RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376726.3

ACSS1-202, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ACSS1, Length 2,244 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS1-202ENST00000376726 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.87■■■■■ 6.05
ACSS1-202ENST00000376726 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.56■■■■■ 4.88
ACSS1-202ENST00000376726 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
ACSS1-202ENST00000376726 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.03■■■■■ 4.64
ACSS1-202ENST00000376726 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.63■■■■■ 4.57
ACSS1-202ENST00000376726 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.59■■■■■ 4.57
ACSS1-202ENST00000376726 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.79■■■■■ 4.44
ACSS1-202ENST00000376726 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.7■■■■■ 4.43
ACSS1-202ENST00000376726 ABCC9O60706 1549 aa42.53■■■■■ 4.4
ACSS1-202ENST00000376726 NACADO15069 1562 aa42.25■■■■■ 4.35
ACSS1-202ENST00000376726 SCRIBQ14160 1630 aa42.24■■■■■ 4.35
ACSS1-202ENST00000376726 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.7■■■■■ 4.27
ACSS1-202ENST00000376726 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
ACSS1-202ENST00000376726 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.36■■■■■ 4.21
ACSS1-202ENST00000376726 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.14■■■■■ 4.18
ACSS1-202ENST00000376726 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.02■■■■■ 4.16
ACSS1-202ENST00000376726 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.97■■■■■ 4.15
ACSS1-202ENST00000376726 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.72■■■■■ 4.11
ACSS1-202ENST00000376726 WIZO95785 1651 aa40.7■■■■■ 4.11
ACSS1-202ENST00000376726 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.53■■■■■ 4.08
ACSS1-202ENST00000376726 SMARCA4P51532 1647 aa40.46■■■■■ 4.07
ACSS1-202ENST00000376726 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.37■■■■■ 4.05
ACSS1-202ENST00000376726 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
ACSS1-202ENST00000376726 TRIM41Q8WV44 630 aa40.07■■■■■ 4.01
ACSS1-202ENST00000376726 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.93■■■■□ 3.98
ACSS1-202ENST00000376726 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
ACSS1-202ENST00000376726 SMARCA2P51531 1590 aa39.89■■■■□ 3.98
ACSS1-202ENST00000376726 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.88■■■■□ 3.97
ACSS1-202ENST00000376726 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.85■■■■□ 3.97
ACSS1-202ENST00000376726 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.58■■■■□ 3.93
ACSS1-202ENST00000376726 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
ACSS1-202ENST00000376726 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
ACSS1-202ENST00000376726 ABCC8Q09428 1581 aa39.4■■■■□ 3.9
ACSS1-202ENST00000376726 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.09■■■■□ 3.85
ACSS1-202ENST00000376726 NCAPD3P42695 1498 aa39.04■■■■□ 3.84
ACSS1-202ENST00000376726 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.02■■■■□ 3.84
ACSS1-202ENST00000376726 HMGXB3Q12766 1538 aa39.02■■■■□ 3.84
ACSS1-202ENST00000376726 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.94■■■■□ 3.82
ACSS1-202ENST00000376726 HRCP23327 699 aa38.89■■■■□ 3.82
ACSS1-202ENST00000376726 SOGA1O94964 1423 aa38.85■■■■□ 3.81
ACSS1-202ENST00000376726 SYNJ1O43426 1573 aa38.79■■■■□ 3.8
ACSS1-202ENST00000376726 EEA1Q15075 1411 aa38.75■■■■□ 3.79
ACSS1-202ENST00000376726 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP38.69■■■■□ 3.78
ACSS1-202ENST00000376726 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.68■■■■□ 3.78
ACSS1-202ENST00000376726 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.6■■■■□ 3.77
ACSS1-202ENST00000376726 TOP2BQ02880 1626 aa38.48■■■■□ 3.75
ACSS1-202ENST00000376726 CFTRP13569 1480 aa38.45■■■■□ 3.75
ACSS1-202ENST00000376726 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.44■■■■□ 3.74
ACSS1-202ENST00000376726 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.41■■■■□ 3.74
ACSS1-202ENST00000376726 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.41■■■■□ 3.74
ACSS1-202ENST00000376726 GOLGA3Q08378 1498 aa38.34■■■■□ 3.73
ACSS1-202ENST00000376726 CEP162Q5TB80 1403 aa38.32■■■■□ 3.72
ACSS1-202ENST00000376726 KIF21BO75037 1637 aa38.25■■■■□ 3.71
ACSS1-202ENST00000376726 PRDM2Q13029 1718 aa38.25■■■■□ 3.71
ACSS1-202ENST00000376726 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.24■■■■□ 3.71
ACSS1-202ENST00000376726 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.24■■■■□ 3.71
ACSS1-202ENST00000376726 CUX1P39880 1505 aa38.22■■■■□ 3.71
ACSS1-202ENST00000376726 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.15■■■■□ 3.7
ACSS1-202ENST00000376726 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.05■■■■□ 3.68
ACSS1-202ENST00000376726 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.99■■■■□ 3.67
ACSS1-202ENST00000376726 KIF27Q86VH2 1401 aa37.85■■■■□ 3.65
ACSS1-202ENST00000376726 PRXQ9BXM0 1461 aa37.83■■■■□ 3.65
ACSS1-202ENST00000376726 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.81■■■■□ 3.64
ACSS1-202ENST00000376726 CLIP1P30622 1438 aa37.8■■■■□ 3.64
ACSS1-202ENST00000376726 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.75■■■■□ 3.63
ACSS1-202ENST00000376726 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.66■■■■□ 3.62
ACSS1-202ENST00000376726 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
ACSS1-202ENST00000376726 NESP48681 1621 aa37.64■■■■□ 3.62
ACSS1-202ENST00000376726 CUX2O14529 1486 aa37.6■■■■□ 3.61
ACSS1-202ENST00000376726 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.57■■■■□ 3.61
ACSS1-202ENST00000376726 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.6
ACSS1-202ENST00000376726 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.54■■■■□ 3.6
ACSS1-202ENST00000376726 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.52■■■■□ 3.6
ACSS1-202ENST00000376726 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
ACSS1-202ENST00000376726 IGF1RP08069 1367 aa37.47■■■■□ 3.59
ACSS1-202ENST00000376726 TOPBP1Q92547 1522 aa37.44■■■■□ 3.58
ACSS1-202ENST00000376726 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.41■■■■□ 3.58
ACSS1-202ENST00000376726 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.34■■■■□ 3.57
ACSS1-202ENST00000376726 ARAP1Q96P48 1450 aa37.33■■■■□ 3.57
ACSS1-202ENST00000376726 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.3■■■■□ 3.56
ACSS1-202ENST00000376726 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.29■■■■□ 3.56
ACSS1-202ENST00000376726 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.29■■■■□ 3.56
ACSS1-202ENST00000376726 APLP2Q06481 763 aa37.26■■■■□ 3.56
ACSS1-202ENST00000376726 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
ACSS1-202ENST00000376726 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.25■■■■□ 3.55
ACSS1-202ENST00000376726 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.16■■■■□ 3.54
ACSS1-202ENST00000376726 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
ACSS1-202ENST00000376726 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.13■■■■□ 3.53
ACSS1-202ENST00000376726 WDR97A6NE52 1622 aa37.08■■■■□ 3.53
ACSS1-202ENST00000376726 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP37.06■■■■□ 3.52
ACSS1-202ENST00000376726 CUL7Q14999 1698 aa37■■■■□ 3.51
ACSS1-202ENST00000376726 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.92■■■■□ 3.5
ACSS1-202ENST00000376726 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.87■■■■□ 3.49
ACSS1-202ENST00000376726 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
ACSS1-202ENST00000376726 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.82■■■■□ 3.49
ACSS1-202ENST00000376726 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
ACSS1-202ENST00000376726 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
ACSS1-202ENST00000376726 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.77■■■■□ 3.48
ACSS1-202ENST00000376726 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.73■■■■□ 3.47
ACSS1-202ENST00000376726 MAP3K1Q13233 1512 aa36.67■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 151.6 ms