Protein–RNA interactions for Protein: A1A580

KRTAP23-1, Keratin-associated protein 23-1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP23-1A1A580 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP23-1A1A580 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP23-1A1A580 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP23-1A1A580 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP23-1A1A580 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP23-1A1A580 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP23-1A1A580 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP23-1A1A580 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP23-1A1A580 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP23-1A1A580 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP23-1A1A580 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP23-1A1A580 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP23-1A1A580 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP23-1A1A580 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP23-1A1A580 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP23-1A1A580 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP23-1A1A580 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP23-1A1A580 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP23-1A1A580 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP23-1A1A580 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP23-1A1A580 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP23-1A1A580 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP23-1A1A580 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP23-1A1A580 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP23-1A1A580 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP23-1A1A580 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KRTAP23-1A1A580 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP23-1A1A580 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP23-1A1A580 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP23-1A1A580 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP23-1A1A580 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP23-1A1A580 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP23-1A1A580 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP23-1A1A580 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP23-1A1A580 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP23-1A1A580 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP23-1A1A580 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP23-1A1A580 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
KRTAP23-1A1A580 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP23-1A1A580 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP23-1A1A580 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP23-1A1A580 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP23-1A1A580 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP23-1A1A580 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP23-1A1A580 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP23-1A1A580 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
KRTAP23-1A1A580 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
KRTAP23-1A1A580 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP23-1A1A580 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP23-1A1A580 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
KRTAP23-1A1A580 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP23-1A1A580 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP23-1A1A580 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP23-1A1A580 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP23-1A1A580 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
KRTAP23-1A1A580 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP23-1A1A580 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
KRTAP23-1A1A580 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP23-1A1A580 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP23-1A1A580 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP23-1A1A580 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
KRTAP23-1A1A580 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
KRTAP23-1A1A580 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP23-1A1A580 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP23-1A1A580 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP23-1A1A580 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP23-1A1A580 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP23-1A1A580 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP23-1A1A580 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP23-1A1A580 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP23-1A1A580 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP23-1A1A580 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP23-1A1A580 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP23-1A1A580 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP23-1A1A580 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP23-1A1A580 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP23-1A1A580 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP23-1A1A580 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
KRTAP23-1A1A580 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP23-1A1A580 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP23-1A1A580 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KRTAP23-1A1A580 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP23-1A1A580 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP23-1A1A580 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP23-1A1A580 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP23-1A1A580 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP23-1A1A580 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP23-1A1A580 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP23-1A1A580 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP23-1A1A580 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP23-1A1A580 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP23-1A1A580 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP23-1A1A580 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP23-1A1A580 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP23-1A1A580 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP23-1A1A580 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP23-1A1A580 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP23-1A1A580 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP23-1A1A580 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP23-1A1A580 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms