Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMS19Q96T76 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMS19Q96T76 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MMS19Q96T76 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MMS19Q96T76 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MMS19Q96T76 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms