RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382120.3

SOD3-201, Transcript of superoxide dismutase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOD3, Length 1,526 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD3-201ENST00000382120 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.29■■■■■ 7.24
SOD3-201ENST00000382120 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.52■■■■■ 6.16
SOD3-201ENST00000382120 ABCC9O60706 1549 aa52.34■■■■■ 5.97
SOD3-201ENST00000382120 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.35■■■■■ 5.65
SOD3-201ENST00000382120 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.28■■■■■ 5.64
SOD3-201ENST00000382120 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.27■■■■■ 5.64
SOD3-201ENST00000382120 NACADO15069 1562 aa50.23■■■■■ 5.63
SOD3-201ENST00000382120 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.89■■■■■ 5.58
SOD3-201ENST00000382120 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.78■■■■■ 5.56
SOD3-201ENST00000382120 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.38■■■■■ 5.49
SOD3-201ENST00000382120 SCRIBQ14160 1630 aa49■■■■■ 5.43
SOD3-201ENST00000382120 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.94■■■■■ 5.43
SOD3-201ENST00000382120 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.89■■■■■ 5.42
SOD3-201ENST00000382120 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.11■■■■■ 5.29
SOD3-201ENST00000382120 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.96■■■■■ 5.27
SOD3-201ENST00000382120 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.53■■■■■ 5.2
SOD3-201ENST00000382120 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.34■■■■■ 5.17
SOD3-201ENST00000382120 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.06■■■■■ 5.12
SOD3-201ENST00000382120 SMARCA4P51532 1647 aa46.8■■■■■ 5.08
SOD3-201ENST00000382120 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.67■■■■■ 5.06
SOD3-201ENST00000382120 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.56■■■■■ 5.04
SOD3-201ENST00000382120 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.46■■■■■ 5.03
SOD3-201ENST00000382120 SMARCA2P51531 1590 aa46.35■■■■■ 5.01
SOD3-201ENST00000382120 NCAPD3P42695 1498 aa46.34■■■■■ 5.01
SOD3-201ENST00000382120 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.26■■■■■ 5
SOD3-201ENST00000382120 HMGXB3Q12766 1538 aa46.16■■■■■ 4.98
SOD3-201ENST00000382120 WIZO95785 1651 aa46.11■■■■■ 4.97
SOD3-201ENST00000382120 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.08■■■■■ 4.97
SOD3-201ENST00000382120 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.01■■■■■ 4.96
SOD3-201ENST00000382120 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.51■■■■■ 4.88
SOD3-201ENST00000382120 NESP48681 1621 aa45.39■■■■■ 4.86
SOD3-201ENST00000382120 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.12■■■■■ 4.81
SOD3-201ENST00000382120 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.01■■■■■ 4.8
SOD3-201ENST00000382120 ERCC6Q03468 1493 aa45.01■■■■■ 4.8
SOD3-201ENST00000382120 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.01■■■■■ 4.8
SOD3-201ENST00000382120 CCDC88BA6NC98 1476 aa45■■■■■ 4.79
SOD3-201ENST00000382120 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.87■■■■■ 4.77
SOD3-201ENST00000382120 CFTRP13569 1480 aa44.8■■■■■ 4.76
SOD3-201ENST00000382120 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.76■■■■■ 4.76
SOD3-201ENST00000382120 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.63■■■■■ 4.73
SOD3-201ENST00000382120 PRDM2Q13029 1718 aa44.58■■■■■ 4.73
SOD3-201ENST00000382120 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.56■■■■■ 4.72
SOD3-201ENST00000382120 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.47■■■■■ 4.71
SOD3-201ENST00000382120 CUX2O14529 1486 aa44.41■■■■■ 4.7
SOD3-201ENST00000382120 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.37■■■■■ 4.69
SOD3-201ENST00000382120 WDR62O43379 1518 aa44.25■■■■■ 4.67
SOD3-201ENST00000382120 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.17■■■■■ 4.66
SOD3-201ENST00000382120 TOPBP1Q92547 1522 aa43.88■■■■■ 4.62
SOD3-201ENST00000382120 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.82■■■■■ 4.61
SOD3-201ENST00000382120 ABCC8Q09428 1581 aa43.71■■■■■ 4.59
SOD3-201ENST00000382120 CUX1P39880 1505 aa43.66■■■■■ 4.58
SOD3-201ENST00000382120 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.53■■■■■ 4.56
SOD3-201ENST00000382120 IFT140Q96RY7 1462 aa43.48■■■■■ 4.55
SOD3-201ENST00000382120 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.46■■■■■ 4.55
SOD3-201ENST00000382120 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.44■■■■■ 4.54
SOD3-201ENST00000382120 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.43■■■■■ 4.54
SOD3-201ENST00000382120 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.4■■■■■ 4.54
SOD3-201ENST00000382120 SYNJ1O43426 1573 aa43.36■■■■■ 4.53
SOD3-201ENST00000382120 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.34■■■■■ 4.53
SOD3-201ENST00000382120 SOGA1O94964 1423 aa43.3■■■■■ 4.52
SOD3-201ENST00000382120 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.29■■■■■ 4.52
SOD3-201ENST00000382120 TOP2BQ02880 1626 aa43.27■■■■■ 4.52
SOD3-201ENST00000382120 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.26■■■■■ 4.52
SOD3-201ENST00000382120 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.17■■■■■ 4.5
SOD3-201ENST00000382120 WDR97A6NE52 1622 aa43.15■■■■■ 4.5
SOD3-201ENST00000382120 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.1■■■■■ 4.49
SOD3-201ENST00000382120 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.98■■■■■ 4.47
SOD3-201ENST00000382120 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.9■■■■■ 4.46
SOD3-201ENST00000382120 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.88■■■■■ 4.45
SOD3-201ENST00000382120 PBRM1Q86U86 1689 aa42.83■■■■■ 4.45
SOD3-201ENST00000382120 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.81■■■■■ 4.44
SOD3-201ENST00000382120 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.77■■■■■ 4.44
SOD3-201ENST00000382120 GRIN2BQ13224 1484 aa42.76■■■■■ 4.43
SOD3-201ENST00000382120 CHD1O14646 1710 aa42.74■■■■■ 4.43
SOD3-201ENST00000382120 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.61■■■■■ 4.41
SOD3-201ENST00000382120 FBLN2P98095 1184 aa42.58■■■■■ 4.41
SOD3-201ENST00000382120 OSCARQ8IYS5 282 aa42.57■■■■■ 4.41
SOD3-201ENST00000382120 SYNJ2O15056 1496 aa42.47■■■■■ 4.39
SOD3-201ENST00000382120 ADAMTS12P58397 1594 aa42.45■■■■■ 4.39
SOD3-201ENST00000382120 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.44■■■■■ 4.39
SOD3-201ENST00000382120 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.41■■■■■ 4.38
SOD3-201ENST00000382120 TRIM41Q8WV44 630 aa42.39■■■■■ 4.38
SOD3-201ENST00000382120 KIF27Q86VH2 1401 aa42.36■■■■■ 4.37
SOD3-201ENST00000382120 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.27■■■■■ 4.36
SOD3-201ENST00000382120 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.25■■■■■ 4.35
SOD3-201ENST00000382120 GRIN2AQ12879 1464 aa42.25■■■■■ 4.35
SOD3-201ENST00000382120 IGF1RP08069 1367 aa42.24■■■■■ 4.35
SOD3-201ENST00000382120 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.19■■■■■ 4.34
SOD3-201ENST00000382120 CEP170Q5SW79 1584 aa42.13■■■■■ 4.33
SOD3-201ENST00000382120 CUL7Q14999 1698 aa42.12■■■■■ 4.33
SOD3-201ENST00000382120 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.06■■■■■ 4.32
SOD3-201ENST00000382120 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.06■■■■■ 4.32
SOD3-201ENST00000382120 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.06■■■■■ 4.32
SOD3-201ENST00000382120 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.05■■■■■ 4.32
SOD3-201ENST00000382120 NUP160Q12769 1436 aa42.03■■■■■ 4.32
SOD3-201ENST00000382120 ARHGEF11O15085 1522 aa42.02■■■■■ 4.32
SOD3-201ENST00000382120 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.96■■■■■ 4.31
SOD3-201ENST00000382120 SHROOM2Q13796 1616 aa41.75■■■■■ 4.27
SOD3-201ENST00000382120 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.75■■■■■ 4.27
SOD3-201ENST00000382120 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.74■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms