RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000634710.2

NELFB-202, Transcript of negative elongation factor complex member B, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NELFB, Length 1,887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFB-202ENST00000634710 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.96■■■■■ 6.87
NELFB-202ENST00000634710 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.72■■■■■ 5.71
NELFB-202ENST00000634710 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.57■■■■■ 5.37
NELFB-202ENST00000634710 ABCC9O60706 1549 aa48.43■■■■■ 5.34
NELFB-202ENST00000634710 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.01■■■■■ 5.28
NELFB-202ENST00000634710 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.94■■■■■ 5.26
NELFB-202ENST00000634710 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.56■■■■■ 5.2
NELFB-202ENST00000634710 NACADO15069 1562 aa47.4■■■■■ 5.18
NELFB-202ENST00000634710 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.09■■■■■ 5.13
NELFB-202ENST00000634710 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.88■■■■■ 5.09
NELFB-202ENST00000634710 SCRIBQ14160 1630 aa46.56■■■■■ 5.04
NELFB-202ENST00000634710 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.09■■■■■ 4.97
NELFB-202ENST00000634710 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.71■■■■■ 4.91
NELFB-202ENST00000634710 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.61■■■■■ 4.89
NELFB-202ENST00000634710 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.08■■■■■ 4.81
NELFB-202ENST00000634710 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.88■■■■■ 4.78
NELFB-202ENST00000634710 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.78■■■■■ 4.76
NELFB-202ENST00000634710 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.77■■■■■ 4.76
NELFB-202ENST00000634710 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.75■■■■■ 4.75
NELFB-202ENST00000634710 SMARCA4P51532 1647 aa44.63■■■■■ 4.73
NELFB-202ENST00000634710 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
NELFB-202ENST00000634710 WIZO95785 1651 aa44.33■■■■■ 4.69
NELFB-202ENST00000634710 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.14■■■■■ 4.66
NELFB-202ENST00000634710 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.06■■■■■ 4.64
NELFB-202ENST00000634710 SMARCA2P51531 1590 aa43.99■■■■■ 4.63
NELFB-202ENST00000634710 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.86■■■■■ 4.61
NELFB-202ENST00000634710 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.81■■■■■ 4.6
NELFB-202ENST00000634710 NCAPD3P42695 1498 aa43.79■■■■■ 4.6
NELFB-202ENST00000634710 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.74■■■■■ 4.59
NELFB-202ENST00000634710 HMGXB3Q12766 1538 aa43.63■■■■■ 4.58
NELFB-202ENST00000634710 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.45■■■■■ 4.55
NELFB-202ENST00000634710 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.25■■■■■ 4.51
NELFB-202ENST00000634710 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.74■■■■■ 4.43
NELFB-202ENST00000634710 CFTRP13569 1480 aa42.66■■■■■ 4.42
NELFB-202ENST00000634710 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.62■■■■■ 4.41
NELFB-202ENST00000634710 NESP48681 1621 aa42.37■■■■■ 4.37
NELFB-202ENST00000634710 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.33■■■■■ 4.37
NELFB-202ENST00000634710 ABCC8Q09428 1581 aa42.32■■■■■ 4.36
NELFB-202ENST00000634710 PRDM2Q13029 1718 aa42.31■■■■■ 4.36
NELFB-202ENST00000634710 TRIM41Q8WV44 630 aa42.26■■■■■ 4.35
NELFB-202ENST00000634710 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.14■■■■■ 4.34
NELFB-202ENST00000634710 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.12■■■■■ 4.33
NELFB-202ENST00000634710 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.04■■■■■ 4.32
NELFB-202ENST00000634710 SYNJ1O43426 1573 aa41.96■■■■■ 4.31
NELFB-202ENST00000634710 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.88■■■■■ 4.29
NELFB-202ENST00000634710 CUX1P39880 1505 aa41.87■■■■■ 4.29
NELFB-202ENST00000634710 TOP2BQ02880 1626 aa41.85■■■■■ 4.29
NELFB-202ENST00000634710 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.81■■■■■ 4.28
NELFB-202ENST00000634710 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.8■■■■■ 4.28
NELFB-202ENST00000634710 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.63■■■■■ 4.26
NELFB-202ENST00000634710 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
NELFB-202ENST00000634710 TOPBP1Q92547 1522 aa41.61■■■■■ 4.25
NELFB-202ENST00000634710 ERCC6Q03468 1493 aa41.56■■■■■ 4.24
NELFB-202ENST00000634710 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.51■■■■■ 4.24
NELFB-202ENST00000634710 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.48■■■■■ 4.23
NELFB-202ENST00000634710 SOGA1O94964 1423 aa41.46■■■■■ 4.23
NELFB-202ENST00000634710 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.44■■■■■ 4.22
NELFB-202ENST00000634710 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
NELFB-202ENST00000634710 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.35■■■■■ 4.21
NELFB-202ENST00000634710 WDR62O43379 1518 aa41.31■■■■■ 4.2
NELFB-202ENST00000634710 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
NELFB-202ENST00000634710 EEA1Q15075 1411 aa41.27■■■■■ 4.2
NELFB-202ENST00000634710 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.23■■■■■ 4.19
NELFB-202ENST00000634710 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.14■■■■■ 4.18
NELFB-202ENST00000634710 KIF27Q86VH2 1401 aa41.12■■■■■ 4.17
NELFB-202ENST00000634710 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.12■■■■■ 4.17
NELFB-202ENST00000634710 CUX2O14529 1486 aa41.12■■■■■ 4.17
NELFB-202ENST00000634710 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.09■■■■■ 4.17
NELFB-202ENST00000634710 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
NELFB-202ENST00000634710 WDR97A6NE52 1622 aa40.99■■■■■ 4.15
NELFB-202ENST00000634710 IFT140Q96RY7 1462 aa40.93■■■■■ 4.14
NELFB-202ENST00000634710 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
NELFB-202ENST00000634710 IGF1RP08069 1367 aa40.87■■■■■ 4.13
NELFB-202ENST00000634710 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.84■■■■■ 4.13
NELFB-202ENST00000634710 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.8■■■■■ 4.12
NELFB-202ENST00000634710 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.77■■■■■ 4.12
NELFB-202ENST00000634710 PRXQ9BXM0 1461 aa40.74■■■■■ 4.11
NELFB-202ENST00000634710 KIF21BO75037 1637 aa40.74■■■■■ 4.11
NELFB-202ENST00000634710 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
NELFB-202ENST00000634710 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.71■■■■■ 4.116e-7■■■■□ 21.2
NELFB-202ENST00000634710 GOLGA3Q08378 1498 aa40.66■■■■■ 4.1
NELFB-202ENST00000634710 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.63■■■■■ 4.09
NELFB-202ENST00000634710 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.62■■■■■ 4.09
NELFB-202ENST00000634710 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.62■■■■■ 4.09
NELFB-202ENST00000634710 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
NELFB-202ENST00000634710 GRIN2BQ13224 1484 aa40.53■■■■■ 4.08
NELFB-202ENST00000634710 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.53■■■■■ 4.08
NELFB-202ENST00000634710 PBRM1Q86U86 1689 aa40.51■■■■■ 4.08
NELFB-202ENST00000634710 CUL7Q14999 1698 aa40.5■■■■■ 4.07
NELFB-202ENST00000634710 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.48■■■■■ 4.07
NELFB-202ENST00000634710 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.33■■■■■ 4.05
NELFB-202ENST00000634710 ADAMTS12P58397 1594 aa40.29■■■■■ 4.04
NELFB-202ENST00000634710 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.29■■■■■ 4.04
NELFB-202ENST00000634710 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
NELFB-202ENST00000634710 CEP162Q5TB80 1403 aa40.19■■■■■ 4.02
NELFB-202ENST00000634710 SYNJ2O15056 1496 aa40.09■■■■■ 4.01
NELFB-202ENST00000634710 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
NELFB-202ENST00000634710 GRIN2AQ12879 1464 aa40.02■■■■■ 4
NELFB-202ENST00000634710 CLIP1P30622 1438 aa40■■■■□ 3.99
NELFB-202ENST00000634710 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.99■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms