Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 SLIRP-211ENST00000557623 865 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.023e-8■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 PKM-224ENST00000569857 1355 ntTSL 514.6□□□□□ -0.078e-8■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 SLIRP-205ENST00000556310 626 ntTSL 213.81□□□□□ -0.23e-8■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 SLIRP-206ENST00000556375 408 ntTSL 213.81□□□□□ -0.23e-8■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 SLIRP-212ENST00000613856 420 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.323e-8■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 PKM-205ENST00000561609 1568 ntTSL 1 (best)12.67□□□□□ -0.388e-8■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 PKM-221ENST00000568743 580 ntTSL 1 (best)11.86□□□□□ -0.518e-8■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 SLIRP-204ENST00000555890 471 ntTSL 27.49□□□□□ -1.213e-8■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 SLIRP-202ENST00000553981 285 ntTSL 33.82□□□□□ -1.83e-8■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 SLIRP-208ENST00000556956 450 ntTSL 22.97□□□□□ -1.933e-8■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 DDX39A-206ENST00000587730 1813 ntTSL 1 (best)20.23■□□□□ 0.831e-6■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 DDX39A-208ENST00000588692 1478 ntTSL 517.46■□□□□ 0.391e-6■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 DDX39A-209ENST00000589318 1903 ntTSL 1 (best)17.08■□□□□ 0.331e-6■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.321e-6■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 DDX39A-202ENST00000324340 1355 ntTSL 1 (best)14.47□□□□□ -0.091e-6■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 C19orf25-209ENST00000590621 885 ntTSL 316.56■□□□□ 0.242e-7■□□□□ 8.6
PABPC4Q13310 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.657e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 TIMM44-208ENST00000598968 797 ntTSL 327■■□□□ 1.917e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NABP2-206ENST00000479016 1031 ntTSL 226.86■■□□□ 1.897e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 C2orf68-204ENST00000423181 976 ntTSL 1 (best)26.25■■□□□ 1.791e-10■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 TMC6-213ENST00000589933 580 ntTSL 325.81■■□□□ 1.727e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.587e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.487e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.443e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 RFXANK-210ENST00000541873 1002 ntTSL 223.95■■□□□ 1.423e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.391e-10■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.297e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.237e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 CHID1-218ENST00000531010 408 ntTSL 222.73■■□□□ 1.237e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 STRBP-203ENST00000407982 2751 ntTSL 1 (best)22.67■■□□□ 1.227e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.27e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 RFXANK-209ENST00000540981 832 ntTSL 522.51■■□□□ 1.193e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PSMC3-208ENST00000530887 891 ntTSL 222.45■■□□□ 1.187e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.143e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.131e-10■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 HERC2-210ENST00000568206 2018 ntTSL 221.46■■□□□ 1.031e-10■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.997e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 WDR18-206ENST00000590397 1083 ntTSL 521.24■□□□□ 0.997e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.987e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NABP2-204ENST00000399713 663 ntTSL 520.88■□□□□ 0.937e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NELFA-205ENST00000416258 2188 ntTSL 520.85■□□□□ 0.937e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.927e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NELFA-201ENST00000333877 2228 ntTSL 220.67■□□□□ 0.97e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.897e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.877e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.823e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.777e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.777e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 AGPAT3-213ENST00000479117 1510 ntTSL 519.83■□□□□ 0.773e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PDLIM7-213ENST00000505074 931 ntTSL 319.8■□□□□ 0.763e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 ARPC4-207ENST00000485273 577 ntTSL 219.76■□□□□ 0.753e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 ERCC2-202ENST00000391942 1488 ntTSL 219.73■□□□□ 0.757e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 ERCC2-201ENST00000391941 2871 ntTSL 1 (best)19.69■□□□□ 0.747e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NELFA-213ENST00000467661 1707 ntTSL 1 (best)19.47■□□□□ 0.717e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 COPE-206ENST00000597026 678 ntTSL 219.44■□□□□ 0.77e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 ERCC2-211ENST00000588652 2405 ntTSL 219.39■□□□□ 0.697e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.671e-10■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 ARL8B-205ENST00000455168 1641 ntTSL 218.95■□□□□ 0.623e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 C2orf68-203ENST00000420686 1204 ntTSL 218.89■□□□□ 0.611e-10■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.597e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.577e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.547e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NELFA-212ENST00000463820 2495 ntTSL 218.35■□□□□ 0.537e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 WDR18-208ENST00000591276 607 ntTSL 318.35■□□□□ 0.537e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PPP2R1A-203ENST00000454220 1233 ntTSL 1 (best)18.34■□□□□ 0.537e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 HGS-202ENST00000570355 735 ntTSL 518.2■□□□□ 0.57e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.487e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PPP2R1A-210ENST00000490868 668 ntTSL 217.89■□□□□ 0.457e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PSMC3-202ENST00000524447 935 ntTSL 317.83■□□□□ 0.447e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.447e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 HSF1-211ENST00000533130 493 ntTSL 317.57■□□□□ 0.47e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.377e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 MARK3-209ENST00000555235 2282 ntTSL 217.23■□□□□ 0.357e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 AC002985.1-202ENST00000593484 584 ntAPPRIS P1 TSL 516.98■□□□□ 0.317e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.37e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.277e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.253e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.247e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.27e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.23e-8■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PCK2-207ENST00000559171 508 ntTSL 316.21■□□□□ 0.197e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.171e-10■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.177e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.167e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.167e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 HSF1-213ENST00000534314 684 ntTSL 215.98■□□□□ 0.157e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.147e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.137e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 CHID1-219ENST00000531859 834 ntTSL 515.66■□□□□ 0.17e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PSMC3-207ENST00000530651 905 ntTSL 515.62■□□□□ 0.097e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.077e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 TLN1-207ENST00000489255 798 ntTSL 215.44■□□□□ 0.067e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.037e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PPP2R1A-206ENST00000468280 688 ntTSL 215.08■□□□□ 07e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 PSMC3-210ENST00000531051 777 ntTSL 515.07■□□□□ 07e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 CHEK2-210ENST00000416671 2560 ntTSL 1 (best)14.93□□□□□ -0.027e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.067e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 HGS-213ENST00000575078 330 ntTSL 314.3□□□□□ -0.127e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 BRD9-204ENST00000483173 2120 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.137e-6■□□□□ 8.5
PABPC4Q13310 SETD3-205ENST00000446066 1754 ntTSL 514.13□□□□□ -0.157e-6■□□□□ 8.5
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 709.1 ms