Protein–RNA interactions for Protein: O14827

RASGRF2, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF2O14827 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RASGRF2O14827 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RASGRF2O14827 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RASGRF2O14827 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RASGRF2O14827 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RASGRF2O14827 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RASGRF2O14827 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RASGRF2O14827 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RASGRF2O14827 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RASGRF2O14827 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RASGRF2O14827 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RASGRF2O14827 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RASGRF2O14827 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RASGRF2O14827 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RASGRF2O14827 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RASGRF2O14827 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RASGRF2O14827 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RASGRF2O14827 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RASGRF2O14827 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RASGRF2O14827 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RASGRF2O14827 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RASGRF2O14827 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RASGRF2O14827 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RASGRF2O14827 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RASGRF2O14827 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RASGRF2O14827 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RASGRF2O14827 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RASGRF2O14827 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RASGRF2O14827 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RASGRF2O14827 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RASGRF2O14827 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RASGRF2O14827 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RASGRF2O14827 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RASGRF2O14827 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RASGRF2O14827 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RASGRF2O14827 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RASGRF2O14827 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RASGRF2O14827 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RASGRF2O14827 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RASGRF2O14827 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RASGRF2O14827 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RASGRF2O14827 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RASGRF2O14827 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RASGRF2O14827 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RASGRF2O14827 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RASGRF2O14827 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RASGRF2O14827 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RASGRF2O14827 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RASGRF2O14827 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RASGRF2O14827 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RASGRF2O14827 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RASGRF2O14827 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RASGRF2O14827 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RASGRF2O14827 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RASGRF2O14827 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RASGRF2O14827 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RASGRF2O14827 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RASGRF2O14827 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RASGRF2O14827 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RASGRF2O14827 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RASGRF2O14827 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RASGRF2O14827 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RASGRF2O14827 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RASGRF2O14827 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RASGRF2O14827 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RASGRF2O14827 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RASGRF2O14827 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RASGRF2O14827 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RASGRF2O14827 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RASGRF2O14827 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RASGRF2O14827 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RASGRF2O14827 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RASGRF2O14827 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RASGRF2O14827 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RASGRF2O14827 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RASGRF2O14827 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RASGRF2O14827 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RASGRF2O14827 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RASGRF2O14827 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RASGRF2O14827 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RASGRF2O14827 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RASGRF2O14827 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RASGRF2O14827 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RASGRF2O14827 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RASGRF2O14827 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RASGRF2O14827 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RASGRF2O14827 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RASGRF2O14827 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RASGRF2O14827 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RASGRF2O14827 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RASGRF2O14827 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RASGRF2O14827 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RASGRF2O14827 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RASGRF2O14827 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RASGRF2O14827 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RASGRF2O14827 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RASGRF2O14827 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RASGRF2O14827 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RASGRF2O14827 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RASGRF2O14827 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms