Protein–RNA interactions for Protein: P30838

ALDH3A1, Aldehyde dehydrogenase, dimeric NADP-preferring, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH3A1P30838 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALDH3A1P30838 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALDH3A1P30838 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALDH3A1P30838 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ALDH3A1P30838 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALDH3A1P30838 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALDH3A1P30838 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ALDH3A1P30838 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ALDH3A1P30838 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALDH3A1P30838 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALDH3A1P30838 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALDH3A1P30838 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALDH3A1P30838 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALDH3A1P30838 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALDH3A1P30838 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ALDH3A1P30838 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ALDH3A1P30838 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ALDH3A1P30838 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ALDH3A1P30838 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALDH3A1P30838 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ALDH3A1P30838 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALDH3A1P30838 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ALDH3A1P30838 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ALDH3A1P30838 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALDH3A1P30838 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALDH3A1P30838 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALDH3A1P30838 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALDH3A1P30838 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALDH3A1P30838 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALDH3A1P30838 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALDH3A1P30838 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALDH3A1P30838 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALDH3A1P30838 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALDH3A1P30838 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALDH3A1P30838 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ALDH3A1P30838 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ALDH3A1P30838 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALDH3A1P30838 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALDH3A1P30838 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALDH3A1P30838 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALDH3A1P30838 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALDH3A1P30838 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALDH3A1P30838 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ALDH3A1P30838 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALDH3A1P30838 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALDH3A1P30838 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALDH3A1P30838 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALDH3A1P30838 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALDH3A1P30838 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALDH3A1P30838 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALDH3A1P30838 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALDH3A1P30838 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALDH3A1P30838 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALDH3A1P30838 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALDH3A1P30838 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALDH3A1P30838 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALDH3A1P30838 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALDH3A1P30838 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALDH3A1P30838 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALDH3A1P30838 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALDH3A1P30838 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALDH3A1P30838 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALDH3A1P30838 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ALDH3A1P30838 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ALDH3A1P30838 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALDH3A1P30838 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALDH3A1P30838 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALDH3A1P30838 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALDH3A1P30838 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALDH3A1P30838 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALDH3A1P30838 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALDH3A1P30838 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALDH3A1P30838 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALDH3A1P30838 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALDH3A1P30838 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALDH3A1P30838 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALDH3A1P30838 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALDH3A1P30838 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALDH3A1P30838 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALDH3A1P30838 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALDH3A1P30838 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ALDH3A1P30838 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALDH3A1P30838 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
ALDH3A1P30838 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALDH3A1P30838 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALDH3A1P30838 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALDH3A1P30838 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ALDH3A1P30838 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ALDH3A1P30838 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALDH3A1P30838 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALDH3A1P30838 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALDH3A1P30838 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALDH3A1P30838 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALDH3A1P30838 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ALDH3A1P30838 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALDH3A1P30838 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALDH3A1P30838 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALDH3A1P30838 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALDH3A1P30838 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ALDH3A1P30838 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms