RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007699.9

YBX2-201, Transcript of Y-box binding protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene YBX2, Length 1,590 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2-201ENST00000007699 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.68■■■■■ 7.3
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YBX2-201ENST00000007699 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.27■■■■■ 5.8
YBX2-201ENST00000007699 NACADO15069 1562 aa51.09■■■■■ 5.77
YBX2-201ENST00000007699 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.73■■■■■ 5.71
YBX2-201ENST00000007699 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.65■■■■■ 5.7
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YBX2-201ENST00000007699 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.22■■■■■ 5.63
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YBX2-201ENST00000007699 SCRIBQ14160 1630 aa49.38■■■■■ 5.5
YBX2-201ENST00000007699 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.2■■■■■ 5.47
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YBX2-201ENST00000007699 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.42■■■■■ 5.34
YBX2-201ENST00000007699 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.13■■■■■ 5.3
YBX2-201ENST00000007699 SMARCA4P51532 1647 aa47.23■■■■■ 5.15
YBX2-201ENST00000007699 NCAPD3P42695 1498 aa47.14■■■■■ 5.14
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YBX2-201ENST00000007699 SMARCA2P51531 1590 aa46.99■■■■■ 5.11
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YBX2-201ENST00000007699 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.75■■■■■ 5.07
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YBX2-201ENST00000007699 ERCC6Q03468 1493 aa46.11■■■■■ 4.97
YBX2-201ENST00000007699 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46■■■■■ 4.96
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YBX2-201ENST00000007699 CUX2O14529 1486 aa45.89■■■■■ 4.94
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YBX2-201ENST00000007699 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.18■■■■■ 4.82
YBX2-201ENST00000007699 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.17■■■■■ 4.82
YBX2-201ENST00000007699 WDR62O43379 1518 aa45.14■■■■■ 4.82
YBX2-201ENST00000007699 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.14■■■■■ 4.82
YBX2-201ENST00000007699 PRDM2Q13029 1718 aa45.08■■■■■ 4.81
YBX2-201ENST00000007699 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.07■■■■■ 4.81
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YBX2-201ENST00000007699 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.78■■■■■ 4.76
YBX2-201ENST00000007699 TOPBP1Q92547 1522 aa44.42■■■■■ 4.7
YBX2-201ENST00000007699 ABCC8Q09428 1581 aa44.37■■■■■ 4.69
YBX2-201ENST00000007699 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.33■■■■■ 4.69
YBX2-201ENST00000007699 IFT140Q96RY7 1462 aa44.25■■■■■ 4.67
YBX2-201ENST00000007699 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.11■■■■■ 4.65
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YBX2-201ENST00000007699 TOP2BQ02880 1626 aa43.39■■■■■ 4.54
YBX2-201ENST00000007699 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.38■■■■■ 4.53
YBX2-201ENST00000007699 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.36■■■■■ 4.53
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YBX2-201ENST00000007699 SYNJ1O43426 1573 aa43.34■■■■■ 4.53
YBX2-201ENST00000007699 GRIN2BQ13224 1484 aa43.34■■■■■ 4.53
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YBX2-201ENST00000007699 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.27■■■■■ 4.52
YBX2-201ENST00000007699 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.27■■■■■ 4.52
YBX2-201ENST00000007699 TRIM41Q8WV44 630 aa43.26■■■■■ 4.52
YBX2-201ENST00000007699 FBLN2P98095 1184 aa43.25■■■■■ 4.51
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YBX2-201ENST00000007699 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.72■■■■■ 4.43
YBX2-201ENST00000007699 NUP160Q12769 1436 aa42.65■■■■■ 4.42
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YBX2-201ENST00000007699 SHROOM2Q13796 1616 aa42.45■■■■■ 4.39
YBX2-201ENST00000007699 IGF1RP08069 1367 aa42.4■■■■■ 4.38
YBX2-201ENST00000007699 CUL7Q14999 1698 aa42.38■■■■■ 4.38
YBX2-201ENST00000007699 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.38■■■■■ 4.37
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YBX2-201ENST00000007699 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.17■■■■■ 4.34
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