Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I9

SMDT1, Essential MCU regulator, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMDT1Q9H4I9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMDT1Q9H4I9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMDT1Q9H4I9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMDT1Q9H4I9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMDT1Q9H4I9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMDT1Q9H4I9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMDT1Q9H4I9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMDT1Q9H4I9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMDT1Q9H4I9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMDT1Q9H4I9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMDT1Q9H4I9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMDT1Q9H4I9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMDT1Q9H4I9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMDT1Q9H4I9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMDT1Q9H4I9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMDT1Q9H4I9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMDT1Q9H4I9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMDT1Q9H4I9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMDT1Q9H4I9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMDT1Q9H4I9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMDT1Q9H4I9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMDT1Q9H4I9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMDT1Q9H4I9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMDT1Q9H4I9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMDT1Q9H4I9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMDT1Q9H4I9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMDT1Q9H4I9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMDT1Q9H4I9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SMDT1Q9H4I9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMDT1Q9H4I9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMDT1Q9H4I9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMDT1Q9H4I9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMDT1Q9H4I9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMDT1Q9H4I9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMDT1Q9H4I9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMDT1Q9H4I9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMDT1Q9H4I9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMDT1Q9H4I9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMDT1Q9H4I9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMDT1Q9H4I9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMDT1Q9H4I9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMDT1Q9H4I9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMDT1Q9H4I9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMDT1Q9H4I9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMDT1Q9H4I9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMDT1Q9H4I9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMDT1Q9H4I9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMDT1Q9H4I9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMDT1Q9H4I9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMDT1Q9H4I9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMDT1Q9H4I9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMDT1Q9H4I9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMDT1Q9H4I9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMDT1Q9H4I9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMDT1Q9H4I9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMDT1Q9H4I9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMDT1Q9H4I9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMDT1Q9H4I9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMDT1Q9H4I9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMDT1Q9H4I9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMDT1Q9H4I9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMDT1Q9H4I9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMDT1Q9H4I9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMDT1Q9H4I9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMDT1Q9H4I9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMDT1Q9H4I9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMDT1Q9H4I9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMDT1Q9H4I9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMDT1Q9H4I9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMDT1Q9H4I9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMDT1Q9H4I9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMDT1Q9H4I9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMDT1Q9H4I9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMDT1Q9H4I9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMDT1Q9H4I9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMDT1Q9H4I9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMDT1Q9H4I9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMDT1Q9H4I9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMDT1Q9H4I9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMDT1Q9H4I9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMDT1Q9H4I9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMDT1Q9H4I9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMDT1Q9H4I9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMDT1Q9H4I9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMDT1Q9H4I9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMDT1Q9H4I9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMDT1Q9H4I9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMDT1Q9H4I9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMDT1Q9H4I9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMDT1Q9H4I9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMDT1Q9H4I9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMDT1Q9H4I9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMDT1Q9H4I9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMDT1Q9H4I9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMDT1Q9H4I9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMDT1Q9H4I9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMDT1Q9H4I9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMDT1Q9H4I9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMDT1Q9H4I9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMDT1Q9H4I9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms