Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TUBB6Q9BUF5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
TUBB6Q9BUF5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
TUBB6Q9BUF5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TUBB6Q9BUF5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TUBB6Q9BUF5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TUBB6Q9BUF5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TUBB6Q9BUF5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TUBB6Q9BUF5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TUBB6Q9BUF5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TUBB6Q9BUF5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TUBB6Q9BUF5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TUBB6Q9BUF5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TUBB6Q9BUF5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TUBB6Q9BUF5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
TUBB6Q9BUF5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TUBB6Q9BUF5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TUBB6Q9BUF5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
TUBB6Q9BUF5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TUBB6Q9BUF5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TUBB6Q9BUF5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TUBB6Q9BUF5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TUBB6Q9BUF5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TUBB6Q9BUF5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TUBB6Q9BUF5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TUBB6Q9BUF5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TUBB6Q9BUF5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TUBB6Q9BUF5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TUBB6Q9BUF5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TUBB6Q9BUF5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TUBB6Q9BUF5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TUBB6Q9BUF5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TUBB6Q9BUF5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TUBB6Q9BUF5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TUBB6Q9BUF5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TUBB6Q9BUF5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TUBB6Q9BUF5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TUBB6Q9BUF5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TUBB6Q9BUF5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TUBB6Q9BUF5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TUBB6Q9BUF5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TUBB6Q9BUF5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TUBB6Q9BUF5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TUBB6Q9BUF5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TUBB6Q9BUF5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TUBB6Q9BUF5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TUBB6Q9BUF5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TUBB6Q9BUF5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TUBB6Q9BUF5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TUBB6Q9BUF5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TUBB6Q9BUF5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TUBB6Q9BUF5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TUBB6Q9BUF5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TUBB6Q9BUF5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TUBB6Q9BUF5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TUBB6Q9BUF5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TUBB6Q9BUF5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TUBB6Q9BUF5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TUBB6Q9BUF5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TUBB6Q9BUF5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TUBB6Q9BUF5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TUBB6Q9BUF5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TUBB6Q9BUF5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TUBB6Q9BUF5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TUBB6Q9BUF5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TUBB6Q9BUF5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TUBB6Q9BUF5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TUBB6Q9BUF5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TUBB6Q9BUF5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TUBB6Q9BUF5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TUBB6Q9BUF5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TUBB6Q9BUF5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TUBB6Q9BUF5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TUBB6Q9BUF5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TUBB6Q9BUF5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TUBB6Q9BUF5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TUBB6Q9BUF5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBB6Q9BUF5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBB6Q9BUF5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TUBB6Q9BUF5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TUBB6Q9BUF5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TUBB6Q9BUF5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBB6Q9BUF5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBB6Q9BUF5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TUBB6Q9BUF5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TUBB6Q9BUF5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TUBB6Q9BUF5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TUBB6Q9BUF5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TUBB6Q9BUF5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TUBB6Q9BUF5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TUBB6Q9BUF5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TUBB6Q9BUF5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TUBB6Q9BUF5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TUBB6Q9BUF5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TUBB6Q9BUF5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TUBB6Q9BUF5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TUBB6Q9BUF5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TUBB6Q9BUF5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TUBB6Q9BUF5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TUBB6Q9BUF5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms