Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNA2P20248 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNA2P20248 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNA2P20248 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNA2P20248 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNA2P20248 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNA2P20248 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNA2P20248 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNA2P20248 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNA2P20248 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNA2P20248 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNA2P20248 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNA2P20248 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNA2P20248 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNA2P20248 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNA2P20248 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNA2P20248 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCNA2P20248 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNA2P20248 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCNA2P20248 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCNA2P20248 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNA2P20248 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCNA2P20248 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCNA2P20248 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNA2P20248 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCNA2P20248 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNA2P20248 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNA2P20248 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNA2P20248 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNA2P20248 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNA2P20248 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNA2P20248 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNA2P20248 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNA2P20248 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNA2P20248 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCNA2P20248 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA2P20248 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA2P20248 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA2P20248 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCNA2P20248 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCNA2P20248 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNA2P20248 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCNA2P20248 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCNA2P20248 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNA2P20248 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNA2P20248 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCNA2P20248 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNA2P20248 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNA2P20248 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CCNA2P20248 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCNA2P20248 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNA2P20248 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCNA2P20248 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCNA2P20248 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNA2P20248 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNA2P20248 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNA2P20248 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCNA2P20248 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNA2P20248 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNA2P20248 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNA2P20248 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNA2P20248 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNA2P20248 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNA2P20248 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNA2P20248 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNA2P20248 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNA2P20248 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNA2P20248 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNA2P20248 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNA2P20248 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNA2P20248 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNA2P20248 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNA2P20248 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNA2P20248 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCNA2P20248 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNA2P20248 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNA2P20248 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNA2P20248 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNA2P20248 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNA2P20248 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNA2P20248 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNA2P20248 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNA2P20248 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNA2P20248 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNA2P20248 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNA2P20248 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNA2P20248 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNA2P20248 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNA2P20248 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNA2P20248 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNA2P20248 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCNA2P20248 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCNA2P20248 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNA2P20248 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNA2P20248 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNA2P20248 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNA2P20248 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNA2P20248 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNA2P20248 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNA2P20248 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms