Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STAMBPO95630 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAMBPO95630 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAMBPO95630 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAMBPO95630 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAMBPO95630 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
STAMBPO95630 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAMBPO95630 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STAMBPO95630 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STAMBPO95630 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STAMBPO95630 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STAMBPO95630 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
STAMBPO95630 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
STAMBPO95630 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STAMBPO95630 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STAMBPO95630 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STAMBPO95630 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STAMBPO95630 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STAMBPO95630 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STAMBPO95630 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STAMBPO95630 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
STAMBPO95630 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STAMBPO95630 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
STAMBPO95630 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STAMBPO95630 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAMBPO95630 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
STAMBPO95630 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
STAMBPO95630 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STAMBPO95630 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STAMBPO95630 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STAMBPO95630 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
STAMBPO95630 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
STAMBPO95630 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
STAMBPO95630 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STAMBPO95630 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STAMBPO95630 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
STAMBPO95630 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
STAMBPO95630 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
STAMBPO95630 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
STAMBPO95630 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STAMBPO95630 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
STAMBPO95630 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STAMBPO95630 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STAMBPO95630 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STAMBPO95630 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STAMBPO95630 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STAMBPO95630 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STAMBPO95630 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STAMBPO95630 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STAMBPO95630 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STAMBPO95630 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STAMBPO95630 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STAMBPO95630 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STAMBPO95630 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STAMBPO95630 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STAMBPO95630 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STAMBPO95630 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STAMBPO95630 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STAMBPO95630 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAMBPO95630 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAMBPO95630 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
STAMBPO95630 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
STAMBPO95630 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAMBPO95630 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAMBPO95630 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
STAMBPO95630 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
STAMBPO95630 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STAMBPO95630 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STAMBPO95630 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
STAMBPO95630 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
STAMBPO95630 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
STAMBPO95630 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STAMBPO95630 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STAMBPO95630 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
STAMBPO95630 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STAMBPO95630 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STAMBPO95630 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STAMBPO95630 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
STAMBPO95630 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STAMBPO95630 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STAMBPO95630 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
STAMBPO95630 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STAMBPO95630 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STAMBPO95630 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
STAMBPO95630 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
STAMBPO95630 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
STAMBPO95630 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STAMBPO95630 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STAMBPO95630 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STAMBPO95630 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAMBPO95630 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAMBPO95630 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAMBPO95630 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAMBPO95630 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
STAMBPO95630 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAMBPO95630 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
STAMBPO95630 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STAMBPO95630 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STAMBPO95630 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STAMBPO95630 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms