Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SNX21Q969T3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SNX21Q969T3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SNX21Q969T3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SNX21Q969T3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SNX21Q969T3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SNX21Q969T3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SNX21Q969T3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SNX21Q969T3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SNX21Q969T3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SNX21Q969T3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SNX21Q969T3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SNX21Q969T3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SNX21Q969T3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SNX21Q969T3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SNX21Q969T3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SNX21Q969T3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SNX21Q969T3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SNX21Q969T3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SNX21Q969T3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SNX21Q969T3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SNX21Q969T3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SNX21Q969T3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SNX21Q969T3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SNX21Q969T3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SNX21Q969T3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SNX21Q969T3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SNX21Q969T3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SNX21Q969T3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SNX21Q969T3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SNX21Q969T3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SNX21Q969T3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SNX21Q969T3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SNX21Q969T3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SNX21Q969T3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SNX21Q969T3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SNX21Q969T3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SNX21Q969T3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SNX21Q969T3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SNX21Q969T3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SNX21Q969T3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SNX21Q969T3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SNX21Q969T3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SNX21Q969T3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SNX21Q969T3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SNX21Q969T3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SNX21Q969T3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SNX21Q969T3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SNX21Q969T3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SNX21Q969T3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SNX21Q969T3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SNX21Q969T3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SNX21Q969T3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SNX21Q969T3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SNX21Q969T3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SNX21Q969T3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SNX21Q969T3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SNX21Q969T3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SNX21Q969T3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNX21Q969T3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SNX21Q969T3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SNX21Q969T3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SNX21Q969T3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SNX21Q969T3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SNX21Q969T3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SNX21Q969T3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SNX21Q969T3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SNX21Q969T3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SNX21Q969T3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SNX21Q969T3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SNX21Q969T3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SNX21Q969T3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SNX21Q969T3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SNX21Q969T3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SNX21Q969T3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SNX21Q969T3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SNX21Q969T3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
SNX21Q969T3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SNX21Q969T3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SNX21Q969T3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SNX21Q969T3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SNX21Q969T3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SNX21Q969T3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SNX21Q969T3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SNX21Q969T3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SNX21Q969T3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SNX21Q969T3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SNX21Q969T3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SNX21Q969T3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SNX21Q969T3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SNX21Q969T3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SNX21Q969T3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SNX21Q969T3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SNX21Q969T3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SNX21Q969T3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SNX21Q969T3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SNX21Q969T3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNX21Q969T3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNX21Q969T3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SNX21Q969T3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms