Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB11BQ15907 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB11BQ15907 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11BQ15907 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11BQ15907 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11BQ15907 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11BQ15907 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11BQ15907 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11BQ15907 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB11BQ15907 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB11BQ15907 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11BQ15907 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11BQ15907 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11BQ15907 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB11BQ15907 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB11BQ15907 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB11BQ15907 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB11BQ15907 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB11BQ15907 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB11BQ15907 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11BQ15907 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB11BQ15907 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11BQ15907 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB11BQ15907 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11BQ15907 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB11BQ15907 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB11BQ15907 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB11BQ15907 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB11BQ15907 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB11BQ15907 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB11BQ15907 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11BQ15907 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11BQ15907 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11BQ15907 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11BQ15907 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11BQ15907 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11BQ15907 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB11BQ15907 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11BQ15907 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11BQ15907 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB11BQ15907 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB11BQ15907 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11BQ15907 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11BQ15907 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11BQ15907 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB11BQ15907 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB11BQ15907 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11BQ15907 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB11BQ15907 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11BQ15907 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB11BQ15907 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11BQ15907 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11BQ15907 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB11BQ15907 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11BQ15907 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB11BQ15907 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB11BQ15907 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11BQ15907 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11BQ15907 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB11BQ15907 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB11BQ15907 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11BQ15907 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB11BQ15907 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB11BQ15907 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAB11BQ15907 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAB11BQ15907 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB11BQ15907 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11BQ15907 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11BQ15907 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11BQ15907 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAB11BQ15907 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB11BQ15907 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11BQ15907 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11BQ15907 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAB11BQ15907 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11BQ15907 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB11BQ15907 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB11BQ15907 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB11BQ15907 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB11BQ15907 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB11BQ15907 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11BQ15907 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB11BQ15907 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11BQ15907 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB11BQ15907 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB11BQ15907 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB11BQ15907 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11BQ15907 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB11BQ15907 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB11BQ15907 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RAB11BQ15907 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB11BQ15907 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11BQ15907 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB11BQ15907 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB11BQ15907 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11BQ15907 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11BQ15907 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB11BQ15907 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB11BQ15907 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB11BQ15907 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
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