RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463043.1

KLHL21-203, Transcript of kelch like family member 21, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene KLHL21, Length 667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL21-203ENST00000463043 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.15■■■■■ 7.38
KLHL21-203ENST00000463043 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.43■■■■■ 6.3
KLHL21-203ENST00000463043 ABCC9O60706 1549 aa53.65■■■■■ 6.18
KLHL21-203ENST00000463043 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.3■■■■■ 5.8
KLHL21-203ENST00000463043 NACADO15069 1562 aa51.21■■■■■ 5.79
KLHL21-203ENST00000463043 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.04■■■■■ 5.76
KLHL21-203ENST00000463043 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.92■■■■■ 5.74
KLHL21-203ENST00000463043 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.89■■■■■ 5.74
KLHL21-203ENST00000463043 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.61■■■■■ 5.69
KLHL21-203ENST00000463043 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.21■■■■■ 5.63
KLHL21-203ENST00000463043 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.14■■■■■ 5.62
KLHL21-203ENST00000463043 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.01■■■■■ 5.6
KLHL21-203ENST00000463043 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.81■■■■■ 5.56
KLHL21-203ENST00000463043 SCRIBQ14160 1630 aa49.64■■■■■ 5.54
KLHL21-203ENST00000463043 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.25■■■■■ 5.48
KLHL21-203ENST00000463043 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.47■■■■■ 5.35
KLHL21-203ENST00000463043 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.45■■■■■ 5.35
KLHL21-203ENST00000463043 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.28■■■■■ 5.32
KLHL21-203ENST00000463043 SMARCA4P51532 1647 aa47.48■■■■■ 5.19
KLHL21-203ENST00000463043 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.39■■■■■ 5.18
KLHL21-203ENST00000463043 NCAPD3P42695 1498 aa47.27■■■■■ 5.16
KLHL21-203ENST00000463043 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.27■■■■■ 5.16
KLHL21-203ENST00000463043 SMARCA2P51531 1590 aa47.19■■■■■ 5.14
KLHL21-203ENST00000463043 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.14■■■■■ 5.14
KLHL21-203ENST00000463043 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.05■■■■■ 5.12
KLHL21-203ENST00000463043 HMGXB3Q12766 1538 aa47.04■■■■■ 5.12
KLHL21-203ENST00000463043 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.86■■■■■ 5.09
KLHL21-203ENST00000463043 WIZO95785 1651 aa46.59■■■■■ 5.05
KLHL21-203ENST00000463043 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.54■■■■■ 5.04
KLHL21-203ENST00000463043 ERCC6Q03468 1493 aa46.27■■■■■ 5
KLHL21-203ENST00000463043 NESP48681 1621 aa46.19■■■■■ 4.98
KLHL21-203ENST00000463043 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.1■■■■■ 4.97
KLHL21-203ENST00000463043 CUX2O14529 1486 aa46.09■■■■■ 4.97
KLHL21-203ENST00000463043 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.04■■■■■ 4.96
KLHL21-203ENST00000463043 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.91■■■■■ 4.94
KLHL21-203ENST00000463043 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.87■■■■■ 4.93
KLHL21-203ENST00000463043 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.71■■■■■ 4.91
KLHL21-203ENST00000463043 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.62■■■■■ 4.89
KLHL21-203ENST00000463043 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.6■■■■■ 4.89
KLHL21-203ENST00000463043 CFTRP13569 1480 aa45.59■■■■■ 4.89
KLHL21-203ENST00000463043 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.56■■■■■ 4.88
KLHL21-203ENST00000463043 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.35■■■■■ 4.85
KLHL21-203ENST00000463043 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.29■■■■■ 4.84
KLHL21-203ENST00000463043 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.28■■■■■ 4.84
KLHL21-203ENST00000463043 PRDM2Q13029 1718 aa45.18■■■■■ 4.82
KLHL21-203ENST00000463043 WDR62O43379 1518 aa45.16■■■■■ 4.82
KLHL21-203ENST00000463043 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.15■■■■■ 4.82
KLHL21-203ENST00000463043 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.93■■■■■ 4.78
KLHL21-203ENST00000463043 TOPBP1Q92547 1522 aa44.61■■■■■ 4.73
KLHL21-203ENST00000463043 ABCC8Q09428 1581 aa44.56■■■■■ 4.72
KLHL21-203ENST00000463043 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.55■■■■■ 4.72
KLHL21-203ENST00000463043 IFT140Q96RY7 1462 aa44.36■■■■■ 4.69
KLHL21-203ENST00000463043 CUX1P39880 1505 aa44.24■■■■■ 4.67
KLHL21-203ENST00000463043 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.23■■■■■ 4.67
KLHL21-203ENST00000463043 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.19■■■■■ 4.67
KLHL21-203ENST00000463043 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.16■■■■■ 4.66
KLHL21-203ENST00000463043 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.09■■■■■ 4.65
KLHL21-203ENST00000463043 OSCARQ8IYS5 282 aa44.06■■■■■ 4.64
KLHL21-203ENST00000463043 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.03■■■■■ 4.64
KLHL21-203ENST00000463043 TRIM41Q8WV44 630 aa44.02■■■■■ 4.64
KLHL21-203ENST00000463043 SOGA1O94964 1423 aa44.01■■■■■ 4.64
KLHL21-203ENST00000463043 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
KLHL21-203ENST00000463043 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.91■■■■■ 4.622e-9■■■■■ 28.1
KLHL21-203ENST00000463043 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.86■■■■■ 4.619e-7■■■■■ 47.4
KLHL21-203ENST00000463043 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.8■■■■■ 4.6
KLHL21-203ENST00000463043 TOP2BQ02880 1626 aa43.79■■■■■ 4.6
KLHL21-203ENST00000463043 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.79■■■■■ 4.6
KLHL21-203ENST00000463043 SYNJ1O43426 1573 aa43.79■■■■■ 4.6
KLHL21-203ENST00000463043 WDR97A6NE52 1622 aa43.77■■■■■ 4.6
KLHL21-203ENST00000463043 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.67■■■■■ 4.58
KLHL21-203ENST00000463043 GRIN2BQ13224 1484 aa43.53■■■■■ 4.56
KLHL21-203ENST00000463043 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.51■■■■■ 4.56
KLHL21-203ENST00000463043 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.51■■■■■ 4.56
KLHL21-203ENST00000463043 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.51■■■■■ 4.56
KLHL21-203ENST00000463043 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.47■■■■■ 4.55
KLHL21-203ENST00000463043 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.47■■■■■ 4.55
KLHL21-203ENST00000463043 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.47■■■■■ 4.55
KLHL21-203ENST00000463043 CHD1O14646 1710 aa43.45■■■■■ 4.55
KLHL21-203ENST00000463043 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.45■■■■■ 4.55
KLHL21-203ENST00000463043 PBRM1Q86U86 1689 aa43.42■■■■■ 4.54
KLHL21-203ENST00000463043 FBLN2P98095 1184 aa43.36■■■■■ 4.53
KLHL21-203ENST00000463043 ARHGEF11O15085 1522 aa43.35■■■■■ 4.53
KLHL21-203ENST00000463043 SYNJ2O15056 1496 aa43.27■■■■■ 4.52
KLHL21-203ENST00000463043 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.22■■■■■ 4.51
KLHL21-203ENST00000463043 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.13■■■■■ 4.5
KLHL21-203ENST00000463043 ADAMTS12P58397 1594 aa43.11■■■■■ 4.49
KLHL21-203ENST00000463043 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.06■■■■■ 4.48
KLHL21-203ENST00000463043 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.03■■■■■ 4.48
KLHL21-203ENST00000463043 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.01■■■■■ 4.48
KLHL21-203ENST00000463043 GRIN2AQ12879 1464 aa42.98■■■■■ 4.47
KLHL21-203ENST00000463043 ARAP1Q96P48 1450 aa42.95■■■■■ 4.47
KLHL21-203ENST00000463043 KIF27Q86VH2 1401 aa42.94■■■■■ 4.46
KLHL21-203ENST00000463043 NUP160Q12769 1436 aa42.82■■■■■ 4.45
KLHL21-203ENST00000463043 IGF1RP08069 1367 aa42.81■■■■■ 4.44
KLHL21-203ENST00000463043 CEP170Q5SW79 1584 aa42.79■■■■■ 4.44
KLHL21-203ENST00000463043 CUL7Q14999 1698 aa42.69■■■■■ 4.42
KLHL21-203ENST00000463043 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.53■■■■■ 4.4
KLHL21-203ENST00000463043 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.53■■■■■ 4.4
KLHL21-203ENST00000463043 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.52■■■■■ 4.4
KLHL21-203ENST00000463043 SHROOM2Q13796 1616 aa42.51■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms