RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370495.5

SLC25A28-201, Transcript of solute carrier family 25 member 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A28, Length 1,451 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A28-201ENST00000370495 NISCHQ9Y2I1 1504 aa73.59■■■■■ 9.37
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SLC25A28-201ENST00000370495 ABCC9O60706 1549 aa62.83■■■■■ 7.65
SLC25A28-201ENST00000370495 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP61.51■■■■■ 7.44
SLC25A28-201ENST00000370495 DCAF8L2P0C7V8 631 aa61.23■■■■■ 7.39
SLC25A28-201ENST00000370495 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa60.89■■■■■ 7.34
SLC25A28-201ENST00000370495 NACADO15069 1562 aa60.89■■■■■ 7.34
SLC25A28-201ENST00000370495 MYO15BQ96JP2 1530 aa60.78■■■■■ 7.32
SLC25A28-201ENST00000370495 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa60.75■■■■■ 7.32
SLC25A28-201ENST00000370495 SCRIBQ14160 1630 aa59.47■■■■■ 7.11
SLC25A28-201ENST00000370495 UNC13AQ9UPW8 1703 aa59.34■■■■■ 7.09
SLC25A28-201ENST00000370495 BICRAQ9NZM4 1560 aa58.89■■■■■ 7.02
SLC25A28-201ENST00000370495 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP58.88■■■■■ 7.023e-7■■■□□ 16.1
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SLC25A28-201ENST00000370495 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP56.97■■■■■ 6.71
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SLC25A28-201ENST00000370495 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa56.82■■■■■ 6.69
SLC25A28-201ENST00000370495 MROH2BQ7Z745 1585 aa56.77■■■■■ 6.68
SLC25A28-201ENST00000370495 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP56.44■■■■■ 6.63
SLC25A28-201ENST00000370495 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa56.39■■■■■ 6.62
SLC25A28-201ENST00000370495 SMARCA2P51531 1590 aa56.34■■■■■ 6.61
SLC25A28-201ENST00000370495 PEG3Q9GZU2 1588 aa56.3■■■■■ 6.6
SLC25A28-201ENST00000370495 WIZO95785 1651 aa56.19■■■■■ 6.58
SLC25A28-201ENST00000370495 NCAPD3P42695 1498 aa56.18■■■■■ 6.58
SLC25A28-201ENST00000370495 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP56■■■■■ 6.55
SLC25A28-201ENST00000370495 HMGXB3Q12766 1538 aa55.99■■■■■ 6.55
SLC25A28-201ENST00000370495 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP55.79■■■■■ 6.52
SLC25A28-201ENST00000370495 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP55.65■■■■■ 6.5
SLC25A28-201ENST00000370495 CCDC88BA6NC98 1476 aa55■■■■■ 6.4
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SLC25A28-201ENST00000370495 CADPSQ9ULU8 1353 aa54.63■■■■■ 6.34
SLC25A28-201ENST00000370495 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa54.55■■■■■ 6.32
SLC25A28-201ENST00000370495 CFTRP13569 1480 aa54.48■■■■■ 6.31
SLC25A28-201ENST00000370495 PDS5BQ9NTI5 1447 aa54.19■■■■■ 6.26
SLC25A28-201ENST00000370495 ERCC6Q03468 1493 aa54.07■■■■■ 6.25
SLC25A28-201ENST00000370495 PRDM2Q13029 1718 aa54.07■■■■■ 6.25
SLC25A28-201ENST00000370495 FANCD2Q9BXW9 1451 aa54.02■■■■■ 6.24
SLC25A28-201ENST00000370495 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53.95■■■■■ 6.23
SLC25A28-201ENST00000370495 CEP164Q9UPV0 1460 aa53.87■■■■■ 6.21
SLC25A28-201ENST00000370495 MRC2Q9UBG0 1479 aa53.59■■■■■ 6.17
SLC25A28-201ENST00000370495 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP53.56■■■■■ 6.16
SLC25A28-201ENST00000370495 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP53.43■■■■■ 6.14
SLC25A28-201ENST00000370495 WDR62O43379 1518 aa53.36■■■■■ 6.13
SLC25A28-201ENST00000370495 ABCC8Q09428 1581 aa53.3■■■■■ 6.12
SLC25A28-201ENST00000370495 DNMBPQ6XZF7 1577 aa53.26■■■■■ 6.12
SLC25A28-201ENST00000370495 TOPBP1Q92547 1522 aa53.26■■■■■ 6.12
SLC25A28-201ENST00000370495 CUX1P39880 1505 aa53.21■■■■■ 6.11
SLC25A28-201ENST00000370495 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP53.2■■■■■ 6.11
SLC25A28-201ENST00000370495 CUX2O14529 1486 aa53.1■■■■■ 6.09
SLC25A28-201ENST00000370495 SYNJ1O43426 1573 aa53.03■■■■■ 6.08
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SLC25A28-201ENST00000370495 IFT140Q96RY7 1462 aa52.68■■■■■ 6.02
SLC25A28-201ENST00000370495 SOGA1O94964 1423 aa52.67■■■■■ 6.02
SLC25A28-201ENST00000370495 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa52.66■■■■■ 6.02
SLC25A28-201ENST00000370495 TRIM41Q8WV44 630 aa52.6■■■■■ 6.01
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SLC25A28-201ENST00000370495 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa52.39■■■■■ 5.98
SLC25A28-201ENST00000370495 WDR97A6NE52 1622 aa52.35■■■■■ 5.97
SLC25A28-201ENST00000370495 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP52.29■■■■■ 5.96
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SLC25A28-201ENST00000370495 GAPVD1Q14C86 1478 aa52.07■■■■■ 5.93
SLC25A28-201ENST00000370495 KIF27Q86VH2 1401 aa52.01■■■■■ 5.92
SLC25A28-201ENST00000370495 GRIN2BQ13224 1484 aa51.94■■■■■ 5.9
SLC25A28-201ENST00000370495 PBRM1Q86U86 1689 aa51.87■■■■■ 5.89
SLC25A28-201ENST00000370495 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa51.85■■■■■ 5.89
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SLC25A28-201ENST00000370495 ERICH3Q5RHP9 1530 aa51.77■■■■■ 5.88
SLC25A28-201ENST00000370495 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP51.68■■■■■ 5.86
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SLC25A28-201ENST00000370495 EEA1Q15075 1411 aa51.6■■■■■ 5.85
SLC25A28-201ENST00000370495 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP51.56■■■■■ 5.84
SLC25A28-201ENST00000370495 ADAMTS12P58397 1594 aa51.55■■■■■ 5.84
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SLC25A28-201ENST00000370495 SYNJ2O15056 1496 aa51.48■■■■■ 5.83
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SLC25A28-201ENST00000370495 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP51.42■■■■■ 5.82
SLC25A28-201ENST00000370495 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa51.41■■■■■ 5.82
SLC25A28-201ENST00000370495 CHD1O14646 1710 aa51.36■■■■■ 5.81
SLC25A28-201ENST00000370495 GRIN2AQ12879 1464 aa51.27■■■■■ 5.8
SLC25A28-201ENST00000370495 PRXQ9BXM0 1461 aa51.24■■■■■ 5.79
SLC25A28-201ENST00000370495 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa51.2■■■■■ 5.79
SLC25A28-201ENST00000370495 OSCARQ8IYS5 282 aa51.1■■■■■ 5.77
SLC25A28-201ENST00000370495 KIF21BO75037 1637 aa51■■■■■ 5.75
SLC25A28-201ENST00000370495 NUP160Q12769 1436 aa50.99■■■■■ 5.75
SLC25A28-201ENST00000370495 CEP170Q5SW79 1584 aa50.98■■■■■ 5.75
SLC25A28-201ENST00000370495 EHMT2Q96KQ7 1210 aa50.87■■■■■ 5.73
SLC25A28-201ENST00000370495 CLASP1Q7Z460 1538 aa50.83■■■■■ 5.73
SLC25A28-201ENST00000370495 GOLGA3Q08378 1498 aa50.81■■■■■ 5.72
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