RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419349.1

GPX1-201, Transcript of glutathione peroxidase 1, humanhuman

BASIC

Gene GPX1, Length 1,106 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPX1-201ENST00000419349 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.86■■■■■ 7.49
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GPX1-201ENST00000419349 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.25■■■■■ 5.63
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GPX1-201ENST00000419349 SMARCA4P51532 1647 aa48.18■■■■■ 5.3
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GPX1-201ENST00000419349 SMARCA2P51531 1590 aa48.01■■■■■ 5.28
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GPX1-201ENST00000419349 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.67■■■■■ 5.22
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GPX1-201ENST00000419349 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.06■■■■■ 5.12
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GPX1-201ENST00000419349 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.75■■■■■ 5.07
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GPX1-201ENST00000419349 WDR62O43379 1518 aa46.2■■■■■ 4.99
GPX1-201ENST00000419349 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.05■■■■■ 4.96
GPX1-201ENST00000419349 PRDM2Q13029 1718 aa45.92■■■■■ 4.94
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GPX1-201ENST00000419349 ABCC8Q09428 1581 aa45.34■■■■■ 4.85
GPX1-201ENST00000419349 IFT140Q96RY7 1462 aa45.3■■■■■ 4.84
GPX1-201ENST00000419349 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.28■■■■■ 4.84
GPX1-201ENST00000419349 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.19■■■■■ 4.82
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GPX1-201ENST00000419349 OSCARQ8IYS5 282 aa45.13■■■■■ 4.82
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GPX1-201ENST00000419349 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.75■■■■■ 4.75
GPX1-201ENST00000419349 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.65■■■■■ 4.74
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GPX1-201ENST00000419349 FBLN2P98095 1184 aa44.53■■■■■ 4.72
GPX1-201ENST00000419349 WDR97A6NE52 1622 aa44.53■■■■■ 4.72
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GPX1-201ENST00000419349 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.49■■■■■ 4.71
GPX1-201ENST00000419349 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.49■■■■■ 4.71
GPX1-201ENST00000419349 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.4■■■■■ 4.7
GPX1-201ENST00000419349 ARHGEF11O15085 1522 aa44.37■■■■■ 4.69
GPX1-201ENST00000419349 GRIN2BQ13224 1484 aa44.34■■■■■ 4.69
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GPX1-201ENST00000419349 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.25■■■■■ 4.67
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GPX1-201ENST00000419349 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.17■■■■■ 4.66
GPX1-201ENST00000419349 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.16■■■■■ 4.66
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GPX1-201ENST00000419349 SYNJ1O43426 1573 aa44.14■■■■■ 4.66
GPX1-201ENST00000419349 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.06■■■■■ 4.64
GPX1-201ENST00000419349 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.04■■■■■ 4.64
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GPX1-201ENST00000419349 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.69■■■■■ 4.58
GPX1-201ENST00000419349 CEP170Q5SW79 1584 aa43.59■■■■■ 4.57
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GPX1-201ENST00000419349 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.41■■■■■ 4.54
GPX1-201ENST00000419349 SHROOM2Q13796 1616 aa43.36■■■■■ 4.53
GPX1-201ENST00000419349 KIF27Q86VH2 1401 aa43.33■■■■■ 4.53
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GPX1-201ENST00000419349 CUL7Q14999 1698 aa43.18■■■■■ 4.5
GPX1-201ENST00000419349 JPH4Q96JJ6 628 aa43.18■■■■■ 4.5
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