Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NMUP48645 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NMUP48645 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NMUP48645 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NMUP48645 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NMUP48645 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NMUP48645 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NMUP48645 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NMUP48645 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NMUP48645 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NMUP48645 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NMUP48645 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NMUP48645 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NMUP48645 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMUP48645 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NMUP48645 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NMUP48645 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NMUP48645 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMUP48645 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NMUP48645 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NMUP48645 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NMUP48645 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NMUP48645 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NMUP48645 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMUP48645 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NMUP48645 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NMUP48645 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NMUP48645 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NMUP48645 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NMUP48645 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NMUP48645 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NMUP48645 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NMUP48645 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NMUP48645 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NMUP48645 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NMUP48645 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMUP48645 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMUP48645 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMUP48645 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMUP48645 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NMUP48645 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NMUP48645 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NMUP48645 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NMUP48645 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NMUP48645 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NMUP48645 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NMUP48645 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NMUP48645 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMUP48645 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMUP48645 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMUP48645 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMUP48645 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMUP48645 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NMUP48645 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NMUP48645 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NMUP48645 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NMUP48645 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NMUP48645 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NMUP48645 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NMUP48645 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NMUP48645 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NMUP48645 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NMUP48645 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMUP48645 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMUP48645 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NMUP48645 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NMUP48645 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NMUP48645 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NMUP48645 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NMUP48645 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NMUP48645 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NMUP48645 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NMUP48645 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NMUP48645 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NMUP48645 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NMUP48645 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NMUP48645 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NMUP48645 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NMUP48645 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NMUP48645 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NMUP48645 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NMUP48645 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NMUP48645 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NMUP48645 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NMUP48645 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NMUP48645 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NMUP48645 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NMUP48645 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NMUP48645 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NMUP48645 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NMUP48645 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NMUP48645 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NMUP48645 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NMUP48645 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NMUP48645 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NMUP48645 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NMUP48645 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NMUP48645 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NMUP48645 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NMUP48645 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms