Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMIM12Q96EX1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMIM12Q96EX1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMIM12Q96EX1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM12Q96EX1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM12Q96EX1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM12Q96EX1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM12Q96EX1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMIM12Q96EX1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SMIM12Q96EX1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM12Q96EX1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM12Q96EX1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM12Q96EX1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM12Q96EX1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM12Q96EX1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM12Q96EX1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMIM12Q96EX1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SMIM12Q96EX1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM12Q96EX1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM12Q96EX1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SMIM12Q96EX1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM12Q96EX1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMIM12Q96EX1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM12Q96EX1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMIM12Q96EX1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM12Q96EX1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM12Q96EX1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM12Q96EX1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMIM12Q96EX1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM12Q96EX1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM12Q96EX1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM12Q96EX1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM12Q96EX1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM12Q96EX1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM12Q96EX1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMIM12Q96EX1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMIM12Q96EX1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMIM12Q96EX1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM12Q96EX1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM12Q96EX1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM12Q96EX1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMIM12Q96EX1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM12Q96EX1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMIM12Q96EX1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMIM12Q96EX1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMIM12Q96EX1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM12Q96EX1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMIM12Q96EX1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMIM12Q96EX1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM12Q96EX1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM12Q96EX1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMIM12Q96EX1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM12Q96EX1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMIM12Q96EX1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMIM12Q96EX1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM12Q96EX1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMIM12Q96EX1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMIM12Q96EX1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMIM12Q96EX1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMIM12Q96EX1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMIM12Q96EX1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM12Q96EX1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMIM12Q96EX1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMIM12Q96EX1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM12Q96EX1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM12Q96EX1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMIM12Q96EX1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMIM12Q96EX1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM12Q96EX1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMIM12Q96EX1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMIM12Q96EX1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM12Q96EX1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM12Q96EX1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM12Q96EX1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM12Q96EX1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM12Q96EX1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM12Q96EX1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM12Q96EX1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM12Q96EX1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM12Q96EX1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM12Q96EX1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM12Q96EX1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM12Q96EX1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM12Q96EX1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMIM12Q96EX1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM12Q96EX1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM12Q96EX1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM12Q96EX1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM12Q96EX1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM12Q96EX1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM12Q96EX1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM12Q96EX1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM12Q96EX1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM12Q96EX1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM12Q96EX1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM12Q96EX1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM12Q96EX1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM12Q96EX1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM12Q96EX1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM12Q96EX1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms