Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC70Q6NSX1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC70Q6NSX1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC70Q6NSX1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC70Q6NSX1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC70Q6NSX1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC70Q6NSX1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC70Q6NSX1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC70Q6NSX1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC70Q6NSX1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC70Q6NSX1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC70Q6NSX1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC70Q6NSX1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC70Q6NSX1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC70Q6NSX1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC70Q6NSX1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC70Q6NSX1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC70Q6NSX1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC70Q6NSX1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC70Q6NSX1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC70Q6NSX1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC70Q6NSX1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC70Q6NSX1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC70Q6NSX1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC70Q6NSX1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC70Q6NSX1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
CCDC70Q6NSX1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC70Q6NSX1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC70Q6NSX1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC70Q6NSX1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC70Q6NSX1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC70Q6NSX1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC70Q6NSX1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC70Q6NSX1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC70Q6NSX1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC70Q6NSX1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC70Q6NSX1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC70Q6NSX1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC70Q6NSX1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC70Q6NSX1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC70Q6NSX1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC70Q6NSX1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC70Q6NSX1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC70Q6NSX1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCDC70Q6NSX1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC70Q6NSX1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC70Q6NSX1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC70Q6NSX1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC70Q6NSX1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC70Q6NSX1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC70Q6NSX1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC70Q6NSX1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC70Q6NSX1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC70Q6NSX1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC70Q6NSX1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC70Q6NSX1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC70Q6NSX1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC70Q6NSX1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC70Q6NSX1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC70Q6NSX1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC70Q6NSX1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC70Q6NSX1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC70Q6NSX1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC70Q6NSX1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC70Q6NSX1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CCDC70Q6NSX1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC70Q6NSX1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC70Q6NSX1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC70Q6NSX1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC70Q6NSX1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC70Q6NSX1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC70Q6NSX1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC70Q6NSX1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC70Q6NSX1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC70Q6NSX1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC70Q6NSX1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC70Q6NSX1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC70Q6NSX1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC70Q6NSX1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC70Q6NSX1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC70Q6NSX1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC70Q6NSX1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC70Q6NSX1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC70Q6NSX1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC70Q6NSX1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC70Q6NSX1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC70Q6NSX1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC70Q6NSX1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC70Q6NSX1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC70Q6NSX1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC70Q6NSX1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC70Q6NSX1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC70Q6NSX1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC70Q6NSX1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC70Q6NSX1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC70Q6NSX1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC70Q6NSX1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC70Q6NSX1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC70Q6NSX1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC70Q6NSX1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms