Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.224e-49■■■■■ 722.5
PABPC4Q13310 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)24.58■■□□□ 1.528e-9■■■■■ 603.5
PABPC4Q13310 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 221.28■■□□□ 18e-9■■■■■ 603.5
PABPC4Q13310 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 220.24■□□□□ 0.838e-9■■■■■ 603.5
PABPC4Q13310 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.628e-9■■■■■ 603.5
PABPC4Q13310 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 310.92□□□□□ -0.668e-9■■■■■ 603.5
PABPC4Q13310 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 510.68□□□□□ -0.78e-9■■■■■ 603.5
PABPC4Q13310 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 38.76□□□□□ -1.018e-9■■■■■ 603.5
PABPC4Q13310 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 56.38□□□□□ -1.398e-9■■■■■ 603.5
PABPC4Q13310 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 55.85□□□□□ -1.478e-9■■■■■ 603.5
PABPC4Q13310 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 45.76□□□□□ -1.498e-9■■■■■ 603.5
PABPC4Q13310 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.048e-9■■■■■ 603.5
PABPC4Q13310 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 455.6
PABPC4Q13310 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 455.6
PABPC4Q13310 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 455.6
PABPC4Q13310 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.515e-11■■■■■ 410.3
PABPC4Q13310 CALU-201ENST00000249364 3357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.215e-11■■■■■ 410.3
PABPC4Q13310 CALU-206ENST00000542996 4225 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.535e-11■■■■■ 410.3
PABPC4Q13310 CALU-204ENST00000493278 589 ntTSL 35.72□□□□□ -1.495e-11■■■■■ 410.3
PABPC4Q13310 ELOF1-207ENST00000591674 679 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.81e-323■■■■■ 323.7
PABPC4Q13310 KMT5A-204ENST00000437519 1774 ntTSL 214.34□□□□□ -0.112e-42■■■■■ 318.1
PABPC4Q13310 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.169e-82■■■■■ 297.6
PABPC4Q13310 SLC26A5-215ENST00000487407 2098 ntTSL 226.78■■□□□ 1.887e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.577e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.557e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.027e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-201ENST00000306312 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -07e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-211ENST00000432958 2588 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.087e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-204ENST00000356767 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.167e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-212ENST00000445809 2324 ntTSL 29.94□□□□□ -0.827e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-213ENST00000454864 2242 ntTSL 28.85□□□□□ -0.997e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.087e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-210ENST00000423416 2374 ntTSL 27.83□□□□□ -1.167e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.177e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.227e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-214ENST00000456463 2370 ntTSL 57□□□□□ -1.297e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.397e-20■■■■■ 290.5
PABPC4Q13310 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.61e-323■■■■■ 271.1
PABPC4Q13310 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.351e-323■■■■■ 265.8
PABPC4Q13310 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.91e-323■■■■■ 263.5
PABPC4Q13310 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.891e-323■■■■■ 263.5
PABPC4Q13310 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.681e-323■■■■■ 263.5
PABPC4Q13310 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.411e-323■■■■■ 263.5
PABPC4Q13310 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC8.63□□□□□ -1.031e-68■■■■■ 237.7
PABPC4Q13310 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.945e-26■■■■■ 224.7
PABPC4Q13310 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.935e-26■■■■■ 224.7
PABPC4Q13310 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.865e-26■■■■■ 224.7
PABPC4Q13310 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.674e-8■■■■■ 195
PABPC4Q13310 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.584e-8■■■■■ 195
PABPC4Q13310 EFHC1-204ENST00000491749 496 ntTSL 429.69■■■□□ 2.343e-22■■■■■ 192.6
PABPC4Q13310 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.113e-22■■■■■ 192.6
PABPC4Q13310 EFHC1-235ENST00000637849 2746 ntTSL 517.74■□□□□ 0.433e-22■■■■■ 192.6
PABPC4Q13310 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.333e-22■■■■■ 192.6
PABPC4Q13310 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.283e-22■■■■■ 192.6
PABPC4Q13310 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.332e-23■■■■■ 189.5
PABPC4Q13310 ZNF644-202ENST00000347275 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.642e-23■■■■■ 189.5
PABPC4Q13310 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.242e-23■■■■■ 189.5
PABPC4Q13310 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.863e-27■■■■■ 178
PABPC4Q13310 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.47e-52■■■■■ 172.4
PABPC4Q13310 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 165.9
PABPC4Q13310 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 165.9
PABPC4Q13310 HMCN1-204ENST00000485744 1884 ntTSL 211.89□□□□□ -0.512e-18■■■■■ 159.3
PABPC4Q13310 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.562e-18■■■■■ 159.3
PABPC4Q13310 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.151e-94■■■■■ 156.1
PABPC4Q13310 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.411e-94■■■■■ 156.1
PABPC4Q13310 PTPN11-205ENST00000635625 1794 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.231e-94■■■■■ 156.1
PABPC4Q13310 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 152.6
PABPC4Q13310 MIPEP-202ENST00000433710 494 ntTSL 318.02■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 152.6
PABPC4Q13310 MIPEP-203ENST00000464194 543 ntTSL 218.02■□□□□ 0.483e-6■■■■■ 152.6
PABPC4Q13310 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.072e-26■■■■■ 150.8
PABPC4Q13310 C17orf75-202ENST00000577809 1642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.152e-39■■■■■ 143.2
PABPC4Q13310 C17orf75-201ENST00000225805 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.582e-39■■■■■ 143.2
PABPC4Q13310 C17orf75-209ENST00000582961 458 ntTSL 57.13□□□□□ -1.272e-39■■■■■ 143.2
PABPC4Q13310 C17orf75-210ENST00000583104 452 ntTSL 35.28□□□□□ -1.562e-39■■■■■ 143.2
PABPC4Q13310 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.525e-17■■■■■ 141.5
PABPC4Q13310 ORC1-201ENST00000371566 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.561e-17■■■■■ 137.3
PABPC4Q13310 ORC1-202ENST00000371568 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.611e-17■■■■■ 137.3
PABPC4Q13310 GREB1-210ENST00000628795 438 ntTSL 55.2□□□□□ -1.589e-16■■■■■ 136.4
PABPC4Q13310 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.54e-16■■■■■ 134.9
PABPC4Q13310 RAE1-207ENST00000462438 3251 ntTSL 213.89□□□□□ -0.196e-7■■■■■ 133.1
PABPC4Q13310 RAE1-203ENST00000395841 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.426e-7■■■■■ 133.1
PABPC4Q13310 RAE1-201ENST00000371242 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.436e-7■■■■■ 133.1
PABPC4Q13310 RAE1-202ENST00000395840 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.816e-7■■■■■ 133.1
PABPC4Q13310 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.558e-15■■■■■ 128.4
PABPC4Q13310 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.218e-15■■■■■ 128.4
PABPC4Q13310 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.318e-15■■■■■ 128.4
PABPC4Q13310 DDIAS-207ENST00000528759 3278 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.648e-15■■■■■ 128.4
PABPC4Q13310 DDIAS-211ENST00000533655 3533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.828e-15■■■■■ 128.4
PABPC4Q13310 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.948e-15■■■■■ 128.4
PABPC4Q13310 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.91e-10■■■■■ 123
PABPC4Q13310 FAM171A1-201ENST00000378116 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.713e-28■■■■■ 119.5
PABPC4Q13310 INS-IGF2-205ENST00000641326 2861 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.295e-9■■■■■ 118.2
PABPC4Q13310 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.281e-13■■■■■ 116.7
PABPC4Q13310 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC5.06□□□□□ -1.61e-6■■■■■ 115.8
PABPC4Q13310 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.885e-8■■■■■ 115.3
PABPC4Q13310 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.275e-8■■■■■ 115.3
PABPC4Q13310 ATG2A-202ENST00000418259 5654 ntTSL 516.27■□□□□ 0.25e-8■■■■■ 115.3
PABPC4Q13310 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.92e-11■■■■■ 114.2
PABPC4Q13310 SPCS1-206ENST00000619898 4254 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.252e-11■■■■■ 114.2
PABPC4Q13310 SPCS1-205ENST00000602728 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.492e-11■■■■■ 114.2
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