Protein–RNA interactions for Protein: O60760

HPGDS, Hematopoietic prostaglandin D synthase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDSO60760 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HPGDSO60760 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPGDSO60760 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPGDSO60760 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPGDSO60760 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPGDSO60760 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPGDSO60760 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPGDSO60760 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPGDSO60760 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPGDSO60760 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPGDSO60760 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPGDSO60760 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPGDSO60760 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPGDSO60760 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPGDSO60760 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HPGDSO60760 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPGDSO60760 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPGDSO60760 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPGDSO60760 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPGDSO60760 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPGDSO60760 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPGDSO60760 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPGDSO60760 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPGDSO60760 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPGDSO60760 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPGDSO60760 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPGDSO60760 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPGDSO60760 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPGDSO60760 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPGDSO60760 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPGDSO60760 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPGDSO60760 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPGDSO60760 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPGDSO60760 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPGDSO60760 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPGDSO60760 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPGDSO60760 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPGDSO60760 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPGDSO60760 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPGDSO60760 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPGDSO60760 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HPGDSO60760 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPGDSO60760 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPGDSO60760 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPGDSO60760 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPGDSO60760 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HPGDSO60760 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPGDSO60760 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPGDSO60760 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPGDSO60760 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HPGDSO60760 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPGDSO60760 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPGDSO60760 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HPGDSO60760 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPGDSO60760 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPGDSO60760 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPGDSO60760 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPGDSO60760 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPGDSO60760 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HPGDSO60760 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPGDSO60760 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HPGDSO60760 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPGDSO60760 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HPGDSO60760 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HPGDSO60760 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPGDSO60760 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPGDSO60760 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPGDSO60760 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPGDSO60760 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPGDSO60760 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPGDSO60760 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPGDSO60760 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPGDSO60760 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPGDSO60760 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPGDSO60760 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPGDSO60760 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPGDSO60760 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPGDSO60760 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPGDSO60760 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPGDSO60760 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HPGDSO60760 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPGDSO60760 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPGDSO60760 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPGDSO60760 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPGDSO60760 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPGDSO60760 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HPGDSO60760 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HPGDSO60760 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPGDSO60760 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPGDSO60760 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPGDSO60760 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPGDSO60760 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HPGDSO60760 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HPGDSO60760 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HPGDSO60760 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HPGDSO60760 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPGDSO60760 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPGDSO60760 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HPGDSO60760 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HPGDSO60760 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms