Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBBP0CG47 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBBP0CG47 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBBP0CG47 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBBP0CG47 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBBP0CG47 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBBP0CG47 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBBP0CG47 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBBP0CG47 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBBP0CG47 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBBP0CG47 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBBP0CG47 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBBP0CG47 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBBP0CG47 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBBP0CG47 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBBP0CG47 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBBP0CG47 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBBP0CG47 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBBP0CG47 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBBP0CG47 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBBP0CG47 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBBP0CG47 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBBP0CG47 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBBP0CG47 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBBP0CG47 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBBP0CG47 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBBP0CG47 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBBP0CG47 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBBP0CG47 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBBP0CG47 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBBP0CG47 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBBP0CG47 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBBP0CG47 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBBP0CG47 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBBP0CG47 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBBP0CG47 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBBP0CG47 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBBP0CG47 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBBP0CG47 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBBP0CG47 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBBP0CG47 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBBP0CG47 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBBP0CG47 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UBBP0CG47 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBBP0CG47 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBBP0CG47 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBBP0CG47 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBBP0CG47 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBBP0CG47 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBBP0CG47 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBBP0CG47 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBBP0CG47 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBBP0CG47 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBBP0CG47 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBBP0CG47 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBBP0CG47 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBBP0CG47 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBBP0CG47 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBBP0CG47 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBBP0CG47 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBBP0CG47 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBBP0CG47 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBBP0CG47 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBBP0CG47 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBBP0CG47 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBBP0CG47 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBBP0CG47 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBBP0CG47 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBBP0CG47 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBBP0CG47 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBBP0CG47 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBBP0CG47 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBBP0CG47 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBBP0CG47 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBBP0CG47 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBBP0CG47 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBBP0CG47 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBBP0CG47 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBBP0CG47 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBBP0CG47 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBBP0CG47 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBBP0CG47 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBBP0CG47 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBBP0CG47 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBBP0CG47 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBBP0CG47 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBBP0CG47 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBBP0CG47 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBBP0CG47 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBBP0CG47 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBBP0CG47 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBBP0CG47 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBBP0CG47 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBBP0CG47 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBBP0CG47 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBBP0CG47 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBBP0CG47 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBBP0CG47 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBBP0CG47 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBBP0CG47 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms