Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
SNX21Q969T3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
SNX21Q969T3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC39.81■■■■□ 3.96
SNX21Q969T3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
SNX21Q969T3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.35■■■■□ 3.89
SNX21Q969T3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
SNX21Q969T3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
SNX21Q969T3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SNX21Q969T3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SNX21Q969T3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SNX21Q969T3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
SNX21Q969T3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.38■■■■□ 3.73
SNX21Q969T3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SNX21Q969T3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SNX21Q969T3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SNX21Q969T3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SNX21Q969T3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SNX21Q969T3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SNX21Q969T3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SNX21Q969T3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SNX21Q969T3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
SNX21Q969T3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
SNX21Q969T3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
SNX21Q969T3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
SNX21Q969T3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SNX21Q969T3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
SNX21Q969T3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
SNX21Q969T3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SNX21Q969T3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SNX21Q969T3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
SNX21Q969T3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SNX21Q969T3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SNX21Q969T3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SNX21Q969T3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SNX21Q969T3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SNX21Q969T3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
SNX21Q969T3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SNX21Q969T3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SNX21Q969T3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SNX21Q969T3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SNX21Q969T3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SNX21Q969T3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SNX21Q969T3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SNX21Q969T3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
SNX21Q969T3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SNX21Q969T3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SNX21Q969T3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SNX21Q969T3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SNX21Q969T3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SNX21Q969T3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SNX21Q969T3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SNX21Q969T3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SNX21Q969T3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SNX21Q969T3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SNX21Q969T3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SNX21Q969T3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SNX21Q969T3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SNX21Q969T3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SNX21Q969T3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SNX21Q969T3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SNX21Q969T3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SNX21Q969T3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SNX21Q969T3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SNX21Q969T3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SNX21Q969T3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SNX21Q969T3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SNX21Q969T3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SNX21Q969T3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SNX21Q969T3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SNX21Q969T3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SNX21Q969T3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SNX21Q969T3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SNX21Q969T3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SNX21Q969T3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SNX21Q969T3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SNX21Q969T3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SNX21Q969T3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SNX21Q969T3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SNX21Q969T3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SNX21Q969T3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
SNX21Q969T3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SNX21Q969T3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SNX21Q969T3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SNX21Q969T3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
SNX21Q969T3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
SNX21Q969T3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
SNX21Q969T3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SNX21Q969T3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SNX21Q969T3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
SNX21Q969T3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SNX21Q969T3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SNX21Q969T3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SNX21Q969T3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SNX21Q969T3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SNX21Q969T3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SNX21Q969T3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SNX21Q969T3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SNX21Q969T3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SNX21Q969T3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SNX21Q969T3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms