RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568206.1

HERC2-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 2

Gene HERC2, Length 2,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-210ENST00000568206 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.18■■■■■ 4.5
HERC2-210ENST00000568206 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.58■■■■□ 3.61
HERC2-210ENST00000568206 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
HERC2-210ENST00000568206 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.75■■■■□ 3.31
HERC2-210ENST00000568206 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.54■■■■□ 3.28
HERC2-210ENST00000568206 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.32■■■■□ 3.24
HERC2-210ENST00000568206 ABCC9O60706 1549 aa35.26■■■■□ 3.23
HERC2-210ENST00000568206 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.25■■■■□ 3.23
HERC2-210ENST00000568206 NACADO15069 1562 aa34.95■■■■□ 3.19
HERC2-210ENST00000568206 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.59■■■■□ 3.13
HERC2-210ENST00000568206 SCRIBQ14160 1630 aa34.54■■■■□ 3.12
HERC2-210ENST00000568206 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
HERC2-210ENST00000568206 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.84■■■■□ 3.01
HERC2-210ENST00000568206 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.57■■■□□ 2.96
HERC2-210ENST00000568206 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.49■■■□□ 2.95
HERC2-210ENST00000568206 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.48■■■□□ 2.95
HERC2-210ENST00000568206 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.35■■■□□ 2.93
HERC2-210ENST00000568206 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.34■■■□□ 2.93
HERC2-210ENST00000568206 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.28■■■□□ 2.92
HERC2-210ENST00000568206 SMARCA4P51532 1647 aa33.15■■■□□ 2.9
HERC2-210ENST00000568206 WIZO95785 1651 aa33.07■■■□□ 2.89
HERC2-210ENST00000568206 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.79■■■□□ 2.84
HERC2-210ENST00000568206 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
HERC2-210ENST00000568206 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.76■■■□□ 2.83
HERC2-210ENST00000568206 SMARCA2P51531 1590 aa32.57■■■□□ 2.8
HERC2-210ENST00000568206 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.54■■■□□ 2.8
HERC2-210ENST00000568206 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
HERC2-210ENST00000568206 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.43■■■□□ 2.78
HERC2-210ENST00000568206 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.39■■■□□ 2.78
HERC2-210ENST00000568206 NCAPD3P42695 1498 aa32.24■■■□□ 2.75
HERC2-210ENST00000568206 HMGXB3Q12766 1538 aa32.23■■■□□ 2.75
HERC2-210ENST00000568206 TRIM41Q8WV44 630 aa32.11■■■□□ 2.73
HERC2-210ENST00000568206 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.94■■■□□ 2.7
HERC2-210ENST00000568206 ABCC8Q09428 1581 aa31.8■■■□□ 2.68
HERC2-210ENST00000568206 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.62■■■□□ 2.65
HERC2-210ENST00000568206 CFTRP13569 1480 aa31.58■■■□□ 2.65
HERC2-210ENST00000568206 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.51■■■□□ 2.63
HERC2-210ENST00000568206 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
HERC2-210ENST00000568206 PRDM2Q13029 1718 aa31.45■■■□□ 2.63
HERC2-210ENST00000568206 SYNJ1O43426 1573 aa31.44■■■□□ 2.62
HERC2-210ENST00000568206 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.42■■■□□ 2.62
HERC2-210ENST00000568206 EEA1Q15075 1411 aa31.34■■■□□ 2.61
HERC2-210ENST00000568206 TOP2BQ02880 1626 aa31.34■■■□□ 2.61
HERC2-210ENST00000568206 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.3■■■□□ 2.6
HERC2-210ENST00000568206 SOGA1O94964 1423 aa31.25■■■□□ 2.59
HERC2-210ENST00000568206 CUX1P39880 1505 aa31.16■■■□□ 2.58
HERC2-210ENST00000568206 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.12■■■□□ 2.57
HERC2-210ENST00000568206 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.09■■■□□ 2.57
HERC2-210ENST00000568206 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.08■■■□□ 2.57
HERC2-210ENST00000568206 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.08■■■□□ 2.57
HERC2-210ENST00000568206 NESP48681 1621 aa31.01■■■□□ 2.56
HERC2-210ENST00000568206 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.98■■■□□ 2.55
HERC2-210ENST00000568206 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.95■■■□□ 2.55
HERC2-210ENST00000568206 GOLGA3Q08378 1498 aa30.88■■■□□ 2.53
HERC2-210ENST00000568206 KIF21BO75037 1637 aa30.88■■■□□ 2.53
HERC2-210ENST00000568206 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.88■■■□□ 2.53
HERC2-210ENST00000568206 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.88■■■□□ 2.53
HERC2-210ENST00000568206 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.85■■■□□ 2.53
HERC2-210ENST00000568206 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.82■■■□□ 2.52
HERC2-210ENST00000568206 KIF27Q86VH2 1401 aa30.82■■■□□ 2.52
HERC2-210ENST00000568206 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.8■■■□□ 2.52
HERC2-210ENST00000568206 TOPBP1Q92547 1522 aa30.76■■■□□ 2.52
HERC2-210ENST00000568206 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
HERC2-210ENST00000568206 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.67■■■□□ 2.5
HERC2-210ENST00000568206 CEP162Q5TB80 1403 aa30.66■■■□□ 2.5
HERC2-210ENST00000568206 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
HERC2-210ENST00000568206 CUX2O14529 1486 aa30.65■■■□□ 2.5
HERC2-210ENST00000568206 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.65■■■□□ 2.5
HERC2-210ENST00000568206 PRXQ9BXM0 1461 aa30.65■■■□□ 2.5
HERC2-210ENST00000568206 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
HERC2-210ENST00000568206 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.63■■■□□ 2.49
HERC2-210ENST00000568206 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.56■■■□□ 2.48
HERC2-210ENST00000568206 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.49■■■□□ 2.47
HERC2-210ENST00000568206 IGF1RP08069 1367 aa30.48■■■□□ 2.47
HERC2-210ENST00000568206 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.45■■■□□ 2.46
HERC2-210ENST00000568206 WDR97A6NE52 1622 aa30.42■■■□□ 2.46
HERC2-210ENST00000568206 CLIP1P30622 1438 aa30.38■■■□□ 2.45
HERC2-210ENST00000568206 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.35■■■□□ 2.45
HERC2-210ENST00000568206 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
HERC2-210ENST00000568206 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.34■■■□□ 2.45
HERC2-210ENST00000568206 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.28■■■□□ 2.44
HERC2-210ENST00000568206 WDR62O43379 1518 aa30.28■■■□□ 2.44
HERC2-210ENST00000568206 CUL7Q14999 1698 aa30.28■■■□□ 2.44
HERC2-210ENST00000568206 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
HERC2-210ENST00000568206 ERCC6Q03468 1493 aa30.26■■■□□ 2.43
HERC2-210ENST00000568206 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.21■■■□□ 2.43
HERC2-210ENST00000568206 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
HERC2-210ENST00000568206 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.16■■■□□ 2.42
HERC2-210ENST00000568206 IFT140Q96RY7 1462 aa30.12■■■□□ 2.41
HERC2-210ENST00000568206 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
HERC2-210ENST00000568206 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
HERC2-210ENST00000568206 ARAP1Q96P48 1450 aa30.03■■■□□ 2.4
HERC2-210ENST00000568206 PBRM1Q86U86 1689 aa30.02■■■□□ 2.4
HERC2-210ENST00000568206 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
HERC2-210ENST00000568206 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.99■■■□□ 2.39
HERC2-210ENST00000568206 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.96■■■□□ 2.397e-7■■■■■ 33.1
HERC2-210ENST00000568206 GRIN2BQ13224 1484 aa29.95■■■□□ 2.39
HERC2-210ENST00000568206 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.95■■■□□ 2.38
HERC2-210ENST00000568206 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.9■■■□□ 2.38
HERC2-210ENST00000568206 APLP2Q06481 763 aa29.89■■■□□ 2.38
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