Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.27■■■■■ 4.04not detected
PABPC4Q13310 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.974e-8■■■■□ 20.3
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PABPC4Q13310 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.874e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.832e-9■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79not detected
PABPC4Q13310 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78not detected
PABPC4Q13310 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75not detected
PABPC4Q13310 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7not detected
PABPC4Q13310 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.683e-7■■□□□ 12.2
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PABPC4Q13310 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64not detected
PABPC4Q13310 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63not detected
PABPC4Q13310 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61not detected
PABPC4Q13310 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61not detected
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PABPC4Q13310 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57not detected
PABPC4Q13310 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.542e-8■■■■□ 19.8
PABPC4Q13310 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.533e-63■■■■■ 29.2
PABPC4Q13310 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5not detected
PABPC4Q13310 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5not detected
PABPC4Q13310 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.52e-6■■■□□ 18.7
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PABPC4Q13310 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49not detected
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PABPC4Q13310 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48not detected
PABPC4Q13310 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47not detected
PABPC4Q13310 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.462e-7■■■□□ 16.8
PABPC4Q13310 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44not detected
PABPC4Q13310 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.433e-8■■■■□ 20.9
PABPC4Q13310 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41not detected
PABPC4Q13310 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39not detected
PABPC4Q13310 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39not detected
PABPC4Q13310 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39not detected
PABPC4Q13310 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38not detected
PABPC4Q13310 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37not detected
PABPC4Q13310 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37not detected
PABPC4Q13310 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36not detected
PABPC4Q13310 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33not detected
PABPC4Q13310 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33not detected
PABPC4Q13310 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31not detected
PABPC4Q13310 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.39e-7■■■□□ 16.2
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PABPC4Q13310 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.291e-9■■■■■ 49.2
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PABPC4Q13310 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27not detected
PABPC4Q13310 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.272e-6■■■□□ 18.7
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PABPC4Q13310 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25not detected
PABPC4Q13310 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24not detected
PABPC4Q13310 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22not detected
PABPC4Q13310 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2not detected
PABPC4Q13310 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2not detected
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PABPC4Q13310 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.27e-27■□□□□ 8.2
PABPC4Q13310 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2not detected
PABPC4Q13310 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19not detected
PABPC4Q13310 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19not detected
PABPC4Q13310 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19not detected
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PABPC4Q13310 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18not detected
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PABPC4Q13310 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17not detected
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PABPC4Q13310 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15not detected
PABPC4Q13310 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.153e-6■■■□□ 15.2
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PABPC4Q13310 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13not detected
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PABPC4Q13310 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13not detected
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PABPC4Q13310 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12not detected
PABPC4Q13310 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.129e-7■■■□□ 16.2
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PABPC4Q13310 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11not detected
PABPC4Q13310 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11not detected
PABPC4Q13310 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11not detected
PABPC4Q13310 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1not detected
PABPC4Q13310 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1not detected
PABPC4Q13310 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.091e-8■□□□□ 8.9
PABPC4Q13310 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.096e-7■■□□□ 11.4
PABPC4Q13310 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09not detected
PABPC4Q13310 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09not detected
PABPC4Q13310 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08not detected
PABPC4Q13310 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.089e-16■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08not detected
PABPC4Q13310 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08not detected
PABPC4Q13310 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07not detected
PABPC4Q13310 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07not detected
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