RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373042.4

C1orf122-201, Transcript of chromosome 1 open reading frame 122, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene C1orf122, Length 973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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C1orf122-201ENST00000373042 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.52■■■■■ 5.04
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C1orf122-201ENST00000373042 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.75■■■■■ 4.91
C1orf122-201ENST00000373042 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.74■■■■■ 4.91
C1orf122-201ENST00000373042 WDR62O43379 1518 aa45.63■■■■■ 4.9
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C1orf122-201ENST00000373042 PRDM2Q13029 1718 aa45.38■■■■■ 4.86
C1orf122-201ENST00000373042 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.26■■■■■ 4.84
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C1orf122-201ENST00000373042 TOPBP1Q92547 1522 aa44.91■■■■■ 4.78
C1orf122-201ENST00000373042 IFT140Q96RY7 1462 aa44.82■■■■■ 4.77
C1orf122-201ENST00000373042 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.81■■■■■ 4.76
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C1orf122-201ENST00000373042 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.29■■■■■ 4.68
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C1orf122-201ENST00000373042 WDR97A6NE52 1622 aa44.11■■■■■ 4.65
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C1orf122-201ENST00000373042 FBLN2P98095 1184 aa44.01■■■■■ 4.64
C1orf122-201ENST00000373042 CHD1O14646 1710 aa43.96■■■■■ 4.63
C1orf122-201ENST00000373042 GRIN2BQ13224 1484 aa43.89■■■■■ 4.62
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C1orf122-201ENST00000373042 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.84■■■■■ 4.61
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C1orf122-201ENST00000373042 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.82■■■■■ 4.6
C1orf122-201ENST00000373042 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.79■■■■■ 4.6
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C1orf122-201ENST00000373042 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.77■■■■■ 4.6
C1orf122-201ENST00000373042 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.77■■■■■ 4.6
C1orf122-201ENST00000373042 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.77■■■■■ 4.6
C1orf122-201ENST00000373042 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.76■■■■■ 4.6
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C1orf122-201ENST00000373042 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.67■■■■■ 4.58
C1orf122-201ENST00000373042 PBRM1Q86U86 1689 aa43.67■■■■■ 4.58
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C1orf122-201ENST00000373042 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.3■■■■■ 4.52
C1orf122-201ENST00000373042 NUP160Q12769 1436 aa43.13■■■■■ 4.49
C1orf122-201ENST00000373042 CEP170Q5SW79 1584 aa43.07■■■■■ 4.48
C1orf122-201ENST00000373042 KIF27Q86VH2 1401 aa43.05■■■■■ 4.48
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C1orf122-201ENST00000373042 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.45
C1orf122-201ENST00000373042 SHROOM2Q13796 1616 aa42.82■■■■■ 4.44
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C1orf122-201ENST00000373042 JPH4Q96JJ6 628 aa42.75■■■■■ 4.43
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