RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484274.1

MAP4K3-211, Transcript of mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MAP4K3, Length 407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K3-211ENST00000484274 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.52■■■■■ 7.28
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MAP4K3-211ENST00000484274 NACADO15069 1562 aa50.5■■■■■ 5.67
MAP4K3-211ENST00000484274 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.5■■■■■ 5.67
MAP4K3-211ENST00000484274 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.49■■■■■ 5.67
MAP4K3-211ENST00000484274 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.28■■■■■ 5.64
MAP4K3-211ENST00000484274 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.27■■■■■ 5.64
MAP4K3-211ENST00000484274 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.13■■■■■ 5.62
MAP4K3-211ENST00000484274 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.48■■■■■ 5.51
MAP4K3-211ENST00000484274 SCRIBQ14160 1630 aa49.05■■■■■ 5.44
MAP4K3-211ENST00000484274 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.02■■■■■ 5.44
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MAP4K3-211ENST00000484274 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.43■■■■■ 5.18
MAP4K3-211ENST00000484274 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.11■■■■■ 5.13
MAP4K3-211ENST00000484274 SMARCA4P51532 1647 aa46.97■■■■■ 5.11
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MAP4K3-211ENST00000484274 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.64■■■■■ 5.06
MAP4K3-211ENST00000484274 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.62■■■■■ 5.05
MAP4K3-211ENST00000484274 SMARCA2P51531 1590 aa46.59■■■■■ 5.05
MAP4K3-211ENST00000484274 NCAPD3P42695 1498 aa46.56■■■■■ 5.04
MAP4K3-211ENST00000484274 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.53■■■■■ 5.04
MAP4K3-211ENST00000484274 HMGXB3Q12766 1538 aa46.41■■■■■ 5.02
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MAP4K3-211ENST00000484274 WIZO95785 1651 aa46.18■■■■■ 4.98
MAP4K3-211ENST00000484274 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.15■■■■■ 4.98
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MAP4K3-211ENST00000484274 NESP48681 1621 aa45.38■■■■■ 4.86
MAP4K3-211ENST00000484274 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.34■■■■■ 4.85
MAP4K3-211ENST00000484274 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.17■■■■■ 4.82
MAP4K3-211ENST00000484274 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.11■■■■■ 4.81
MAP4K3-211ENST00000484274 ERCC6Q03468 1493 aa45.08■■■■■ 4.81
MAP4K3-211ENST00000484274 CFTRP13569 1480 aa44.98■■■■■ 4.79
MAP4K3-211ENST00000484274 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.97■■■■■ 4.79
MAP4K3-211ENST00000484274 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.94■■■■■ 4.79
MAP4K3-211ENST00000484274 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.94■■■■■ 4.78
MAP4K3-211ENST00000484274 PRDM2Q13029 1718 aa44.81■■■■■ 4.76
MAP4K3-211ENST00000484274 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.75■■■■■ 4.75
MAP4K3-211ENST00000484274 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.68■■■■■ 4.74
MAP4K3-211ENST00000484274 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.62■■■■■ 4.73
MAP4K3-211ENST00000484274 CUX2O14529 1486 aa44.6■■■■■ 4.73
MAP4K3-211ENST00000484274 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.53■■■■■ 4.72
MAP4K3-211ENST00000484274 WDR62O43379 1518 aa44.41■■■■■ 4.7
MAP4K3-211ENST00000484274 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.25■■■■■ 4.67
MAP4K3-211ENST00000484274 TOPBP1Q92547 1522 aa44.01■■■■■ 4.64
MAP4K3-211ENST00000484274 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.01■■■■■ 4.64
MAP4K3-211ENST00000484274 ABCC8Q09428 1581 aa44■■■■■ 4.63
MAP4K3-211ENST00000484274 CUX1P39880 1505 aa43.77■■■■■ 4.6
MAP4K3-211ENST00000484274 IFT140Q96RY7 1462 aa43.67■■■■■ 4.58
MAP4K3-211ENST00000484274 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.65■■■■■ 4.58
MAP4K3-211ENST00000484274 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.57■■■■■ 4.57
MAP4K3-211ENST00000484274 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.57■■■■■ 4.56
MAP4K3-211ENST00000484274 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.49■■■■■ 4.55
MAP4K3-211ENST00000484274 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.49■■■■■ 4.55
MAP4K3-211ENST00000484274 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.46■■■■■ 4.55
MAP4K3-211ENST00000484274 TOP2BQ02880 1626 aa43.45■■■■■ 4.55
MAP4K3-211ENST00000484274 SYNJ1O43426 1573 aa43.45■■■■■ 4.55
MAP4K3-211ENST00000484274 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.43■■■■■ 4.54
MAP4K3-211ENST00000484274 SOGA1O94964 1423 aa43.4■■■■■ 4.54
MAP4K3-211ENST00000484274 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
MAP4K3-211ENST00000484274 WDR97A6NE52 1622 aa43.33■■■■■ 4.53
MAP4K3-211ENST00000484274 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.19■■■■■ 4.518e-9■■□□□ 12.7
MAP4K3-211ENST00000484274 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.17■■■■■ 4.5
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MAP4K3-211ENST00000484274 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.04■■■■■ 4.48
MAP4K3-211ENST00000484274 PBRM1Q86U86 1689 aa42.96■■■■■ 4.47
MAP4K3-211ENST00000484274 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.94■■■■■ 4.47
MAP4K3-211ENST00000484274 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.93■■■■■ 4.46
MAP4K3-211ENST00000484274 GRIN2BQ13224 1484 aa42.92■■■■■ 4.46
MAP4K3-211ENST00000484274 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.85■■■■■ 4.45
MAP4K3-211ENST00000484274 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.81■■■■■ 4.44
MAP4K3-211ENST00000484274 CHD1O14646 1710 aa42.81■■■■■ 4.44
MAP4K3-211ENST00000484274 OSCARQ8IYS5 282 aa42.67■■■■■ 4.42
MAP4K3-211ENST00000484274 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.66■■■■■ 4.42
MAP4K3-211ENST00000484274 SYNJ2O15056 1496 aa42.62■■■■■ 4.41
MAP4K3-211ENST00000484274 ADAMTS12P58397 1594 aa42.6■■■■■ 4.41
MAP4K3-211ENST00000484274 KIF27Q86VH2 1401 aa42.56■■■■■ 4.4
MAP4K3-211ENST00000484274 FBLN2P98095 1184 aa42.54■■■■■ 4.4
MAP4K3-211ENST00000484274 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.48■■■■■ 4.39
MAP4K3-211ENST00000484274 TRIM41Q8WV44 630 aa42.48■■■■■ 4.39
MAP4K3-211ENST00000484274 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.46■■■■■ 4.39
MAP4K3-211ENST00000484274 GRIN2AQ12879 1464 aa42.39■■■■■ 4.38
MAP4K3-211ENST00000484274 IGF1RP08069 1367 aa42.35■■■■■ 4.37
MAP4K3-211ENST00000484274 CUL7Q14999 1698 aa42.35■■■■■ 4.37
MAP4K3-211ENST00000484274 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.32■■■■■ 4.37
MAP4K3-211ENST00000484274 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.25■■■■■ 4.35
MAP4K3-211ENST00000484274 NUP160Q12769 1436 aa42.2■■■■■ 4.35
MAP4K3-211ENST00000484274 CEP170Q5SW79 1584 aa42.2■■■■■ 4.35
MAP4K3-211ENST00000484274 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.13■■■■■ 4.33
MAP4K3-211ENST00000484274 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.12■■■■■ 4.33
MAP4K3-211ENST00000484274 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.12■■■■■ 4.33
MAP4K3-211ENST00000484274 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.12■■■■■ 4.33
MAP4K3-211ENST00000484274 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.1■■■■■ 4.33
MAP4K3-211ENST00000484274 ARHGEF11O15085 1522 aa42.1■■■■■ 4.33
MAP4K3-211ENST00000484274 SHROOM2Q13796 1616 aa41.92■■■■■ 4.3
MAP4K3-211ENST00000484274 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.91■■■■■ 4.3
MAP4K3-211ENST00000484274 EEA1Q15075 1411 aa41.88■■■■■ 4.3
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