Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TUBB6Q9BUF5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TUBB6Q9BUF5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TUBB6Q9BUF5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TUBB6Q9BUF5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TUBB6Q9BUF5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TUBB6Q9BUF5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBB6Q9BUF5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUBB6Q9BUF5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBB6Q9BUF5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBB6Q9BUF5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TUBB6Q9BUF5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUBB6Q9BUF5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUBB6Q9BUF5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TUBB6Q9BUF5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TUBB6Q9BUF5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TUBB6Q9BUF5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBB6Q9BUF5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBB6Q9BUF5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUBB6Q9BUF5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUBB6Q9BUF5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBB6Q9BUF5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TUBB6Q9BUF5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUBB6Q9BUF5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUBB6Q9BUF5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TUBB6Q9BUF5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBB6Q9BUF5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBB6Q9BUF5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBB6Q9BUF5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBB6Q9BUF5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TUBB6Q9BUF5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TUBB6Q9BUF5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBB6Q9BUF5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBB6Q9BUF5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TUBB6Q9BUF5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBB6Q9BUF5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBB6Q9BUF5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBB6Q9BUF5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBB6Q9BUF5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBB6Q9BUF5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBB6Q9BUF5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBB6Q9BUF5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBB6Q9BUF5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TUBB6Q9BUF5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TUBB6Q9BUF5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBB6Q9BUF5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TUBB6Q9BUF5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBB6Q9BUF5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBB6Q9BUF5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBB6Q9BUF5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBB6Q9BUF5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TUBB6Q9BUF5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUBB6Q9BUF5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBB6Q9BUF5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBB6Q9BUF5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBB6Q9BUF5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBB6Q9BUF5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBB6Q9BUF5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBB6Q9BUF5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBB6Q9BUF5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBB6Q9BUF5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBB6Q9BUF5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBB6Q9BUF5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBB6Q9BUF5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBB6Q9BUF5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBB6Q9BUF5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBB6Q9BUF5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBB6Q9BUF5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBB6Q9BUF5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBB6Q9BUF5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBB6Q9BUF5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBB6Q9BUF5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBB6Q9BUF5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TUBB6Q9BUF5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBB6Q9BUF5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBB6Q9BUF5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBB6Q9BUF5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBB6Q9BUF5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBB6Q9BUF5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUBB6Q9BUF5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBB6Q9BUF5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBB6Q9BUF5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBB6Q9BUF5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBB6Q9BUF5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBB6Q9BUF5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBB6Q9BUF5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TUBB6Q9BUF5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TUBB6Q9BUF5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TUBB6Q9BUF5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TUBB6Q9BUF5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBB6Q9BUF5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBB6Q9BUF5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBB6Q9BUF5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBB6Q9BUF5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBB6Q9BUF5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBB6Q9BUF5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBB6Q9BUF5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBB6Q9BUF5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBB6Q9BUF5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBB6Q9BUF5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms