Q03721 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNC4Q03721 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNC4Q03721 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNC4Q03721 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNC4Q03721 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNC4Q03721 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNC4Q03721 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNC4Q03721 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNC4Q03721 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNC4Q03721 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNC4Q03721 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNC4Q03721 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNC4Q03721 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNC4Q03721 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
KCNC4Q03721 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNC4Q03721 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNC4Q03721 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNC4Q03721 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNC4Q03721 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNC4Q03721 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms