Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAV3P56539 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CAV3P56539 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAV3P56539 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAV3P56539 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAV3P56539 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAV3P56539 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAV3P56539 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAV3P56539 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAV3P56539 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAV3P56539 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAV3P56539 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAV3P56539 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAV3P56539 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAV3P56539 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAV3P56539 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAV3P56539 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAV3P56539 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAV3P56539 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAV3P56539 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAV3P56539 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAV3P56539 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAV3P56539 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAV3P56539 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAV3P56539 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAV3P56539 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAV3P56539 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAV3P56539 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAV3P56539 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAV3P56539 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAV3P56539 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAV3P56539 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAV3P56539 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAV3P56539 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAV3P56539 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAV3P56539 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CAV3P56539 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAV3P56539 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAV3P56539 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAV3P56539 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAV3P56539 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAV3P56539 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAV3P56539 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAV3P56539 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAV3P56539 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAV3P56539 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAV3P56539 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAV3P56539 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAV3P56539 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAV3P56539 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAV3P56539 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAV3P56539 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAV3P56539 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAV3P56539 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAV3P56539 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAV3P56539 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAV3P56539 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAV3P56539 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAV3P56539 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAV3P56539 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAV3P56539 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAV3P56539 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAV3P56539 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAV3P56539 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAV3P56539 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAV3P56539 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAV3P56539 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAV3P56539 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAV3P56539 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAV3P56539 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAV3P56539 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAV3P56539 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAV3P56539 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAV3P56539 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAV3P56539 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CAV3P56539 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAV3P56539 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAV3P56539 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAV3P56539 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAV3P56539 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAV3P56539 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAV3P56539 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAV3P56539 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAV3P56539 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAV3P56539 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAV3P56539 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAV3P56539 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAV3P56539 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAV3P56539 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAV3P56539 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAV3P56539 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAV3P56539 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAV3P56539 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAV3P56539 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAV3P56539 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAV3P56539 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAV3P56539 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAV3P56539 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAV3P56539 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAV3P56539 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms