RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401787.7

KDM4C-203, Transcript of lysine demethylase 4C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KDM4C, Length 1,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4C-203ENST00000401787 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.98■■■■■ 7.03
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KDM4C-203ENST00000401787 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.26■■■■■ 5.48
KDM4C-203ENST00000401787 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.25■■■■■ 5.47
KDM4C-203ENST00000401787 NACADO15069 1562 aa48.86■■■■■ 5.41
KDM4C-203ENST00000401787 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.79■■■■■ 5.4
KDM4C-203ENST00000401787 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.75■■■■■ 5.39
KDM4C-203ENST00000401787 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.69■■■■■ 5.39
KDM4C-203ENST00000401787 SCRIBQ14160 1630 aa47.73■■■■■ 5.23
KDM4C-203ENST00000401787 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.69■■■■■ 5.22
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KDM4C-203ENST00000401787 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.19■■■■■ 5.15
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KDM4C-203ENST00000401787 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.89■■■■■ 4.94
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KDM4C-203ENST00000401787 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.64■■■■■ 4.9
KDM4C-203ENST00000401787 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.49■■■■■ 4.87
KDM4C-203ENST00000401787 SMARCA2P51531 1590 aa45.21■■■■■ 4.83
KDM4C-203ENST00000401787 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.21■■■■■ 4.83
KDM4C-203ENST00000401787 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.2■■■■■ 4.83
KDM4C-203ENST00000401787 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.1■■■■■ 4.81
KDM4C-203ENST00000401787 WIZO95785 1651 aa45.07■■■■■ 4.81
KDM4C-203ENST00000401787 NCAPD3P42695 1498 aa45.04■■■■■ 4.8
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KDM4C-203ENST00000401787 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.82■■■■■ 4.61
KDM4C-203ENST00000401787 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.8■■■■■ 4.6
KDM4C-203ENST00000401787 CFTRP13569 1480 aa43.67■■■■■ 4.58
KDM4C-203ENST00000401787 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.52■■■■■ 4.56
KDM4C-203ENST00000401787 ERCC6Q03468 1493 aa43.5■■■■■ 4.55
KDM4C-203ENST00000401787 PRDM2Q13029 1718 aa43.45■■■■■ 4.55
KDM4C-203ENST00000401787 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.36■■■■■ 4.53
KDM4C-203ENST00000401787 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.35■■■■■ 4.53
KDM4C-203ENST00000401787 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.25■■■■■ 4.51
KDM4C-203ENST00000401787 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.02■■■■■ 4.48
KDM4C-203ENST00000401787 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.98■■■■■ 4.47
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KDM4C-203ENST00000401787 WDR62O43379 1518 aa42.81■■■■■ 4.44
KDM4C-203ENST00000401787 ABCC8Q09428 1581 aa42.75■■■■■ 4.43
KDM4C-203ENST00000401787 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.73■■■■■ 4.43
KDM4C-203ENST00000401787 TOPBP1Q92547 1522 aa42.71■■■■■ 4.43
KDM4C-203ENST00000401787 CUX2O14529 1486 aa42.67■■■■■ 4.42
KDM4C-203ENST00000401787 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.65■■■■■ 4.42
KDM4C-203ENST00000401787 CUX1P39880 1505 aa42.64■■■■■ 4.42
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KDM4C-203ENST00000401787 TOP2BQ02880 1626 aa42.44■■■■■ 4.39
KDM4C-203ENST00000401787 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.42■■■■■ 4.38
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KDM4C-203ENST00000401787 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.39■■■■■ 4.38
KDM4C-203ENST00000401787 IFT140Q96RY7 1462 aa42.28■■■■■ 4.36
KDM4C-203ENST00000401787 SOGA1O94964 1423 aa42.28■■■■■ 4.36
KDM4C-203ENST00000401787 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.24■■■■■ 4.35
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KDM4C-203ENST00000401787 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
KDM4C-203ENST00000401787 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.05■■■■■ 4.32
KDM4C-203ENST00000401787 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
KDM4C-203ENST00000401787 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.99■■■■■ 4.31
KDM4C-203ENST00000401787 WDR97A6NE52 1622 aa41.97■■■■■ 4.31
KDM4C-203ENST00000401787 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
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KDM4C-203ENST00000401787 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.76■■■■■ 4.28
KDM4C-203ENST00000401787 KIF27Q86VH2 1401 aa41.72■■■■■ 4.27
KDM4C-203ENST00000401787 GRIN2BQ13224 1484 aa41.68■■■■■ 4.26
KDM4C-203ENST00000401787 PBRM1Q86U86 1689 aa41.67■■■■■ 4.26
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KDM4C-203ENST00000401787 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.53■■■■■ 4.24
KDM4C-203ENST00000401787 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.51■■■■■ 4.24
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KDM4C-203ENST00000401787 IGF1RP08069 1367 aa41.41■■■■■ 4.22
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KDM4C-203ENST00000401787 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
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KDM4C-203ENST00000401787 EEA1Q15075 1411 aa41.34■■■■■ 4.21
KDM4C-203ENST00000401787 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.32■■■■■ 4.2
KDM4C-203ENST00000401787 SYNJ2O15056 1496 aa41.32■■■■■ 4.2
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KDM4C-203ENST00000401787 CHD1O14646 1710 aa41.29■■■■■ 4.2
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KDM4C-203ENST00000401787 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.23■■■■■ 4.19
KDM4C-203ENST00000401787 GRIN2AQ12879 1464 aa41.14■■■■■ 4.18
KDM4C-203ENST00000401787 OSCARQ8IYS5 282 aa41.11■■■■■ 4.17
KDM4C-203ENST00000401787 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.05■■■■■ 4.16
KDM4C-203ENST00000401787 PRXQ9BXM0 1461 aa41.01■■■■■ 4.16
KDM4C-203ENST00000401787 CEP170Q5SW79 1584 aa40.89■■■■■ 4.14
KDM4C-203ENST00000401787 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.88■■■■■ 4.13
KDM4C-203ENST00000401787 NUP160Q12769 1436 aa40.87■■■■■ 4.13
KDM4C-203ENST00000401787 KIF21BO75037 1637 aa40.86■■■■■ 4.13
KDM4C-203ENST00000401787 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.76■■■■■ 4.12
KDM4C-203ENST00000401787 GOLGA3Q08378 1498 aa40.72■■■■■ 4.11
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