RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587649.1

UBALD1-203, Transcript of UBA like domain containing 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBALD1, Length 707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBALD1-203ENST00000587649 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.5■■■■■ 7.6
UBALD1-203ENST00000587649 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.12■■■■■ 6.57
UBALD1-203ENST00000587649 ABCC9O60706 1549 aa55.82■■■■■ 6.53
UBALD1-203ENST00000587649 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.32■■■■■ 6.13
UBALD1-203ENST00000587649 NACADO15069 1562 aa53■■■■■ 6.07
UBALD1-203ENST00000587649 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.54■■■■■ 6
UBALD1-203ENST00000587649 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.37■■■■■ 5.97
UBALD1-203ENST00000587649 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.16■■■■■ 5.94
UBALD1-203ENST00000587649 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.06■■■■■ 5.92
UBALD1-203ENST00000587649 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.93■■■■■ 5.9
UBALD1-203ENST00000587649 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.85■■■■■ 5.89
UBALD1-203ENST00000587649 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.73■■■■■ 5.87
UBALD1-203ENST00000587649 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.7■■■■■ 5.87
UBALD1-203ENST00000587649 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.17■■■■■ 5.78
UBALD1-203ENST00000587649 SCRIBQ14160 1630 aa51.01■■■■■ 5.76
UBALD1-203ENST00000587649 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.48■■■■■ 5.67
UBALD1-203ENST00000587649 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.43■■■■■ 5.66
UBALD1-203ENST00000587649 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.32■■■■■ 5.65
UBALD1-203ENST00000587649 NCAPD3P42695 1498 aa48.89■■■■■ 5.42
UBALD1-203ENST00000587649 SMARCA4P51532 1647 aa48.74■■■■■ 5.39
UBALD1-203ENST00000587649 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.74■■■■■ 5.39
UBALD1-203ENST00000587649 SMARCA2P51531 1590 aa48.66■■■■■ 5.38
UBALD1-203ENST00000587649 HMGXB3Q12766 1538 aa48.58■■■■■ 5.37
UBALD1-203ENST00000587649 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.55■■■■■ 5.36
UBALD1-203ENST00000587649 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.32■■■■■ 5.33
UBALD1-203ENST00000587649 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.28■■■■■ 5.32
UBALD1-203ENST00000587649 ERCC6Q03468 1493 aa48.23■■■■■ 5.31
UBALD1-203ENST00000587649 CUX2O14529 1486 aa48.17■■■■■ 5.3
UBALD1-203ENST00000587649 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.11■■■■■ 5.29
UBALD1-203ENST00000587649 NESP48681 1621 aa47.97■■■■■ 5.27
UBALD1-203ENST00000587649 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.89■■■■■ 5.26
UBALD1-203ENST00000587649 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.79■■■■■ 5.24
UBALD1-203ENST00000587649 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.55■■■■■ 5.2
UBALD1-203ENST00000587649 WIZO95785 1651 aa47.54■■■■■ 5.2
UBALD1-203ENST00000587649 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.49■■■■■ 5.19
UBALD1-203ENST00000587649 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.42■■■■■ 5.18
UBALD1-203ENST00000587649 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.38■■■■■ 5.18
UBALD1-203ENST00000587649 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.18■■■■■ 5.14
UBALD1-203ENST00000587649 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.06■■■■■ 5.12
UBALD1-203ENST00000587649 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.01■■■■■ 5.12
UBALD1-203ENST00000587649 WDR62O43379 1518 aa46.96■■■■■ 5.11
UBALD1-203ENST00000587649 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.9■■■■■ 5.1
UBALD1-203ENST00000587649 CFTRP13569 1480 aa46.89■■■■■ 5.1
UBALD1-203ENST00000587649 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.84■■■■■ 5.09
UBALD1-203ENST00000587649 PRDM2Q13029 1718 aa46.49■■■■■ 5.03
UBALD1-203ENST00000587649 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.43■■■■■ 5.02
UBALD1-203ENST00000587649 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.43■■■■■ 5.02
UBALD1-203ENST00000587649 IFT140Q96RY7 1462 aa45.98■■■■■ 4.95
UBALD1-203ENST00000587649 TOPBP1Q92547 1522 aa45.97■■■■■ 4.95
UBALD1-203ENST00000587649 ABCC8Q09428 1581 aa45.96■■■■■ 4.95
UBALD1-203ENST00000587649 OSCARQ8IYS5 282 aa45.92■■■■■ 4.94
UBALD1-203ENST00000587649 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.85■■■■■ 4.93
UBALD1-203ENST00000587649 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.8■■■■■ 4.92
UBALD1-203ENST00000587649 TRIM41Q8WV44 630 aa45.77■■■■■ 4.92
UBALD1-203ENST00000587649 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.62■■■■■ 4.89
UBALD1-203ENST00000587649 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.57■■■■■ 4.89
UBALD1-203ENST00000587649 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.51■■■■■ 4.88
UBALD1-203ENST00000587649 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.4■■■■■ 4.86
UBALD1-203ENST00000587649 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.32■■■■■ 4.85
UBALD1-203ENST00000587649 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.32■■■■■ 4.85
UBALD1-203ENST00000587649 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.32■■■■■ 4.85
UBALD1-203ENST00000587649 SOGA1O94964 1423 aa45.29■■■■■ 4.84
UBALD1-203ENST00000587649 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.28■■■■■ 4.84
UBALD1-203ENST00000587649 CHD1O14646 1710 aa45.24■■■■■ 4.83
UBALD1-203ENST00000587649 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.23■■■■■ 4.83
UBALD1-203ENST00000587649 WDR97A6NE52 1622 aa45.23■■■■■ 4.83
UBALD1-203ENST00000587649 CUX1P39880 1505 aa45.21■■■■■ 4.83
UBALD1-203ENST00000587649 ARHGEF11O15085 1522 aa45.2■■■■■ 4.83
UBALD1-203ENST00000587649 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.14■■■■■ 4.82
UBALD1-203ENST00000587649 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.09■■■■■ 4.81
UBALD1-203ENST00000587649 FBLN2P98095 1184 aa45.04■■■■■ 4.8
UBALD1-203ENST00000587649 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.98■■■■■ 4.79
UBALD1-203ENST00000587649 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.94■■■■■ 4.78
UBALD1-203ENST00000587649 GRIN2BQ13224 1484 aa44.92■■■■■ 4.78
UBALD1-203ENST00000587649 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.79■■■■■ 4.76
UBALD1-203ENST00000587649 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.78■■■■■ 4.76
UBALD1-203ENST00000587649 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.77■■■■■ 4.76
UBALD1-203ENST00000587649 SYNJ2O15056 1496 aa44.77■■■■■ 4.76
UBALD1-203ENST00000587649 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.77■■■■■ 4.76
UBALD1-203ENST00000587649 SYNJ1O43426 1573 aa44.77■■■■■ 4.76
UBALD1-203ENST00000587649 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.75■■■■■ 4.76
UBALD1-203ENST00000587649 PBRM1Q86U86 1689 aa44.75■■■■■ 4.75
UBALD1-203ENST00000587649 ARAP1Q96P48 1450 aa44.74■■■■■ 4.75
UBALD1-203ENST00000587649 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.7■■■■■ 4.75
UBALD1-203ENST00000587649 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.61■■■■■ 4.73
UBALD1-203ENST00000587649 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.59■■■■■ 4.73
UBALD1-203ENST00000587649 TOP2BQ02880 1626 aa44.57■■■■■ 4.73
UBALD1-203ENST00000587649 ADAMTS12P58397 1594 aa44.34■■■■■ 4.69
UBALD1-203ENST00000587649 GRIN2AQ12879 1464 aa44.34■■■■■ 4.69
UBALD1-203ENST00000587649 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.24■■■■■ 4.67
UBALD1-203ENST00000587649 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.23■■■■■ 4.67
UBALD1-203ENST00000587649 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.23■■■■■ 4.67
UBALD1-203ENST00000587649 NUP160Q12769 1436 aa44.19■■■■■ 4.66
UBALD1-203ENST00000587649 CEP170Q5SW79 1584 aa44.14■■■■■ 4.66
UBALD1-203ENST00000587649 SHROOM2Q13796 1616 aa44■■■■■ 4.63
UBALD1-203ENST00000587649 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.98■■■■■ 4.63
UBALD1-203ENST00000587649 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.72■■■■■ 4.59
UBALD1-203ENST00000587649 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.71■■■■■ 4.59
UBALD1-203ENST00000587649 KIF27Q86VH2 1401 aa43.7■■■■■ 4.59
UBALD1-203ENST00000587649 JPH4Q96JJ6 628 aa43.68■■■■■ 4.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms