RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296333.9

PIGX-201, Transcript of phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class X, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PIGX, Length 953 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGX-201ENST00000296333 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.53■■■■■ 7.6
PIGX-201ENST00000296333 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.08■■■■■ 6.57
PIGX-201ENST00000296333 ABCC9O60706 1549 aa55.62■■■■■ 6.49
PIGX-201ENST00000296333 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.19■■■■■ 6.1
PIGX-201ENST00000296333 NACADO15069 1562 aa52.91■■■■■ 6.06
PIGX-201ENST00000296333 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.42■■■■■ 5.98
PIGX-201ENST00000296333 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.35■■■■■ 5.97
PIGX-201ENST00000296333 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.95■■■■■ 5.91
PIGX-201ENST00000296333 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.92■■■■■ 5.9
PIGX-201ENST00000296333 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.84■■■■■ 5.89
PIGX-201ENST00000296333 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.77■■■■■ 5.88
PIGX-201ENST00000296333 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.74■■■■■ 5.87
PIGX-201ENST00000296333 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.6■■■■■ 5.85
PIGX-201ENST00000296333 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.08■■■■■ 5.77
PIGX-201ENST00000296333 SCRIBQ14160 1630 aa50.99■■■■■ 5.75
PIGX-201ENST00000296333 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.32■■■■■ 5.65
PIGX-201ENST00000296333 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.32■■■■■ 5.65
PIGX-201ENST00000296333 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.12■■■■■ 5.61
PIGX-201ENST00000296333 NCAPD3P42695 1498 aa48.81■■■■■ 5.4
PIGX-201ENST00000296333 SMARCA4P51532 1647 aa48.73■■■■■ 5.39
PIGX-201ENST00000296333 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.67■■■■■ 5.38
PIGX-201ENST00000296333 SMARCA2P51531 1590 aa48.61■■■■■ 5.37
PIGX-201ENST00000296333 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.56■■■■■ 5.36
PIGX-201ENST00000296333 HMGXB3Q12766 1538 aa48.53■■■■■ 5.36
PIGX-201ENST00000296333 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.32■■■■■ 5.33
PIGX-201ENST00000296333 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.23■■■■■ 5.31
PIGX-201ENST00000296333 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.15■■■■■ 5.3
PIGX-201ENST00000296333 ERCC6Q03468 1493 aa48.04■■■■■ 5.28
PIGX-201ENST00000296333 CUX2O14529 1486 aa47.93■■■■■ 5.26
PIGX-201ENST00000296333 NESP48681 1621 aa47.86■■■■■ 5.25
PIGX-201ENST00000296333 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.7■■■■■ 5.23
PIGX-201ENST00000296333 WIZO95785 1651 aa47.57■■■■■ 5.21
PIGX-201ENST00000296333 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.46■■■■■ 5.19
PIGX-201ENST00000296333 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.43■■■■■ 5.18
PIGX-201ENST00000296333 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.37■■■■■ 5.17
PIGX-201ENST00000296333 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.32■■■■■ 5.17
PIGX-201ENST00000296333 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.31■■■■■ 5.16
PIGX-201ENST00000296333 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.26■■■■■ 5.16
PIGX-201ENST00000296333 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.06■■■■■ 5.12
PIGX-201ENST00000296333 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.95■■■■■ 5.11
PIGX-201ENST00000296333 CFTRP13569 1480 aa46.87■■■■■ 5.09
PIGX-201ENST00000296333 WDR62O43379 1518 aa46.85■■■■■ 5.09
PIGX-201ENST00000296333 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.82■■■■■ 5.09
PIGX-201ENST00000296333 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.77■■■■■ 5.08
PIGX-201ENST00000296333 PRDM2Q13029 1718 aa46.48■■■■■ 5.03
PIGX-201ENST00000296333 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.45■■■■■ 5.03
PIGX-201ENST00000296333 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.37■■■■■ 5.01
PIGX-201ENST00000296333 TOPBP1Q92547 1522 aa45.93■■■■■ 4.94
PIGX-201ENST00000296333 ABCC8Q09428 1581 aa45.9■■■■■ 4.94
PIGX-201ENST00000296333 IFT140Q96RY7 1462 aa45.88■■■■■ 4.94
PIGX-201ENST00000296333 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.82■■■■■ 4.93
PIGX-201ENST00000296333 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.72■■■■■ 4.91
PIGX-201ENST00000296333 OSCARQ8IYS5 282 aa45.67■■■■■ 4.9
PIGX-201ENST00000296333 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.55■■■■■ 4.88
PIGX-201ENST00000296333 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.53■■■■■ 4.88
PIGX-201ENST00000296333 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.49■■■■■ 4.87
PIGX-201ENST00000296333 TRIM41Q8WV44 630 aa45.4■■■■■ 4.86
PIGX-201ENST00000296333 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.31■■■■■ 4.84
PIGX-201ENST00000296333 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.23■■■■■ 4.83
PIGX-201ENST00000296333 CUX1P39880 1505 aa45.23■■■■■ 4.83
PIGX-201ENST00000296333 SOGA1O94964 1423 aa45.23■■■■■ 4.83
PIGX-201ENST00000296333 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.23■■■■■ 4.83
PIGX-201ENST00000296333 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
PIGX-201ENST00000296333 WDR97A6NE52 1622 aa45.18■■■■■ 4.82
PIGX-201ENST00000296333 CHD1O14646 1710 aa45.12■■■■■ 4.81
PIGX-201ENST00000296333 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.11■■■■■ 4.81
PIGX-201ENST00000296333 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.11■■■■■ 4.81
PIGX-201ENST00000296333 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.11■■■■■ 4.81
PIGX-201ENST00000296333 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.07■■■■■ 4.8
PIGX-201ENST00000296333 ARHGEF11O15085 1522 aa45.01■■■■■ 4.8
PIGX-201ENST00000296333 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.91■■■■■ 4.78
PIGX-201ENST00000296333 FBLN2P98095 1184 aa44.88■■■■■ 4.78
PIGX-201ENST00000296333 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.87■■■■■ 4.77
PIGX-201ENST00000296333 GRIN2BQ13224 1484 aa44.86■■■■■ 4.77
PIGX-201ENST00000296333 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.77■■■■■ 4.76
PIGX-201ENST00000296333 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.72■■■■■ 4.75
PIGX-201ENST00000296333 PBRM1Q86U86 1689 aa44.71■■■■■ 4.75
PIGX-201ENST00000296333 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.7■■■■■ 4.75
PIGX-201ENST00000296333 SYNJ2O15056 1496 aa44.69■■■■■ 4.74
PIGX-201ENST00000296333 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.66■■■■■ 4.74
PIGX-201ENST00000296333 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.66■■■■■ 4.74
PIGX-201ENST00000296333 SYNJ1O43426 1573 aa44.65■■■■■ 4.74
PIGX-201ENST00000296333 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.64■■■■■ 4.74
PIGX-201ENST00000296333 TOP2BQ02880 1626 aa44.63■■■■■ 4.73
PIGX-201ENST00000296333 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.62■■■■■ 4.73
PIGX-201ENST00000296333 ARAP1Q96P48 1450 aa44.58■■■■■ 4.73
PIGX-201ENST00000296333 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.53■■■■■ 4.72
PIGX-201ENST00000296333 ADAMTS12P58397 1594 aa44.33■■■■■ 4.69
PIGX-201ENST00000296333 GRIN2AQ12879 1464 aa44.29■■■■■ 4.68
PIGX-201ENST00000296333 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.24■■■■■ 4.67
PIGX-201ENST00000296333 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.18■■■■■ 4.66
PIGX-201ENST00000296333 NUP160Q12769 1436 aa44.15■■■■■ 4.66
PIGX-201ENST00000296333 CEP170Q5SW79 1584 aa44.1■■■■■ 4.65
PIGX-201ENST00000296333 SHROOM2Q13796 1616 aa43.95■■■■■ 4.63
PIGX-201ENST00000296333 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
PIGX-201ENST00000296333 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.9■■■■■ 4.62
PIGX-201ENST00000296333 KIF27Q86VH2 1401 aa43.73■■■■■ 4.59
PIGX-201ENST00000296333 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.71■■■■■ 4.59
PIGX-201ENST00000296333 CUL7Q14999 1698 aa43.66■■■■■ 4.58
PIGX-201ENST00000296333 IGF1RP08069 1367 aa43.64■■■■■ 4.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms