RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539011.5

CIB2-202, Transcript of calcium and integrin binding family member 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CIB2, Length 1,511 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB2-202ENST00000539011 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.15■■■■■ 7.06
CIB2-202ENST00000539011 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.51■■■■■ 6
CIB2-202ENST00000539011 ABCC9O60706 1549 aa51.19■■■■■ 5.78
CIB2-202ENST00000539011 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.36■■■■■ 5.49
CIB2-202ENST00000539011 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.23■■■■■ 5.47
CIB2-202ENST00000539011 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.23■■■■■ 5.47
CIB2-202ENST00000539011 NACADO15069 1562 aa49.2■■■■■ 5.47
CIB2-202ENST00000539011 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.92■■■■■ 5.42
CIB2-202ENST00000539011 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.85■■■■■ 5.41
CIB2-202ENST00000539011 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.42■■■■■ 5.34
CIB2-202ENST00000539011 SCRIBQ14160 1630 aa48.04■■■■■ 5.28
CIB2-202ENST00000539011 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.91■■■■■ 5.26
CIB2-202ENST00000539011 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.82■■■■■ 5.25
CIB2-202ENST00000539011 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.13■■■■■ 5.14
CIB2-202ENST00000539011 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.78■■■■■ 5.08
CIB2-202ENST00000539011 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.55■■■■■ 5.04
CIB2-202ENST00000539011 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.33■■■■■ 5.01
CIB2-202ENST00000539011 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.15■■■■■ 4.98
CIB2-202ENST00000539011 SMARCA4P51532 1647 aa45.91■■■■■ 4.94
CIB2-202ENST00000539011 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.79■■■■■ 4.92
CIB2-202ENST00000539011 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.68■■■■■ 4.9
CIB2-202ENST00000539011 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.52■■■■■ 4.88
CIB2-202ENST00000539011 SMARCA2P51531 1590 aa45.42■■■■■ 4.86
CIB2-202ENST00000539011 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.39■■■■■ 4.86
CIB2-202ENST00000539011 NCAPD3P42695 1498 aa45.39■■■■■ 4.86
CIB2-202ENST00000539011 WIZO95785 1651 aa45.26■■■■■ 4.84
CIB2-202ENST00000539011 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.26■■■■■ 4.84
CIB2-202ENST00000539011 HMGXB3Q12766 1538 aa45.25■■■■■ 4.83
CIB2-202ENST00000539011 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.15■■■■■ 4.82
CIB2-202ENST00000539011 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.7■■■■■ 4.75
CIB2-202ENST00000539011 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
CIB2-202ENST00000539011 NESP48681 1621 aa44.43■■■■■ 4.7
CIB2-202ENST00000539011 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.2■■■■■ 4.67
CIB2-202ENST00000539011 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.14■■■■■ 4.66
CIB2-202ENST00000539011 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.07■■■■■ 4.64
CIB2-202ENST00000539011 ERCC6Q03468 1493 aa43.98■■■■■ 4.63
CIB2-202ENST00000539011 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.98■■■■■ 4.63
CIB2-202ENST00000539011 CFTRP13569 1480 aa43.9■■■■■ 4.62
CIB2-202ENST00000539011 PRDM2Q13029 1718 aa43.78■■■■■ 4.6
CIB2-202ENST00000539011 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.78■■■■■ 4.6
CIB2-202ENST00000539011 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.72■■■■■ 4.59
CIB2-202ENST00000539011 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.64■■■■■ 4.58
CIB2-202ENST00000539011 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.55■■■■■ 4.56
CIB2-202ENST00000539011 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.44■■■■■ 4.54
CIB2-202ENST00000539011 CUX2O14529 1486 aa43.39■■■■■ 4.54
CIB2-202ENST00000539011 WDR62O43379 1518 aa43.34■■■■■ 4.53
CIB2-202ENST00000539011 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
CIB2-202ENST00000539011 TOPBP1Q92547 1522 aa43.01■■■■■ 4.48
CIB2-202ENST00000539011 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.97■■■■■ 4.47
CIB2-202ENST00000539011 CUX1P39880 1505 aa42.84■■■■■ 4.45
CIB2-202ENST00000539011 ABCC8Q09428 1581 aa42.81■■■■■ 4.44
CIB2-202ENST00000539011 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.67■■■■■ 4.42
CIB2-202ENST00000539011 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.63■■■■■ 4.42
CIB2-202ENST00000539011 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.61■■■■■ 4.41
CIB2-202ENST00000539011 SYNJ1O43426 1573 aa42.59■■■■■ 4.41
CIB2-202ENST00000539011 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.58■■■■■ 4.41
CIB2-202ENST00000539011 IFT140Q96RY7 1462 aa42.57■■■■■ 4.41
CIB2-202ENST00000539011 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.53■■■■■ 4.4
CIB2-202ENST00000539011 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.53■■■■■ 4.4
CIB2-202ENST00000539011 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.52■■■■■ 4.4
CIB2-202ENST00000539011 TOP2BQ02880 1626 aa42.48■■■■■ 4.39
CIB2-202ENST00000539011 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
CIB2-202ENST00000539011 SOGA1O94964 1423 aa42.39■■■■■ 4.38
CIB2-202ENST00000539011 WDR97A6NE52 1622 aa42.37■■■■■ 4.37
CIB2-202ENST00000539011 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.26■■■■■ 4.36
CIB2-202ENST00000539011 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.22■■■■■ 4.35
CIB2-202ENST00000539011 TRIM41Q8WV44 630 aa42.21■■■■■ 4.35
CIB2-202ENST00000539011 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
CIB2-202ENST00000539011 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.14■■■■■ 4.34
CIB2-202ENST00000539011 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.08■■■■■ 4.33
CIB2-202ENST00000539011 PBRM1Q86U86 1689 aa42.03■■■■■ 4.32
CIB2-202ENST00000539011 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.94■■■■■ 4.3
CIB2-202ENST00000539011 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.9■■■■■ 4.3
CIB2-202ENST00000539011 CHD1O14646 1710 aa41.88■■■■■ 4.29
CIB2-202ENST00000539011 GRIN2BQ13224 1484 aa41.87■■■■■ 4.29
CIB2-202ENST00000539011 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.74■■■■■ 4.27
CIB2-202ENST00000539011 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
CIB2-202ENST00000539011 KIF27Q86VH2 1401 aa41.7■■■■■ 4.27
CIB2-202ENST00000539011 ADAMTS12P58397 1594 aa41.65■■■■■ 4.26
CIB2-202ENST00000539011 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.62■■■■■ 4.25
CIB2-202ENST00000539011 FBLN2P98095 1184 aa41.59■■■■■ 4.25
CIB2-202ENST00000539011 SYNJ2O15056 1496 aa41.59■■■■■ 4.25
CIB2-202ENST00000539011 OSCARQ8IYS5 282 aa41.54■■■■■ 4.24
CIB2-202ENST00000539011 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.52■■■■■ 4.24
CIB2-202ENST00000539011 IGF1RP08069 1367 aa41.46■■■■■ 4.23
CIB2-202ENST00000539011 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
CIB2-202ENST00000539011 EEA1Q15075 1411 aa41.44■■■■■ 4.22
CIB2-202ENST00000539011 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.42■■■■■ 4.22
CIB2-202ENST00000539011 GRIN2AQ12879 1464 aa41.4■■■■■ 4.22
CIB2-202ENST00000539011 CUL7Q14999 1698 aa41.34■■■■■ 4.21
CIB2-202ENST00000539011 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.33■■■■■ 4.21
CIB2-202ENST00000539011 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.3■■■■■ 4.2
CIB2-202ENST00000539011 CEP170Q5SW79 1584 aa41.29■■■■■ 4.2
CIB2-202ENST00000539011 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
CIB2-202ENST00000539011 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.22■■■■■ 4.19
CIB2-202ENST00000539011 NUP160Q12769 1436 aa41.18■■■■■ 4.18
CIB2-202ENST00000539011 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.14■■■■■ 4.18
CIB2-202ENST00000539011 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.14■■■■■ 4.18
CIB2-202ENST00000539011 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.14■■■■■ 4.18
CIB2-202ENST00000539011 PRXQ9BXM0 1461 aa41.09■■■■■ 4.17
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