RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518564.1

PPP2CB-204, Transcript of protein phosphatase 2 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PPP2CB, Length 691 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2CB-204ENST00000518564 NISCHQ9Y2I1 1504 aa77.48■■■■■ 9.99
PPP2CB-204ENST00000518564 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa69.23■■■■■ 8.67
PPP2CB-204ENST00000518564 ABCC9O60706 1549 aa68.19■■■■■ 8.51
PPP2CB-204ENST00000518564 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa65.42■■■■■ 8.06
PPP2CB-204ENST00000518564 NACADO15069 1562 aa65.17■■■■■ 8.02
PPP2CB-204ENST00000518564 DCAF8L2P0C7V8 631 aa64.93■■■■■ 7.98
PPP2CB-204ENST00000518564 MYO15BQ96JP2 1530 aa64.56■■■■■ 7.93
PPP2CB-204ENST00000518564 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP64.45■■■■■ 7.91
PPP2CB-204ENST00000518564 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa64.08■■■■■ 7.85
PPP2CB-204ENST00000518564 UNC13AQ9UPW8 1703 aa63.92■■■■■ 7.82
PPP2CB-204ENST00000518564 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP63.55■■■■■ 7.76
PPP2CB-204ENST00000518564 BICRAQ9NZM4 1560 aa63.36■■■■■ 7.73
PPP2CB-204ENST00000518564 SCRIBQ14160 1630 aa63.11■■■■■ 7.69
PPP2CB-204ENST00000518564 DNAJC5BQ9UF47 199 aa62.91■■■■■ 7.66
PPP2CB-204ENST00000518564 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa62.74■■■■■ 7.63
PPP2CB-204ENST00000518564 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP61.79■■■■■ 7.48
PPP2CB-204ENST00000518564 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa61.68■■■■■ 7.46
PPP2CB-204ENST00000518564 CECR2Q9BXF3 1484 aa61.34■■■■■ 7.41
PPP2CB-204ENST00000518564 SMARCA4P51532 1647 aa60.29■■■■■ 7.24
PPP2CB-204ENST00000518564 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP60.15■■■■■ 7.22
PPP2CB-204ENST00000518564 NCAPD3P42695 1498 aa60.07■■■■■ 7.21
PPP2CB-204ENST00000518564 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa60.03■■■■■ 7.2
PPP2CB-204ENST00000518564 SMARCA2P51531 1590 aa60.02■■■■■ 7.2
PPP2CB-204ENST00000518564 HMGXB3Q12766 1538 aa59.81■■■■■ 7.17
PPP2CB-204ENST00000518564 MROH2BQ7Z745 1585 aa59.69■■■■■ 7.15
PPP2CB-204ENST00000518564 PEG3Q9GZU2 1588 aa59.68■■■■■ 7.14
PPP2CB-204ENST00000518564 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP59.58■■■■■ 7.13
PPP2CB-204ENST00000518564 WIZO95785 1651 aa59.06■■■■■ 7.05
PPP2CB-204ENST00000518564 ERCC6Q03468 1493 aa58.89■■■■■ 7.02
PPP2CB-204ENST00000518564 NESP48681 1621 aa58.81■■■■■ 7.01
PPP2CB-204ENST00000518564 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP58.78■■■■■ 7
PPP2CB-204ENST00000518564 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa58.67■■■■■ 6.98
PPP2CB-204ENST00000518564 CUX2O14529 1486 aa58.43■■■■■ 6.94
PPP2CB-204ENST00000518564 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP58.42■■■■■ 6.94
PPP2CB-204ENST00000518564 CADPSQ9ULU8 1353 aa58.29■■■■■ 6.92
PPP2CB-204ENST00000518564 PDS5BQ9NTI5 1447 aa58.26■■■■■ 6.92
PPP2CB-204ENST00000518564 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa58.2■■■■■ 6.91
PPP2CB-204ENST00000518564 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP58.12■■■■■ 6.89
PPP2CB-204ENST00000518564 CFTRP13569 1480 aa57.85■■■■■ 6.85
PPP2CB-204ENST00000518564 MRC2Q9UBG0 1479 aa57.71■■■■■ 6.83
PPP2CB-204ENST00000518564 CEP164Q9UPV0 1460 aa57.7■■■■■ 6.83
PPP2CB-204ENST00000518564 FANCD2Q9BXW9 1451 aa57.68■■■■■ 6.82
PPP2CB-204ENST00000518564 CCDC88BA6NC98 1476 aa57.66■■■■■ 6.82
PPP2CB-204ENST00000518564 WDR62O43379 1518 aa57.54■■■■■ 6.8
PPP2CB-204ENST00000518564 PRDM2Q13029 1718 aa57.52■■■■■ 6.8
PPP2CB-204ENST00000518564 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa57.15■■■■■ 6.74
PPP2CB-204ENST00000518564 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP57.11■■■■■ 6.73
PPP2CB-204ENST00000518564 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP56.9■■■■■ 6.7
PPP2CB-204ENST00000518564 TOPBP1Q92547 1522 aa56.69■■■■■ 6.67
PPP2CB-204ENST00000518564 ABCC8Q09428 1581 aa56.67■■■■■ 6.66
PPP2CB-204ENST00000518564 DNMBPQ6XZF7 1577 aa56.62■■■■■ 6.65
PPP2CB-204ENST00000518564 IFT140Q96RY7 1462 aa56.48■■■■■ 6.63
PPP2CB-204ENST00000518564 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP56.23■■■■■ 6.59
PPP2CB-204ENST00000518564 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP56.17■■■■■ 6.58
PPP2CB-204ENST00000518564 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP56.12■■■■■ 6.57
PPP2CB-204ENST00000518564 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP56.09■■■■■ 6.57
PPP2CB-204ENST00000518564 CUX1P39880 1505 aa56.05■■■■■ 6.56
PPP2CB-204ENST00000518564 FGD5Q6ZNL6 1462 aa55.97■■■■■ 6.55
PPP2CB-204ENST00000518564 SOGA1O94964 1423 aa55.9■■■■■ 6.54
PPP2CB-204ENST00000518564 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa55.9■■■■■ 6.54
PPP2CB-204ENST00000518564 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP55.83■■■■■ 6.537e-9■■■□□ 14.9
PPP2CB-204ENST00000518564 OSCARQ8IYS5 282 aa55.82■■■■■ 6.53
PPP2CB-204ENST00000518564 WDR97A6NE52 1622 aa55.72■■■■■ 6.51
PPP2CB-204ENST00000518564 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP55.64■■■■■ 6.5
PPP2CB-204ENST00000518564 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP55.5■■■■■ 6.48
PPP2CB-204ENST00000518564 CHD1O14646 1710 aa55.49■■■■■ 6.47
PPP2CB-204ENST00000518564 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa55.48■■■■■ 6.47
PPP2CB-204ENST00000518564 TOP2BQ02880 1626 aa55.46■■■■■ 6.47
PPP2CB-204ENST00000518564 SYNJ1O43426 1573 aa55.4■■■■■ 6.46
PPP2CB-204ENST00000518564 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa55.39■■■■■ 6.46
PPP2CB-204ENST00000518564 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa55.37■■■■■ 6.45
PPP2CB-204ENST00000518564 GRIN2BQ13224 1484 aa55.36■■■■■ 6.45
PPP2CB-204ENST00000518564 FBLN2P98095 1184 aa55.31■■■■■ 6.44
PPP2CB-204ENST00000518564 PBRM1Q86U86 1689 aa55.29■■■■■ 6.44
PPP2CB-204ENST00000518564 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP55.29■■■■■ 6.44
PPP2CB-204ENST00000518564 GAPVD1Q14C86 1478 aa55.28■■■■■ 6.44
PPP2CB-204ENST00000518564 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa55.26■■■■■ 6.44
PPP2CB-204ENST00000518564 TRIM41Q8WV44 630 aa55.13■■■■■ 6.42
PPP2CB-204ENST00000518564 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa55.09■■■■■ 6.41
PPP2CB-204ENST00000518564 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa55.09■■■■■ 6.41
PPP2CB-204ENST00000518564 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa55.09■■■■■ 6.41
PPP2CB-204ENST00000518564 SYNJ2O15056 1496 aa55.07■■■■■ 6.41
PPP2CB-204ENST00000518564 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP55.06■■■■■ 6.4
PPP2CB-204ENST00000518564 ARHGEF11O15085 1522 aa55■■■■■ 6.4
PPP2CB-204ENST00000518564 CLASP1Q7Z460 1538 aa54.82■■■■■ 6.37
PPP2CB-204ENST00000518564 ADAMTS12P58397 1594 aa54.79■■■■■ 6.36
PPP2CB-204ENST00000518564 ERICH3Q5RHP9 1530 aa54.75■■■■■ 6.35
PPP2CB-204ENST00000518564 GRIN2AQ12879 1464 aa54.66■■■■■ 6.34
PPP2CB-204ENST00000518564 FHAD1B1AJZ9 1412 aa54.61■■■■■ 6.33
PPP2CB-204ENST00000518564 ARAP1Q96P48 1450 aa54.49■■■■■ 6.31
PPP2CB-204ENST00000518564 CYB5RLQ6IPT4 315 aa54.45■■■■■ 6.31
PPP2CB-204ENST00000518564 CEP170Q5SW79 1584 aa54.4■■■■■ 6.3
PPP2CB-204ENST00000518564 NUP160Q12769 1436 aa54.39■■■■■ 6.3
PPP2CB-204ENST00000518564 KIF27Q86VH2 1401 aa54.39■■■■■ 6.3
PPP2CB-204ENST00000518564 CUL7Q14999 1698 aa54.2■■■■■ 6.27
PPP2CB-204ENST00000518564 IGF1RP08069 1367 aa54.13■■■■■ 6.26
PPP2CB-204ENST00000518564 SHROOM2Q13796 1616 aa54.09■■■■■ 6.25
PPP2CB-204ENST00000518564 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa54■■■■■ 6.24
PPP2CB-204ENST00000518564 ERCC6L2Q5T890 1561 aa53.99■■■■■ 6.23
PPP2CB-204ENST00000518564 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa53.86■■■■■ 6.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms