Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CCDC122Q5T0U0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC122Q5T0U0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC122Q5T0U0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
CCDC122Q5T0U0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC122Q5T0U0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC122Q5T0U0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC122Q5T0U0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC122Q5T0U0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CCDC122Q5T0U0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CCDC122Q5T0U0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC122Q5T0U0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC122Q5T0U0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC122Q5T0U0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC122Q5T0U0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC122Q5T0U0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC122Q5T0U0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC122Q5T0U0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC122Q5T0U0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC122Q5T0U0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC122Q5T0U0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC122Q5T0U0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC122Q5T0U0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC122Q5T0U0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC122Q5T0U0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC122Q5T0U0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC122Q5T0U0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC122Q5T0U0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC122Q5T0U0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC122Q5T0U0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC122Q5T0U0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC122Q5T0U0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC122Q5T0U0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC122Q5T0U0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC122Q5T0U0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CCDC122Q5T0U0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC122Q5T0U0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC122Q5T0U0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC122Q5T0U0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC122Q5T0U0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC122Q5T0U0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC122Q5T0U0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC122Q5T0U0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC122Q5T0U0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC122Q5T0U0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC122Q5T0U0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC122Q5T0U0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC122Q5T0U0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CCDC122Q5T0U0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC122Q5T0U0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC122Q5T0U0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC122Q5T0U0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC122Q5T0U0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC122Q5T0U0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC122Q5T0U0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC122Q5T0U0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC122Q5T0U0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC122Q5T0U0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC122Q5T0U0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC122Q5T0U0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC122Q5T0U0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC122Q5T0U0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC122Q5T0U0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC122Q5T0U0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC122Q5T0U0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC122Q5T0U0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC122Q5T0U0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC122Q5T0U0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC122Q5T0U0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC122Q5T0U0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC122Q5T0U0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC122Q5T0U0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC122Q5T0U0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC122Q5T0U0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC122Q5T0U0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC122Q5T0U0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC122Q5T0U0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC122Q5T0U0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC122Q5T0U0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC122Q5T0U0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC122Q5T0U0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC122Q5T0U0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC122Q5T0U0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC122Q5T0U0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC122Q5T0U0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC122Q5T0U0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC122Q5T0U0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCDC122Q5T0U0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCDC122Q5T0U0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC122Q5T0U0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC122Q5T0U0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC122Q5T0U0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC122Q5T0U0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC122Q5T0U0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC122Q5T0U0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC122Q5T0U0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC122Q5T0U0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC122Q5T0U0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC122Q5T0U0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC122Q5T0U0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms