Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NMUP48645 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NMUP48645 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NMUP48645 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NMUP48645 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NMUP48645 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NMUP48645 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NMUP48645 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NMUP48645 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NMUP48645 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NMUP48645 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NMUP48645 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NMUP48645 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NMUP48645 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NMUP48645 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMUP48645 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NMUP48645 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NMUP48645 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NMUP48645 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NMUP48645 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NMUP48645 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NMUP48645 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NMUP48645 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NMUP48645 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NMUP48645 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NMUP48645 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NMUP48645 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMUP48645 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMUP48645 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMUP48645 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NMUP48645 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NMUP48645 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NMUP48645 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NMUP48645 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NMUP48645 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NMUP48645 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NMUP48645 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NMUP48645 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NMUP48645 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NMUP48645 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NMUP48645 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NMUP48645 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NMUP48645 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NMUP48645 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NMUP48645 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NMUP48645 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NMUP48645 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMUP48645 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NMUP48645 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMUP48645 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMUP48645 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NMUP48645 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NMUP48645 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NMUP48645 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NMUP48645 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
NMUP48645 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NMUP48645 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NMUP48645 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NMUP48645 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NMUP48645 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NMUP48645 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NMUP48645 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NMUP48645 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NMUP48645 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NMUP48645 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NMUP48645 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NMUP48645 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMUP48645 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMUP48645 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMUP48645 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMUP48645 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMUP48645 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMUP48645 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMUP48645 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMUP48645 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NMUP48645 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NMUP48645 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMUP48645 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NMUP48645 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMUP48645 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NMUP48645 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NMUP48645 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NMUP48645 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NMUP48645 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NMUP48645 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NMUP48645 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NMUP48645 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NMUP48645 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NMUP48645 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NMUP48645 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NMUP48645 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NMUP48645 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NMUP48645 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NMUP48645 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NMUP48645 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NMUP48645 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NMUP48645 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NMUP48645 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
NMUP48645 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NMUP48645 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms