Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOBP62745 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RHOBP62745 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RHOBP62745 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RHOBP62745 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RHOBP62745 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RHOBP62745 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RHOBP62745 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBP62745 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOBP62745 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOBP62745 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOBP62745 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOBP62745 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOBP62745 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOBP62745 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOBP62745 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOBP62745 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHOBP62745 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOBP62745 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOBP62745 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOBP62745 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOBP62745 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOBP62745 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOBP62745 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOBP62745 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOBP62745 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOBP62745 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOBP62745 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOBP62745 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOBP62745 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOBP62745 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBP62745 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBP62745 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHOBP62745 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHOBP62745 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOBP62745 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOBP62745 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBP62745 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBP62745 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBP62745 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOBP62745 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOBP62745 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOBP62745 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOBP62745 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOBP62745 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOBP62745 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOBP62745 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOBP62745 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOBP62745 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOBP62745 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOBP62745 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOBP62745 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOBP62745 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOBP62745 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOBP62745 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOBP62745 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOBP62745 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOBP62745 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOBP62745 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOBP62745 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOBP62745 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RHOBP62745 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOBP62745 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOBP62745 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOBP62745 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOBP62745 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOBP62745 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOBP62745 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOBP62745 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOBP62745 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOBP62745 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOBP62745 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOBP62745 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOBP62745 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOBP62745 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOBP62745 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RHOBP62745 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBP62745 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RHOBP62745 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOBP62745 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RHOBP62745 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOBP62745 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RHOBP62745 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOBP62745 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RHOBP62745 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOBP62745 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RHOBP62745 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOBP62745 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOBP62745 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOBP62745 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RHOBP62745 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOBP62745 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RHOBP62745 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOBP62745 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RHOBP62745 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOBP62745 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RHOBP62745 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RHOBP62745 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOBP62745 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RHOBP62745 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms