RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527137.2

GNPTG-204, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GNPTG, Length 386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTG-204ENST00000527137 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.34■■■■■ 7.09
GNPTG-204ENST00000527137 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.55■■■■■ 6
GNPTG-204ENST00000527137 ABCC9O60706 1549 aa50.65■■■■■ 5.7
GNPTG-204ENST00000527137 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.63■■■■■ 5.53
GNPTG-204ENST00000527137 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.2■■■■■ 5.47
GNPTG-204ENST00000527137 NACADO15069 1562 aa49.12■■■■■ 5.45
GNPTG-204ENST00000527137 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.09■■■■■ 5.45
GNPTG-204ENST00000527137 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.03■■■■■ 5.44
GNPTG-204ENST00000527137 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.99■■■■■ 5.43
GNPTG-204ENST00000527137 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.15■■■■■ 5.3
GNPTG-204ENST00000527137 SCRIBQ14160 1630 aa48.04■■■■■ 5.28
GNPTG-204ENST00000527137 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.57■■■■■ 5.21
GNPTG-204ENST00000527137 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.39■■■■■ 5.18
GNPTG-204ENST00000527137 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.36■■■■■ 5.17
GNPTG-204ENST00000527137 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.22■■■■■ 4.99
GNPTG-204ENST00000527137 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.17■■■■■ 4.98
GNPTG-204ENST00000527137 SMARCA4P51532 1647 aa45.98■■■■■ 4.95
GNPTG-204ENST00000527137 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.96■■■■■ 4.95
GNPTG-204ENST00000527137 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.88■■■■■ 4.94
GNPTG-204ENST00000527137 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.79■■■■■ 4.92
GNPTG-204ENST00000527137 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.7■■■■■ 4.91
GNPTG-204ENST00000527137 SMARCA2P51531 1590 aa45.45■■■■■ 4.87
GNPTG-204ENST00000527137 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.45■■■■■ 4.87
GNPTG-204ENST00000527137 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.44■■■■■ 4.86
GNPTG-204ENST00000527137 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.43■■■■■ 4.86
GNPTG-204ENST00000527137 WIZO95785 1651 aa45.42■■■■■ 4.86
GNPTG-204ENST00000527137 NCAPD3P42695 1498 aa45.24■■■■■ 4.83
GNPTG-204ENST00000527137 HMGXB3Q12766 1538 aa45.2■■■■■ 4.83
GNPTG-204ENST00000527137 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.14■■■■■ 4.82
GNPTG-204ENST00000527137 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.92■■■■■ 4.78
GNPTG-204ENST00000527137 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
GNPTG-204ENST00000527137 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.32■■■■■ 4.69
GNPTG-204ENST00000527137 NESP48681 1621 aa44.06■■■■■ 4.64
GNPTG-204ENST00000527137 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.03■■■■■ 4.64
GNPTG-204ENST00000527137 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.95■■■■■ 4.63
GNPTG-204ENST00000527137 PRDM2Q13029 1718 aa43.9■■■■■ 4.62
GNPTG-204ENST00000527137 CFTRP13569 1480 aa43.89■■■■■ 4.62
GNPTG-204ENST00000527137 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.7■■■■■ 4.59
GNPTG-204ENST00000527137 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.61■■■■■ 4.57
GNPTG-204ENST00000527137 ERCC6Q03468 1493 aa43.57■■■■■ 4.56
GNPTG-204ENST00000527137 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.54■■■■■ 4.56
GNPTG-204ENST00000527137 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.43■■■■■ 4.54
GNPTG-204ENST00000527137 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
GNPTG-204ENST00000527137 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.21■■■■■ 4.51
GNPTG-204ENST00000527137 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.09■■■■■ 4.49
GNPTG-204ENST00000527137 WDR62O43379 1518 aa43.07■■■■■ 4.48
GNPTG-204ENST00000527137 ABCC8Q09428 1581 aa43.05■■■■■ 4.48
GNPTG-204ENST00000527137 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.99■■■■■ 4.47
GNPTG-204ENST00000527137 TOPBP1Q92547 1522 aa42.96■■■■■ 4.47
GNPTG-204ENST00000527137 CUX1P39880 1505 aa42.93■■■■■ 4.46
GNPTG-204ENST00000527137 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.86■■■■■ 4.45
GNPTG-204ENST00000527137 SYNJ1O43426 1573 aa42.83■■■■■ 4.45
GNPTG-204ENST00000527137 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.8■■■■■ 4.44
GNPTG-204ENST00000527137 CUX2O14529 1486 aa42.8■■■■■ 4.44
GNPTG-204ENST00000527137 TOP2BQ02880 1626 aa42.76■■■■■ 4.44
GNPTG-204ENST00000527137 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.66■■■■■ 4.42
GNPTG-204ENST00000527137 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.62■■■■■ 4.41
GNPTG-204ENST00000527137 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
GNPTG-204ENST00000527137 IFT140Q96RY7 1462 aa42.44■■■■■ 4.38
GNPTG-204ENST00000527137 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.44■■■■■ 4.38
GNPTG-204ENST00000527137 WDR97A6NE52 1622 aa42.4■■■■■ 4.38
GNPTG-204ENST00000527137 SOGA1O94964 1423 aa42.39■■■■■ 4.38
GNPTG-204ENST00000527137 TRIM41Q8WV44 630 aa42.28■■■■■ 4.36
GNPTG-204ENST00000527137 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.27■■■■■ 4.36
GNPTG-204ENST00000527137 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
GNPTG-204ENST00000527137 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.23■■■■■ 4.35
GNPTG-204ENST00000527137 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.21■■■■■ 4.35
GNPTG-204ENST00000527137 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.1■■■■■ 4.33
GNPTG-204ENST00000527137 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.08■■■■■ 4.33
GNPTG-204ENST00000527137 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.06■■■■■ 4.32
GNPTG-204ENST00000527137 PBRM1Q86U86 1689 aa42.03■■■■■ 4.32
GNPTG-204ENST00000527137 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.96■■■■■ 4.31
GNPTG-204ENST00000527137 KIF27Q86VH2 1401 aa41.88■■■■■ 4.3
GNPTG-204ENST00000527137 GRIN2BQ13224 1484 aa41.85■■■■■ 4.29
GNPTG-204ENST00000527137 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.81■■■■■ 4.28
GNPTG-204ENST00000527137 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.74■■■■■ 4.27
GNPTG-204ENST00000527137 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.74■■■■■ 4.27
GNPTG-204ENST00000527137 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
GNPTG-204ENST00000527137 ADAMTS12P58397 1594 aa41.66■■■■■ 4.26
GNPTG-204ENST00000527137 CHD1O14646 1710 aa41.61■■■■■ 4.25
GNPTG-204ENST00000527137 CUL7Q14999 1698 aa41.6■■■■■ 4.25
GNPTG-204ENST00000527137 IGF1RP08069 1367 aa41.56■■■■■ 4.24
GNPTG-204ENST00000527137 EEA1Q15075 1411 aa41.55■■■■■ 4.24
GNPTG-204ENST00000527137 SYNJ2O15056 1496 aa41.49■■■■■ 4.23
GNPTG-204ENST00000527137 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
GNPTG-204ENST00000527137 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.47■■■■■ 4.23
GNPTG-204ENST00000527137 FBLN2P98095 1184 aa41.37■■■■■ 4.21
GNPTG-204ENST00000527137 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.37■■■■■ 4.21
GNPTG-204ENST00000527137 GRIN2AQ12879 1464 aa41.34■■■■■ 4.21
GNPTG-204ENST00000527137 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.34■■■■■ 4.21
GNPTG-204ENST00000527137 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
GNPTG-204ENST00000527137 PRXQ9BXM0 1461 aa41.28■■■■■ 4.2
GNPTG-204ENST00000527137 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.24■■■■■ 4.19
GNPTG-204ENST00000527137 KIF21BO75037 1637 aa41.21■■■■■ 4.19
GNPTG-204ENST00000527137 CEP170Q5SW79 1584 aa41.17■■■■■ 4.18
GNPTG-204ENST00000527137 NUP160Q12769 1436 aa41.09■■■■■ 4.17
GNPTG-204ENST00000527137 OSCARQ8IYS5 282 aa41.05■■■■■ 4.16
GNPTG-204ENST00000527137 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.04■■■■■ 4.16
GNPTG-204ENST00000527137 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.03■■■■■ 4.16
GNPTG-204ENST00000527137 GOLGA3Q08378 1498 aa40.96■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms